| 文心兰miR168分子进化特性及其对软腐病侵染的响应模式 |
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| 引用本文： | 林争春,赖钟雄,吴秋桢,等.文心兰miR168分子进化特性及其对软腐病侵染的响应模式[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2023,51(8):115-130. |
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| 作者姓名： | 林争春 赖钟雄 吴秋桢 等 |
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| 作者单位： | 福建农林大学 园艺植物生物工程研究所 |
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| 基金项目： | 福建省重大农业科技专项（2015NZ0002-1）；福建农林大学科技创新基金项目（CXZX2019037S，KF2015108） |
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| 摘 要： | 【目的】探究文心兰miR168的分子进化特性，揭示文心兰miR168a及其候选靶基因响应软腐病菌侵染的表达模式。【方法】以文心兰miRNA文库、转录组数据库及miRbase数据库获取的植物miR168前体和成熟体序列为研究对象，利用生物信息学方法对其进行系统进化树构建、保守性分析、前体二级结构分析及靶基因预测；通过PCR技术克隆文心兰miR168a前体，采用qRT-PCR技术分析miR168a及其候选靶基因在文心兰不同组织（根、叶、假鳞茎）和感染软腐病（0，12，24，36和48 h）不同时间的表达模式。【结果】植物miR168序列保守性较高，来源于miR168前体的5p臂保守性高于3p臂，miR168前体分歧较大，茎序列的保守性高于环序列；从文心兰中克隆得到93 bp miR168a前体序列，包含21 nt miR168a成熟体序列。进化分析表明，物种亲缘关系对其前体和成熟体序列的形成影响较小；二级结构显示，文心兰miR168a前体能形成典型的发卡结构，其成熟体位于前体的5p臂；随着软腐病侵染时间延长，文心兰miR168a与其候选靶标RNA剪切复合体核心蛋白（AGO1）、RPM1互作蛋白（RIN4）、羧酸酯酶（CXE8）的表达趋势基本呈负相关，而与其候选靶标RNA解旋酶（PRH47A）、泛素羧基末端水解酶（UCH）的表达趋势呈正相关，说明可能存在其他miR168家族成员或miRNAs同时调控。【结论】文心兰miR168与其他植物miR168进化上兼具保守性和特异性，miR168a上调表达可能会增强文心兰的抗病性。
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| 关 键 词： | 文心兰 miR168 进化特征 软腐病 候选靶标基因 |
| 收稿时间： | 2022/10/9 0:00:00 |
Molecular evolutionary characteristics of miR168 and its response patterns to soft rot infection in Oncidium hybridum |
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| LIN Zhengchun,LAI Zhongxiong,WU Qiuzhen,et al.Molecular evolutionary characteristics of miR168 and its response patterns to soft rot infection in Oncidium hybridum[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2023,51(8):115-130. |
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| Authors: | LIN Zhengchun LAI Zhongxiong WU Qiuzhen |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oncidium hybridum miR168 evolutionary characteristics soft rot predict target gene |
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