陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 陈义珍,李浩,傅明川,王立国,刘任重,柳展基.陆地棉膜结合脂肪酸去饱和酶基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J].山东农业科学,2023(4):11-23. |
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作者姓名: | 陈义珍 李浩 傅明川 王立国 刘任重 柳展基 |
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作者单位: | 农业部黄淮海棉花遗传改良与栽培生理重点实验室/山东省农业科学院经济作物研究所 |
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基金项目: | 山东省农业良种工程项目(2020LZGC002);;国家自然科学基金项目(31901422); |
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摘 要: | 膜结合脂肪酸去饱和酶(fatty acid desaturase, FAD)是生物合成不饱和脂肪酸的关键酶。本研究以陆地棉基因组数据为基础,利用生物信息学方法对棉花FAD基因家族进行全基因组鉴定和进化分析。结果表明,陆地棉基因组中共含有37个FAD基因,进化分析发现这些基因分为4个亚家族,各亚家族成员数量不一,但相同亚家族成员含有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现28对复制基因全为片段复制基因,且都经历了严格的纯化选择作用。此外,在陆地棉FAD基因的启动子区域,发现了丰富的响应植物激素信号和逆境胁迫的顺式作用元件。转录组分析表明,陆地棉FAD基因家族响应干旱和盐胁迫,定量PCR分析表明施加外源褪黑素显著影响了FAD基因的表达。本研究结果为进一步解析FAD家族基因的功能奠定了基础。
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关 键 词: | 陆地棉 膜结合脂肪酸去饱和酶 全基因组鉴定 生物信息学分析 基因表达 干旱和盐胁迫 褪黑素 |
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