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1.
2.
为了明确青稞与燕麦镰孢菌在转录水平上的互作,以抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号为材料,以Illumina HiSeq Xten为平台,对抗感病青稞在接菌前、接菌20d和40d后茎基部的转录组进行测序。结果表明:经过测序质量控制,抗感病青稞茎基部共得到112.97Gb Clean Data。DEGs基因表达注释共获得差异表达基因4 280个,其中,上调基因2 037个,下调基因2 243个。通过BLAST软件与COG、GO、KEGG、KOG、NCBI-NR、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG数据库进行比对,28 869条Unigene获得注释信息,NCBI-NR数据库注释到的Unigene数量最多达到3 981条,占全部注释基因的13.79%。差异表达基因的KEGG通路富集Q-value≤0.05主要有5条,分别为苯丙氨酸代谢、异喹啉类生物碱的生物合成、酪氨酸代谢、苯丙基类生物合成和光合作用天线蛋白。抗病青稞NQK-01-03和感病青稞甘青2号之间GO注释系统包含生物学过程、细胞组分和分子功能3个主要分支。eggNOG和NCBI-NR注释的新基因数目最多分别达到1 833和2 396个,所占比例分别为59.22%和77.42%。 相似文献
3.
禽多杀性巴氏杆菌C48-1成熟外膜蛋白H基因原核表达最适条件的探索 总被引:1,自引:0,他引:1
应用PCR扩增出禽多杀性巴氏杆菌C州成熟外膜蛋白H基因(ompm H),将ompm H片段按正确的阅读框定向插入原核表达载体pGEX-6P-1中谷胱甘肽转移酶(GST)基因的下游,获得了重组表达质粒pGEX-ompm H。然后将重组质粒转化大肠埃希氏菌BL21(DE3),当转化菌的D600nm值达到0.6~0.8时,对异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)的诱导浓度、诱导时间和诱导温度等条件进行了试验,根据聚丙烯酰胺凝胶电泳判定融合蛋白GST-ompm H表达的最适条件。结果,当细菌的D600nm值为0.6~0.8时,IPTG最佳诱导浓度为0.8mmol/L,最佳诱导时间为4h,最适诱导温度为25℃。并用免疫印迹法对表达产物进行检测。结果显示表达的融合蛋白GST-ompm H能与C48-1外膜蛋白免疫血清发生特异性反应,证明pGEX-6p-1载体表达的融合蛋白保留了天然蛋白的抗原性。 相似文献
4.
鸡白介素18基因原核表达质粒构建 总被引:7,自引:0,他引:7
根据已发表的江西土鸡白介素 -1 8(Ch IL-1 8) c DNA编码基因序列设计引物 ,用PCR技术从 p MDCh IL-1 8质粒扩增出编码鸡IL-1 8成熟蛋白基因 ,重组于 p BV2 2 0表达载体上 ,将重组质粒转化大肠杆菌 JM1 0 9(DE3 ) ,转化子经温度诱导的表达产物 ,SDS-PAGE电泳鉴定约 2万 ,N端开头 1 5个氨基酸序列测定分析 ,证明获得了鸡 IL-1 8成熟蛋白 ,为今后深入研究鸡 IL -1 8的生物学特性及其临床应用打下了基础 相似文献
5.
6.
7.
禽大肠杆菌外膜蛋白基因C(ompC)的序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
根据 Gen Bank中人源大肠杆菌 K- 12外膜蛋白基因 C(omp C)的核苷酸序列设计引物 ,应用 PCR方法从禽大肠杆菌 O2 、O78株及它们的融合双价弱毒菌株 O2 ,78(Norr Chlr)中分别扩增得到 omp C基因 ,序列测定及分析比较发现 ,3个菌株的 om p C基因均由 170 2 nt组成 ,核苷酸序列完全相同 ,只有 1个大的开放性阅读框 (ORF) ,长 10 92 bp,编码由 36 3个氨基酸组成的前 Om p C蛋白 ,前 2 1个氨基酸残基组成信号肽 ,成熟的 Omp C蛋白由 342个氨基酸残基组成 ,Mr为 4 0 0 0 0。其氨基酸序列也完全相同。从基因水平上证明了禽大肠杆菌 O2 、O78株及融合双价弱毒菌株 O2 ,78(NorrChlr)存在相同的外膜蛋白 C抗原 ,从而为进一步研究 Omp C蛋白的免疫原性奠定了基础 相似文献
8.
凤尾菇营养缺陷型的诱变筛选及交配型基因测定 总被引:2,自引:0,他引:2
食用菌原生质体融合育种工作中,带有营养缺陷型突变基因的单核体常被用作融合亲本,以便检出融合子和进行融合子的遗传分析。本实验使用了紫外线诱变担孢子的方法,方便而易于操作,筛选出几株遗传特性稳定的营养缺陷型菌株,同时对它们的交配型基因进行了测定,发现了风尾菇交配型基因中的中性不亲和因子。 1材料和方法 1.1供试菌株 凤尾菇PL27(Pleurotus sajor-caju),野生型双核体;P23,P36,P22和P27是从PL27的单核体,它们的交配型基因分别确定为A1B1,A2B2,A2B1和A1B2。以上菌株均引自香港中文大学生物系。 相似文献
9.
为筛选出防治梨黑斑病的高效低毒杀菌剂,采用菌丝生长速率法测定了 11种杀菌剂对梨树黑斑病菌的毒力。结果表明:40%氟硅唑乳油对梨树黑斑病菌丝的毒力最强,EC50 值最低,为0.401 6 μg/mL;其次是10%苯醚甲环唑乳油、20%丙环唑乳油、25%戊唑醇乳油,EC50 值分别为1.478 0、2.018 5、4.101 0 μg/mL;1.5%噻霉酮乳油和75%百菌清可湿性粉对菌丝的抑制效果相对较差,EC50较高,分别为886.52、759.468 μg/mL。11种杀菌剂对梨树黑斑病菌菌丝生长均有抑制作用。 相似文献
10.
甘肃省梨树主要病虫害调查初报 总被引:2,自引:2,他引:0
为了明确甘肃省梨树病虫害种类、危害部位、地理分布和危害程度,2011—2014年对全省不同地区梨园定点、定期进行了系统调查。结果表明,甘肃省梨主产区危害梨树的病害共11种,真菌、细菌和生理性病害的比例为10∶0∶1,以真菌性病害为主。危害部位有枝干、叶片、果实和新梢。偏重发生的病害主要有白粉病、腐烂病、黑斑病、锈病和黄化病。除白粉病和腐烂病在全省6个产区均发生外,其他病害在各产区分布不均匀,发生地区各有差异。虫害共调查到6目16科20种,危害部位有叶片、果实、新梢和枝条。属偏重发生的虫害主要有梨小食心虫、梨木虱、梨茎蜂和大青叶蝉。除梨小食心虫、梨茎蜂、梨木虱和苹果全爪螨4种在全省6个产区均发生外,其他虫害在各产区分布有差异。 相似文献