| 牡蛎中GⅡ型诺如病毒巢式RT-PCR检测方法的优化与评价 |
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| 引用本文： | 贾添慧,董蕾,王永杰,喻勇新.牡蛎中GⅡ型诺如病毒巢式RT-PCR检测方法的优化与评价[J].上海海洋大学学报,2021,30(2):239-246. |
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| 作者姓名： | 贾添慧 董蕾 王永杰 喻勇新 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学,上海海洋大学 食品学院,上海海洋大学 食品学院,上海海洋大学 食品学院 |
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| 基金项目： | “十三五”国家重点研发计划重点专项(2017YFC1600703)；国家自然科学(31601570) |
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| 摘 要： | 为了解决目前巢式PCR法检测牡蛎样品中GII型诺如病毒时存在的非特异性扩增、假阴性等问题,本研究对NCBI数据库中在线获得的所有GII型诺如病毒序列进行系统分析,重新设计出针对GII型诺如病毒检测的通用型巢式PCR引物(NG2OF/NG2OR),并从基因型覆盖度、特异性、灵敏度和实际样品检测的稳定性几个方面对新设计的引物进行评估。结果显示：(1)新引物的特异性好,只对GII型诺如病毒进行有效扩增,且不受牡蛎样品本底的影响。(2)新引物灵敏度高,最低可检测至26.4个拷贝。(3)在对92个牡蛎样品进行检测时,新引物的阳性检出率为28.3%,比经典引物高出7.5%。因此,新建立的GII型诺如病毒巢式PCR检测方法在检测牡蛎样品时特异性更强,灵敏度更高,为牡蛎中诺如病毒的检测提供了一种新的、可靠的技术手段。
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| 关 键 词： | 牡蛎 GII型诺如病毒 巢式PCR 特异性 阳性率 |
| 收稿时间： | 2020/3/2 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/4/16 0:00:00 |
Updating and evaluation of nested PCR for specific detection of genogroup II norovirus in oysters |
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| JIA Tianhui,DONG Lei,WANG Yongjie,YU Yongxin.Updating and evaluation of nested PCR for specific detection of genogroup II norovirus in oysters[J].Journal of Shanghai Ocean University,2021,30(2):239-246. |
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| Authors: | JIA Tianhui DONG Lei WANG Yongjie YU Yongxin |
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| Institution: | Shanghai Ocean University,College of Food Science Technology,Shanghai Ocean University,College of Food Science Technology,Shanghai Ocean University,College of Food Science Technology,Shanghai Ocean University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oysters Genogroup II norovirus nested PCR specificity positive rate |
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