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猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达谱分析
引用本文:张兴举,唐中林,王志伟,杨述林,牟玉莲,崔文涛,马月辉,储明星,李奎.猪TAF7基因的克隆、染色体定位和组织表达谱分析[J].中国农业科学,2009,42(1):267-273.
作者姓名:张兴举  唐中林  王志伟  杨述林  牟玉莲  崔文涛  马月辉  储明星  李奎
作者单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/中国农业科学院家养动物遗传资源与种质创新重点开放实验室,北京,100193
基金项目:国家自然科学基金,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所家畜种质资源研究和创新科技创新团队资助项目 
摘    要: 【目的】通过对猪TAF7基因初步的研究,为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息,为猪的遗传育种提供分子标记。【方法】以五指山猪为研究对象,克隆TAF7基因,分析该基因结构特点,然后利用IMpRH(the INRA-University of Minnesota porcine radiation hybrid,法国农业科学院-明尼苏达大学的辐射杂种克隆板)分析该基因在猪染色体上定位信息,利用半定量RT-PCR方法,分析该基因在成年五指山猪16个不同组织(心脏、背肌、淋巴、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、子宫、睾丸、胃、小肠、大肠、卵巢、胸腺、脑、脂肪)的表达谱信息。【结果】克隆得到长1 701 bp的五指山猪TAF7基因序列,其中包括1 050 bp完整CDS(Coding Sequence,编码序列)区域,分析表明其编码含349个氨基酸的蛋白质。利用IMpRH分析结果表明,猪TAF7基因与分子标记SW1879和IL4(interleukin-4,白细胞介素-4)紧密连锁,LOD(Limit of Detection,检测极限)值分别为6.69和6.15。组织表达谱分析结果显示该基因在大多数组织中均有表达,其中在睾丸表达量较高,而在心脏、背肌中表达很低。【结论】猪TAF7基因5’UTR中有一个短的内含子,而在该基因CDS区域没有内含子。猪TAF7蛋白序列与人TAF7蛋白序列的相似性较高,二者在生物系统发育树中的距离最接近。猪TAF7基因在大多数组织中均表达,在猪睾丸中表达量较高,证实它调节目的基因转录具有广泛性。

关 键 词:猪TAF7基因  克隆  基因定位  组织表达谱
收稿时间:2008-2-28

Cloning, Mapping and Tissue Expression Profile of Porcine TAF7 Gene
ZHANG Xing-ju,TANG Zhong-lin,WANG Zhi-wei,YANG Shu-lin,MU Yu-lian,CUI Wen-tao,MA Yue-hui,CHU Ming-xing,LI Kui.Cloning, Mapping and Tissue Expression Profile of Porcine TAF7 Gene[J].Scientia Agricultura Sinica,2009,42(1):267-273.
Authors:ZHANG Xing-ju  TANG Zhong-lin  WANG Zhi-wei  YANG Shu-lin  MU Yu-lian  CUI Wen-tao  MA Yue-hui  CHU Ming-xing  LI Kui
Institution:The Key Laboratory of Domestic Animal Genetic Resources and Germplasm Innovation of CAAS, Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences
Abstract:
Keywords:porcine TAF7 gene  cloning  mapping  expression profile
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