| 基于生物信息学的鸡PGC1-α基因5'调控区的序列结构分析 |
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| 引用本文： | 吴海锋,汤绮明,苏瑛,周松海,谭道杰,刘鸿,张丽,叶昌辉.基于生物信息学的鸡PGC1-α基因5''调控区的序列结构分析[J].广东农业科学,2012,39(23):142-145. |
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| 作者姓名： | 吴海锋 汤绮明 苏瑛 周松海 谭道杰 刘鸿 张丽 叶昌辉 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学农学院,广东湛江,524088 |
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| 基金项目： | 广东省大学生创新实验基金"鸡PGC1-α基因表达调控研究"，广东海洋大学大学生创新实验基金，广东省高等教育学会实验室管理专业委员会基金，广东海洋大学实验研究项目 |
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| 摘 要： | 利用BLAST、Neural Network Promoter Prediction、ORF Finder、CpG Island Searcher和TF SEARCH等在线软件预测鸡的PGC1-α基因的5’调控区的启动子、开放阅读框、CpG岛及转录因子结合位点。结果显示,鸡与其他物种的PGC1-α核苷酸序列同源性很高,达84%以上;PGC1-α基因5’调控区序列上启动子可能位于1 900 bp处;评分在85分以上时,该区域具有221个潜在的转录因子结合位点;有12个潜在的转录因子结合位点评分在95分以上;最大ORF位于1 411～1 617位核苷酸,共编码69个氨基酸;CpG岛为200 bp区间(1 900～2 100 bp)。
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| 关 键 词： | PGC1-α 5’调控区 鸡 生物信息学 |
Bioinformatics analysis on 5'UTR sequence properties of PGC1-α in chicken |
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| WU Hai-feng
,
TANG Qi-ming
,
SU Ying
,
ZHOU Song-hai
,
TAN Dao-jie
,
LIU Hong
,
ZHANG Li
,
YE Chang-hui.Bioinformatics analysis on 5'UTR sequence properties of PGC1-α in chicken[J].Guangdong Agricultural Sciences,2012,39(23):142-145. |
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| Authors: | WU Hai-feng TANG Qi-ming SU Ying ZHOU Song-hai TAN Dao-jie LIU Hong ZHANG Li YE Chang-hui |
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| Institution: | (Agriculture College of Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524088,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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