基于转录组测序金丝草叶片响应铅胁迫的抗氧化酶相关基因

为了深入揭示植物抗氧化酶的相关基因及其响应重金属胁迫的作用机制，以重金属铅（Pb）超富集植物金丝草Pogonatherum crinitum（Thunb.）Kunth.]为研究对象，设置Pb浓度0、300、500、1 000 mg·L^-1和2 000 mg·L^-1的水培模拟胁迫试验，测定不同Pb浓度下金丝草叶片的抗氧化酶活性，并对Pb胁迫处理的金丝草叶片进行RNA-Seq测序，将转录组测序得到的Unigenes通过GO与KEGG富集注释，筛选出叶片抗氧化酶相关的DEGs，并利用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）进行验证。结果表明：随Pb胁迫浓度的增加，金丝草叶片过氧化物酶（POD）、超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶（CAT）活性呈增加趋势，丙二醛（MDA）含量则呈先增加后降低的趋势；转录组测序得到总碱基数为56.34 Gb，各样品碱基质量达到Q20、Q30水平的均大于90%，测序结果可靠；筛选出的DEGs通过GO与KEGG数据库进行对比注释发现，金丝草叶片DEGs在“过氧化物酶体”“氧化还原酶活性”“氧化还原酶活性，作用于CH-OH供体组”“活性氧代谢过程”和“过氧化氢代谢过程”等与抗氧化相关的GO功能条目上显著富集，在“谷胱甘肽代谢”“抗坏血酸和醛糖代谢”“植物激素信号转导”“黄酮类生物合成”和“MAPK信号通路-植物”等与抗氧化相关的KEGG通路上显著富集； Pb胁迫下金丝草叶片抗氧化酶相关基因PcSOD、PcPOD和PcCAT上调表达，qRT-PCR验证结果与转录组测序结果一致，Pb胁迫下这些基因的相对表达量与抗氧化酶活性的变化趋势一致。研究表明，金丝草可通过提高抗氧化酶活性来适应Pb胁迫，抗氧化酶相关基因PcSOD、PcPOD和PcCAT参与了金丝草应对Pb胁迫的调控过程。

Antioxidant enzyme-related genes of Pogonatherum crinitum leaves in response to lead stress based on RNA-Seq