厚壁菌门细菌及其祖先蛋白的氨基酸偏好性研究

从KEGG数据库中获得厚壁菌门下的18种细菌的蛋白质和氨基酸序列,运用生物信息学方法重建了这18个物种的发育树以及祖先的氨基酸序列,得到了18个现存物种及其祖先物种的氨基酸组成偏好情况。结果表明,现存物种的蛋白质的氨基酸组成有偏好,而在祖先蛋白质中也存在着氨基酸偏好的现象。对于每一种氨基酸,各物种的使用偏好不完全相同。研究结果为今后透彻地研究厚壁菌门细菌打下了基础。     

冷暖型小麦基因差异的最佳RAPD反应体系研究

为了建立小麦RAPD反应的最佳体系,保证反应结果的稳定性和可靠性,寻找小麦冷暖型基因差异,降低试验成本,在相同PCR扩增程序(94℃预变性5 min,94℃变性45 s,38℃退火1 min,72℃延伸1.5 min,40个循环,72℃延伸10 min,4℃保存)下,对冷暖型小麦基因组DNA的RAPD扩增体系各参数进行比较筛选,创建其最佳反应体系为:25μl反应体系中,模板DNA 20 ng,10×PCR缓冲液2.5μl,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq酶1 U,Mg2+浓度为2.0 mmol/L,ddH2O 12μl,随机引物10 ng。     

土壤含水率测定的误差分析及控制

土壤湿度空间变异性和样本容量决定了其测定的误差范围和精度。通过样本容量各为１５的各层次土壤含水率的统计分析，得到了１ｍ土层各层次的土壤含水率的变异特征。找出了样本容量与测试精度要求及统计特征值的关系。指出，过少的样本容量无法达到研究所需的精度要求。一般最少要５￣８个以上的样本容量方可将测试的相对误差控制在５％￣１０％以上。     

相邻位点碱基突变的熵性质

为了在分子水平上探讨2相邻位点碱基突变的熵性质,在双参数模型下建立有限长DNA序列2相邻位点碱基突变的微分方程模型,得出了16种碱基组成的概率随世代变化的函数关系式,证明2相邻位点碱基突变具有保熵性,生物是朝着熵增方向即多样性增加的方向进化的;阐明了在单参数模型下相邻位点碱基突变的熵性质亦是如此;该结论也适用于3个相邻位点以及更多相邻位点碱基突变的情况。并利用Matlab软件进行2相邻位点碱基突变的计算机模拟,直观地验证了所得的理论结果。     

基因组偏好影响细菌直系同源蛋白质组成

从KEGG数据库中获得69种细菌的139组直系同源蛋白质序列,对它们的氨基酸组成及全基因组GC%含量与氨基酸组成关系进行各种分析。结果表明：核酸组成偏好对直系同源蛋白质的组成有极显著影响;不同功能类型的直系同源蛋白质氨基酸组成均受核酸GC%含量影响,氨基酸的组成受到选择压力与突变压力的双重影响。同时还指出,亲缘关系近的物种之间具有比全基因组GC%含量相近的物种之间更相似的直系同源蛋白质氨基酸组成。研究结果对于今后在各种研究中使用直系同源序列进行各种生物信息等相关分析,选择合适的物种材料具有重要的指导意义。     

黄土高原降雨雨滴最终速度的分布律

用幂函数分析了雨滴最终速度与雨滴直径之间的关系,并从贝斯特的雨滴直径分布函数出发导出了雨滴最终速度分布函数。分析表明,当雨强较小时,雨滴最终速度服从韦伯分布;当雨强很大时,则服从截断的韦伯分布。最后,讨论了雨滴最终速度分布的尺度参数和形状参数,两者均取决于降雨强度和降雨类型。     

狼山鸡核型参数与生产性能的关系研究

对狼山鸡核型参数与生产性能的关系进行研究，结果表明，狼山鸡No．1染色体相对长度水平与屠宰性状、产蛋性状存在较大的关联，当No．1染色体相对长度水平为4（22．00％〈RL≤23．00％）时，屠体重、半净膛重、全净膛重、腿肌重和胸肌重往往表现较低；当No．1染色体相对长度水平为3（21．00％〈RL≤22．00％）时，总产蛋量、开产蛋重往往表现较低，说明家鸡的No．1染色体的相对长度可用于辅助育种。     

甘蓝型黄籽油菜与黑籽油菜苗期生理特性的比较研究

油菜苗期的植株长势与抗性及后期产量密切相关。为探索甘蓝型黄籽油菜抗逆性较弱和产量较低的原因,以2对不同遗传来源的甘蓝型黄、黑籽油菜近等基因系为材料,研究了苗期植株的主要生理特性。结果表明,甘蓝型黄籽油菜苗期生长势弱,叶绿素含量和类胡萝卜素含量,光合速率和叶面积指数（LAI）均比相同遗传背景下的黑籽油菜低;与黑籽油菜相比,甘蓝型黄籽油菜无论是在不同的叶龄期,还是在植株的不同部位,均表现出“糖高氮低”的代谢特点,且越冬期叶片的硝态氮含量和硝酸还原酶活性也低;根颈粗和单株干物质重也明显小。甘蓝型黄籽油菜苗期生长势弱,冬前干物质积累偏少,进而影响其春后的生殖生长,这可能是其产量较低的重要原因之一。     

马铃薯块茎糖基转移酶基因的克隆及其RNAi载体的构建

为探讨鼠李糖基转移酶(rhamnosyltransferase, sgt3)基因与类固醇糖苷生物碱(steroidal glycoalkaloid, SGAs)合成关系, 揭示sgt3基因在SGAs合成中的作用, 本研究根据GenBanK No：DQ266437保守区设计特异引物, 通过RT-PCR技术获得马铃薯块茎sgt3相似基因;采用生物信息学相关软件分析, 预测sgt3相似基因cDNA序列编码的蛋白质结构和功能, 构建基于sgt3基因的植物干扰表达载体。结果表明, 克隆的sgt3相似基因与报道的sgt3基因序列相似性达到99.54%, 其ORF长1 500 bp, 编码505个氨基酸残基, 具有UDPG糖基转移酶保守结构域及许多重要功能位点;三级结构预测表明, 该氨基酸同糖基转移酶单体结构模型相似, 为糖基转移酶家族成员, 表明可能具有合成类固醇糖苷生物碱功能, 基因序列已注册到GenBank, 序列登录号为HM188447。以此为靶序列, 构建由Actin启动子和CIPP启动子驱动的与sgt1和sgt2基因相似度高的含有sgt3基因序列的干扰表达载体, 将为糖苷生物碱的合成、代谢的进一步研究及低糖苷生物碱转基因马铃薯品种的培育奠定基础。     

葡萄病害诊断BP网络模型关键问题研究

针对葡萄病害诊断BP网络模型建立和应用中的领域知识编码方法、BP网络基本要素和网络应用等关键问题提出了解决方案。研究了以二进制编码为理论基础上的动态编码方法,对知识库实际存储的诊断参数进行实时编码,累计诊断参数编码位数作为输入层神经元个数,采取n中取1的策略确定网络输出。通过定义症状相似系数,反映实际诊断症状与训练样本症状的相似程度。上述方法应用在葡萄常见的16种病害诊断中,取得了满意效果。