鸡miR-181a组织的表达谱及其转录调控区域

【目的】分析鸡miR-181a的转录起始位点，并分析其在1日龄和成年鸡不同组织中的表达谱，以期为研究miR-181a的功能奠定基础。【方法】采用qPCR技术构建miR-181a 在1日龄和成年鸡肝脏、脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织中的表达谱。用version(1.83)分析miR-181a的保守性，并采用ENCODE数据库进行miR-181a转录起始位点和启动子区域的分析。【结果】①采用qPCR检测miR-181a在鸡下丘脑中的表达量和高通量测序的结果一致，1日龄下丘脑中的表达量显著低于成年鸡的表达量（P＜0.05）；②miR-181a 在11个组织中均有表达，且在1日龄和成年鸡脾脏、肺、小肠、大脑、小脑、下丘脑、脑干、胸腺、心脏和肾脏组织的表达量差异显著（P＜0.05），而在肝脏中表达量的差异不显著（P＞0.05）；③miR-181a的前体miR-181a-1上游区域有一个启动子区和一个潜在的转录起始位点；④miR-181a-1的转录调控区域内存在的多个转录因子，转录因子主要有NFKB,c-Fos等。【结论】鸡miR-181a的表达有组织和时序差异，其成熟序列在脊椎动物中十分保守，上游有一个转录起始位点及启动子区。