不同养殖密度西伯利亚杂交鲟幼鱼转录组分析

【目的】阐明养殖密度对西伯利亚杂交鲟（西伯利亚鲟Acipenser baerii♀×施氏鲟Acipenser schrenckii♂）生长性能的影响机制,获得最适宜的养殖密度,为该品种健康养殖提供理论数据。【方法】选取规格一致、健康无病的初始体质量为（7.89±1.45）g的西伯利亚杂交鲟幼鱼,设置低密度组（LD,0.465 kg/m2）、中密度组（MD,0.694 kg/m2）和高密度组（HD,0.930 kg/m2）3个不同的养殖密度进行为期90 d的生产试验,每个密度设置3个重复,每个重复组取1肌肉组织共9个样品进行RNA-seq测序和生物信息学分析。【结果】共得到60.70 Gb Clean Data,各样品的Clean Data均达到6.30 Gb,Q20和Q30碱基百分比在97.45%和93.42%以上;将小体鲟（Acipenser ruthenus）的基因组作为参考基因组进行比对,比对效率在72.64%～74.38%,发掘15 549个新基因;将新基因进行注释发现,12 636个新基因得到注释,2 913个新基因未得到注释;进一步对3个密度组两两比较进行差异表达基因分析,...