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旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性。从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31 软件检测SMoV中的重组事件。RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%。这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物。结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国。经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态。序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性。可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因。 相似文献
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2021年在新疆喀什地区伽师县和疏勒县厚皮甜瓜主产区随机采集了7科13种杂草的47份鲜样,采用RT-PCR法检测杂草带毒情况,分析杂草带毒率及病毒间的亲缘关系。结果表明:不同地点、不同种类杂草上的WMV、CMV、ZYMV检出率存在明显差异,伽师县WMV、CMV、ZYMV的检出率分别为5.77%、1.43%、32.19%,而疏勒县分别为17.14%、2.86%、7.14%;大部分杂草都携带病毒。杂草上的WMV、CMV和ZYMV存在较高的遗传变异。 相似文献
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