基于简化基因组测序技术的番茄雄性不育基因定位 |
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引用本文: | 王柏柯,李 宁,唐亚萍,等.基于简化基因组测序技术的番茄雄性不育基因定位[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2017,45(6):177-184. |
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作者姓名: | 王柏柯 李 宁 唐亚萍 等 |
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作者单位: | 新疆农业大学 林学与园艺学院;新疆农业科学院 园艺作物研究所,新疆农业科学院 园艺作物研究所,新疆农业科学院 园艺作物研究所 |
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基金项目: | 公益性行业(农业)科研专项(201303115);大宗蔬菜产业技术体系乌鲁木齐试验站项目(CARS-25-G-51);新疆维吾尔自治区园艺学重点学科基金项目(2016-10758-3) |
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摘 要: | 【目的】获得番茄雄性不育基因的候选基因,提高番茄雄性不育基因定位的准确性,为该雄性不育基因的克隆及功能机制研究提供理论基础。【方法】以一个与苗期绿茎基因紧密连锁的花粉败育型材料为母本,以一个苗期紫茎可育系为父本,通过集群分离(BSA)法分别建立30个F2单株的不育和可育DNA池,基于简化基因组测序(SLAF-Seq)技术检测足够量的简化基因组扩增片段,通过关联分析,获得目标雄性不育基因的候选区域,并利用GO数据库对关联区域内的基因进行功能注释。【结果】通过SLAF测序共获得20.27 Mb的序列量;共获得103 250个SLAF标签,标签整体平均深度达160.39倍;完成了2个混合池间SLAF标签标记的多态性分析,共获得多态性标记6 892个;利用2个混合池进行关联分析,共得到8个与目标雄性不育基因相关的候选区域,区域平均大小为0.29Mb,区域内共有27个差异标记,146个候选基因。【结论】利用SLAF测序技术对番茄雄性不育基因进行了初步定位。
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关 键 词: | 番茄 雄性不育 简化基因组测序 基因定位 |
收稿时间: | 2016/3/25 0:00:00 |
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