马铃薯StUOXs基因家族的生物信息学分析

马铃薯(Solanum tuberosum)是世界第三大粮食作物,其产量和品质受到生物与非生物胁迫的影响。泛醌氧化酶(ubiquinol oxidase,UOX)是一种由核基因编码的线粒体末端氧化酶,在植物生长发育及胁迫应答中发挥重要作用。为了解StUOXs在马铃薯抗病过程中发挥的应答反应,利用生物信息学方法在马铃薯基因组中鉴定出5个StUOXs基因,对其理化性质、染色体定位、三级结构、进化关系、保守结构域、启动子元件和表达谱尤其是受青枯菌(Ralstonia solanacearum)诱导的表达模式进行了分析。结果表明:马铃薯StUOXs基因编码的氨基酸数在279~366,相对分子质量为31~42 ku,亚细胞定位在线粒体中;系统进化分析发现,马铃薯StUOXs成员与番茄、辣椒的UOXs成员的亲缘关系最近,较之拟南芥、烟草亲缘关系稍远;FPKM数据分析发现,StUOXs主要受盐、激素和生物胁迫诱导而在叶片中表达,这与其启动子中的存在的激素应答等顺式作用元件相对应。青枯菌接种后的qRT-PCR实验表明,StUOX4参与马铃薯青枯病的早期应答反应。     

Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较

 Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用。为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分别进行了RNA提取、Illumina HiSeq 2000高通量转录组测序、差异表达基因(DEGs)的显著富集分析;选择菌丝和孢子中的DEGs 进行实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR, qRT-PCR)验证。GO通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中的醇脱氢酶(NADP⁺)、孢子中的CAMK / CAMKL / CHK 1蛋白激酶均显著上调;KEGG通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中与 MAPK信号通路相关的基因、孢子中与PLD信号通路相关的基因均显著下调;另外,相对于野生型菌株,编码AGO2的基因下调,但是下调不显著。qRT-PCR检测DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性。     

长白山红松阔叶林鸟类多样性季节格局的初步研究

采用时间序列分析方法,研究了长白山红松阔叶林鸟类多样性的季节格局。结果表明Shan non多样性指数季节格局表现为春秋高、冬夏低的双峰型特点,并与物种、数量和优势度之间有极显著的相关关系;群落各指数季节间的显著差异主要表现在冬季与其他各季之间;各月前两个优势种的比例在多样性格局构成中具有非常重要的作用;5月前和9月后,气温对Shannon指数格局的影响极为显著(r=0 9209,P<0 01)。     

Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较

 Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用。为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分别进行了RNA提取、Illumina HiSeq 2000高通量转录组测序、差异表达基因(DEGs)的显著富集分析;选择菌丝和孢子中的DEGs 进行实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR, qRT-PCR)验证。GO通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中的醇脱氢酶(NADP⁺)、孢子中的CAMK / CAMKL / CHK 1蛋白激酶均显著上调;KEGG通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中与 MAPK信号通路相关的基因、孢子中与PLD信号通路相关的基因均显著下调;另外,相对于野生型菌株,编码AGO2的基因下调,但是下调不显著。qRT-PCR检测DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性。     

植物与尖孢镰刀菌的互作机制研究现状

为了能够更全面地揭示植物与尖孢镰刀菌的互作机制,本文全面系统地总结了尖孢镰刀菌对植物的致病机制,植物对尖孢镰刀菌的抗病机制以及植物与尖孢镰刀菌之间的互作机制,认为尖孢镰刀菌与植物之间主要通过小RNA水平、基因水平、蛋白质与化合物水平三方面进行互作。而在基因组学、蛋白质组学等方法的基础上,进一步结合小RNA分析也将是今后研究尖孢镰刀菌与植物互作机制的主要研究手段。     

加硫尿素对小白菜产量和品质的影响

通过盆栽试验,研究加硫尿素(US1、US2)对小白菜产量和品质的影响。结果表明:加硫尿素的施用促进小白菜营养生长,提高作物产量与产量性状,使小白菜产量提高了42.11%和47.37%,株高增加了16.46%、16.96%,叶长提高了37.83%和36.49%;施用加硫尿素使小白菜Vc含量提高了4.7%、5.0%,并且有效降低了小白菜硝酸盐含量,改善了作物品质;施用加硫尿素,氮素表观利用率为普通尿素的1.57倍。     

荆条种子无菌萌发过程中污染菌的分离鉴定及抑菌剂筛选

荆条具有生态、观赏、药用及实用等方面的价值，但在荆条快速繁殖体系的建立中发现，种子在无菌萌发过程中污染率极高，达50%～75%。为降低荆条种子无菌萌发过程中的污染率，试验通过鉴定其主要污染菌株，筛选出有效抑菌剂，并利用组织分离法对污染菌进行分离和纯化；同时，通过光学显微镜和扫描电镜对污染菌的分生孢子进行细胞学观察，然后采用真菌rDNA基因的ITS序列通用引物进行分子生物学鉴定，最后选择百菌清、代森锰锌、多菌灵、氟吗锰锌4种杀菌剂添加到PDA培养基中进行抑菌效果分析。结果表明，主要污染菌为种子表面附着的真菌，菌落呈绒状黄绿色同心圆形，菌丝为有隔褐色分支状菌，分生孢子为橄榄棕色、有隔、梭型；细胞学和分子生物学鉴定表明，该污染菌为链格孢菌。抑菌研究结果发现，60%氟吗锰锌对链铬孢菌的抑制效果最佳，菌落直径最小。将60%氟吗锰锌稀释1 400倍添加到荆条种子无菌萌发培养基（水琼脂培养基）中，污染率明显下降到5.5%。荆条种子无菌萌发中主要污染菌为链格孢菌，60%氟吗锰锌对其抑制效果最佳。