"SH6"苹果矮化中间砧SnRK2基因的克隆及生物信息学分析

[目的]研究SnRK2基因在调控非生物胁迫方面的生物学功能.[方法]从苹果矮化中间砧"SH6"中分离得到3种SnRK2基因,运用多种生物学工具分析其序列特征.[结果]序列分析表明,SnRK2的CDS序列长度:SnRK2.6为956 bp,SnRK2.7为1013 bp,SnRK2.8为1072 bp,分别编码318、337和357个氨基酸的蛋白质;SnRK2蛋白无明显的疏水性,主要定位于细胞质;3种SnRK2序列相似性较高,都具有PKc_like超级家族和S_TKc家族特有的结构.[结论]这3种SnRK2基因可能在苹果非生物胁迫方面发挥重要作用.     

苹果矮化中间砧"SH6"中GID2基因的克隆及生物信息学分析

探究GID2基因在调控植物生长发育方面的作用机制.从苹果矮化砧木"SH6"中克隆到GID2-1和GID2-2基因,运用MEGA7、SWISS-MODEL、DNAMAN 7.0等生物信息学工具分析其序列、蛋白质结构;通过qRT-PCR分析GID2-1和GID2-2基因在不同激素处理下的表达情况.序列分析表明,GID2-1基因的CDS序列长度为591 bp,GID2-2为597 bp,分别编码196、198个氨基酸的蛋白质;GID2基因具有F-box结构域.qRT-PCR分析表明,在GA处理下,表达量下调;相反,在PAC处理下其表达量上调.结果表明,GID2基因可能在苹果生长发育方面发挥重要作用.