| 干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析 |
| |
| 引用本文： | 罗海斌,曹辉庆,魏源文,邓智年,潘有强,郭元元,何海波,李杨瑞.干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析[J].南方农业学报,2012,43(6):733-737. |
| |
| 作者姓名： | 罗海斌 曹辉庆 魏源文 邓智年 潘有强 郭元元 何海波 李杨瑞 |
| |
| 作者单位： | 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室;农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室; |
| |
| 基金项目： | 广西自然科学基金创新研究团队项目（2011GXNSFF018002）；广西科学研究与技术开发计划项目（桂科攻10100005-9）；广西科学基金项目（桂科基0778006-6，桂科基0832026，2010GXNSFA013102）；广西科学基金项目应用基础研究专项项目（桂科基0991021）；广西农业科学院基本科研业务专项项目［200803Z（基），200902Z（基）］；广西农业科学院科技发展基金项目（2007023）；广西重点实验室建设项目（12-071-09） |
| |
| 摘 要： | 【目的】构建甘蔗根系全长cDNA文库，并进行测序，为分离克隆甘蔗抗旱候选基因奠定基础。【方法】在干旱胁迫条件下，以新台糖22号甘蔗根系为材料，采用SMART技术构建cDNA文库，并进行EST序列分析。【结果】文库构建质量鉴定结果显示，文库库容量为1.0×106 PFU/mL，重组率约95%，文库插入片段长度在 500～2000 bp，平均长度约1102.1 bp。挑选526个阳性克隆进行单向测序后，共获得 523个ESTs序列，去除载体、接头序列以及长度低于100 bp的序列后，进行聚类分析并组装，共得到468个Uni-ESTs，其中congtig 29个，singlets 439个，分别占总数的6.5%和93.5％。通过与NCBI非冗余蛋白库进行BLASTX比对，发现444个Uni-ESTs在GenBank有同源序列，占94.87%；获得24个未知蛋白功能基因，占5.13%。【结论】构建了干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库，获得523个ESTs序列和468个Uni-ESTs，并获得一批新的未知蛋白功能基因。
|
| 关 键 词： | cDNA文库 甘蔗 根系 表达序列标签 测序 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《南方农业学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《南方农业学报》下载免费的PDF全文 |
