小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析 |
| |
引用本文: | 吴珂妍,千慧敏,赵俊溢,李闯,路亚南,邢国珍,刘娜,郑文明.小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析[J].中国农业大学学报,2024(4):113-127. |
| |
作者姓名: | 吴珂妍 千慧敏 赵俊溢 李闯 路亚南 邢国珍 刘娜 郑文明 |
| |
作者单位: | 1.河南农业大学 生命科学学院,郑州 450002;2.省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室,郑州 450002 |
| |
基金项目: | 国家重点研发计划(2021YFD1401000); 河南省重大科技专项(221100110100); 河南农业大学拔尖人才项目(30500924) |
| |
摘 要: | 为挖掘小麦锈菌侵染过程中发挥关键作用的植物细胞壁降解酶(Plant cell wall-degrading enzymes, PCWDEs)基因,通过生物信息学方法对小麦3种锈菌(叶锈菌、条锈菌和秆锈菌)基因组中的碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes, CAZymes)进行预测分析,在此基础上对其中的PCWDEs基因家族进行全基因组范围的筛选鉴定,并利用qRT-PCR方法对叶锈菌PCWDEs家族成员在侵染过程中的转录水平进行了检测分析。结果表明:1)小麦叶锈菌、条锈菌和秆锈菌基因组分别编码355、322和345个CAZymes家族成员基因以及160、153和158个PCWDEs基因;小麦3种锈菌共含75个保守CAZymes基因亚家族和94个PCWDEs直系同源基因簇。2)16个叶锈菌特异性PCWDEs基因在亲和(Pt15-‘中国春’)/非亲和(Pt15-‘云麦34’)互作过程中均受到不同程度的诱导表达,但非亲和互作中在侵染更早期就已受到诱导上调表达。3)叶锈菌特异性PCWDEs基因簇中有4个PCWDEs被鉴定为类扩展蛋白,其在侵染过程中受到诱导表达,说明类扩展蛋白可能在降解纤维素突破侵染屏障中发挥重要作用。综上,在小麦3种锈菌全基因组范围鉴定了PCWDEs基因,初步明确部分基因在锈菌侵染过程中的表达模式,PCWDEs可能在小麦锈菌致病过程中发挥重要作用。
|
关 键 词: | 小麦锈菌 PCWDEs 生物信息学分析 qRT-PCR 侵染机制 |
收稿时间: | 2023/11/13 0:00:00 |
Identification and expression analysis of PCWDEs family genes in three wheat rust fungi |
| |
Institution: | 1.College of Life Sciences, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;2.State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop,Zhengzhou 450002, China |
| |
Abstract: | |
| |
Keywords: | wheat rust fungi PCWDEs bioinformatics qRT-PCR pathogenic mechanism |
|
| 点击此处可从《中国农业大学学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国农业大学学报》下载免费的PDF全文 |