| 基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析 |
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| 引用本文： | 张艳俊,杨毅清,袁心悦,王海燕,刘大群.基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析[J].河北农业大学学报,2020,43(1):11-16. |
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| 作者姓名： | 张艳俊 杨毅清 袁心悦 王海燕 刘大群 |
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| 作者单位： | 河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北保定 071001,河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北保定 071001,河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北保定 071001,河北农业大学 植物保护学院/河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心/国家北方山区农业工程技术研究中心,河北保定 071001,中国农业科学院 研究生院,北京 100081 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;河北省高等学校科学技术研究项目 |
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| 摘 要： | 为了探明小麦‘TcLr19’抵抗小麦叶锈菌侵染的内在分子机制,挖掘与抗叶锈菌密切相关的功能基因,对接种叶锈菌后的小麦材料‘TcLr19’进行Illumina NextSeq500转录组测序。筛选到差异表达的基因(Differential expressiongenes,DEGs)8970个,其中上调差异表达基因4953个,下调差异表达基因4017个。差异基因通过GO(Gene Ontology)功能分类和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes)Pathway富集分析,被归于1 790个GO类别,定位到84个代谢通路中。采用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)对转录组分析结果进行验证,结果表明,qRT-PCR与RNA-seq分析结果基本一致,为小麦TcLr19抗小麦叶锈菌新基因的挖掘提供了可靠的参考资料。
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| 关 键 词： | 差异基因 GO富集 KEGG数据库 qRT-PCR |
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