一个新的水稻亚精胺合成酶基因克隆、表达及特性分析

在亚精胺生物合成中,亚精胺合成酶负责从S-腺苷甲硫氨酸到腐胺过程中催化转移丙胺,其在生物生长发育中发挥重要作用.本研究利用3末端cDNA快速扩增技术从水稻中获得一个新的亚精胺合成酶基因,命名为OsSPDS3.OsSPDS3包含一个1194bp的开放阅读框,该阅读框编码397个氨基酸.结构域预测结果表明亚精胺合成酶含有一个完整的精胺合成酶结构域,2个推测的低复杂性区段和多个S-腺苷甲硫氨酸结合位点.三维结构预测显示OsSPDS3含有α螺旋,β折叠和卷曲结构.进化分析表明OsSPDS3属于植物类亚精胺合成酶基因家族,与拟南芥亚精胺合成酶3和水稻亚精胺合成酶2划分为一个亚类.盐处理能显著上调OsSPDS3表达,但水稻亚精胺合成酶1和2对盐处理没有响应.此外,干旱和低温处理都不能改变3个水稻亚精胺合成酶基因表达,以上结果暗示OsSPDS3可能在水稻盐反应中发挥独特作用.     

橡胶树 EST-SSR标记开发及特性研究

为进一步开发橡胶树 EST-SSR标记,该研究下载并组装了来自 NCBI和马来西亚橡胶树 EST数据库 EST序列。在3733个组装的橡胶树单一基因中共鉴定到566个潜在的 SSR位点,平均3.96 kb会出现一个 SSR位点。二核苷酸重复为最丰富的 SSR重复类型,接下来是三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复。SSR位点重复单元数目最多的是5,接下来是12、6和7。在该研究中鉴定的51种类型 SSR模体中,二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复分别有6、26、5、3和11种。 GA/CT二核苷酸数目最多,接下来是 TC/AG、AT/TA、CTT/GAA、TTC/AAG和 TCT/AGA。在158个新开发的橡胶树EST-SSR 标记中,99个可在橡胶树品种RRIM600中产生清晰扩增条带。该研究开发的 EST-SSR标记丰富了橡胶树分子标记数量,必将在橡胶树 DNA指纹图谱、遗传多样性、标记辅助选择、遗传图谱等方面得到广泛应用。