水稻WRKY80转录调节蛋白基因的分离与表达模式 |
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引用本文: | 彭喜旭,唐新科,周平兰,胡耀军,邓小波,王海华.水稻WRKY80转录调节蛋白基因的分离与表达模式[J].中国农业科学,2013,46(19):4035-4043. |
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作者姓名: | 彭喜旭 唐新科 周平兰 胡耀军 邓小波 王海华 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31301617,31171803)、国家公益性(农业)行业科研专项(nyhyzx3-16)、湖南省自然科学基金重点项目(10JJ2030) |
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摘 要: | 【目的】分离水稻WRKY80,分析其编码蛋白的序列结构特征,了解其在各器官中以及病原接种、激素处理下的表达模式,为阐明其生物学功能奠定基础。【方法】基于水稻基因组数据库注释的Loc_Os03g63810基因的编码序列设计特异引物,用RT-PCR法从茉莉酸甲酯(MeJA)处理的水稻叶片中克隆WRKY80 cDNA 序列,运用生物信息学手段对推定的蛋白和启动子序列进行分析,用Northern杂交或实时荧光定量PCR方法研究基因的表达模式。【结果】 获得了WRKY80 cDNA序列,长1 392 bp,包含1个长1 164 bp 的完整开放读码框,编码387个氨基酸。WRKY80具有1个典型的WRKY 保守结构域,锌指类型为C2H2,归类于WRKY 第Ⅱ组;C-端为酸性结构区,且含连续的6个谷氨酰胺和8个丝氨酸,提示具有转录激活活性;预测其定位于细胞核。WRKY80与玉米和高粱等单子叶植物WRKY 的氨基酸序列同一性较高。WRKY80在各器官中组成性表达,在叶、根和穗中表达丰度较高,花中次之,在茎和颖果中丰度较低,且表达具有发育阶段相关性,在成熟叶、根中的表达分别高于幼叶和幼根;受稻瘟病菌、纹枯病菌、MeJA和乙烯利诱导表达,而水杨酸对其表达无影响。其表达模式与启动子顺式元件预测分析的结果基本一致。【结论】WRKY80具有转录因子的结构特征,推测其可能通过茉莉酸/乙烯介导的信号途径参与水稻的防御反应,也可能参与发育调控。
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关 键 词: | WRKY转录因子 真菌病原 基因分离 基因表达模式 水稻 |
收稿时间: | 2013-04-10 |
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