决明异分支酸合酶基因的克隆及表达分析

异分支酸合酶(Isochorismate synthase,ICS)控制着分支酸到异分支酸衍生的各种产物的分配,据报道它是植物体内蒽醌类物质合成的限速酶.该文采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆其基因全长(SoICS);以荧光定量PCR(FQ-PCR)测定其在植株各部位的表达谱并考察其与蒽醌质量分数的关系.结果表明,SoICScDNA全长为2 103bp(GenBank Accession KF547925);有多个非典型的加尾信号;含一个总长为1 713bp的完整阅读框,编码570个氨基酸;SoICS含有AtICS1和AtICS2中与ICS催化活性相关的5个保守关键氨基酸残基;其N-端有48个氨基酸残基的推定前导序列;具有典型的保守分支酸结合结构域;有多个显著磷酸化位点;其蛋白质三维结构是一个紧凑型球状结构;系统分析显示,决明ICS与蓖麻、毛果杨和山杨的ICS关系较近.FQ-PCR分析表明,ICS基因在叶中表达水平最高,其次为茎、荚果皮、幼果和种子,在根和花中的表达量最低;总蒽醌、游离蒽醌和结合蒽醌质量分数的相关性达到极显著水平,但SoICS转录本表达量和蒽醌质量分数之间没有达到显著相关水平.     

海阳县养殖栉孔扇贝大面积死亡原因分析

海阳县养殖栉孔扇贝大面积死亡原因分析邵明凯，王海仁，张永刚，辛明，赵大煜，冯岩，李培江（１山东省海阳县渔业海洋局，２６５０００２山东省海阳县大辛家镇，２６５１１６）海阳县南濒黄海，海岸线长２２９．４ｋｍ。底质为泥沙或沙泥，潮流为沿岸流，流速较缓，一１...     

陕南水稻机插秧2种育秧制剂的效果对比研究

对比研究陕南水稻机插秧2种育秧制剂的效果,以为当地水稻机插秧生产提供参考。结果表明,寒地旱育水稻壮秧剂不仅可显著提高苗高整齐度、成秧率,降低杂草数,单株秧苗素质整体上也优于育秧母基质,适宜在陕南地区使用。     

李属植物检疫性丁香疫霉和栗黑水疫霉的三重PCR分子检测

为建立我国禁止进境的2种检疫性真菌丁香疫霉Phytophthora syringae和栗黑水疫霉P.cambivora的同步分子检测方法,根据疫霉属的18S rRNA、HSP90和Ypt1基因分别设计通用引物、丁香疫霉和栗黑水疫霉的特异性引物,建立三重PCR检测方法,并进行灵敏度测试和模拟带菌试验。结果表明,可同时检测李属植物上丁香疫霉和栗黑水疫霉的特异三重PCR检测体系为:最佳引物浓度组合18SUF/18SUR、PCSF/PCSR和PSSF/PSSR依次为0.2、0.8、1.0μL,最佳退火温度为63℃,最佳退火时间为20 s。该体系扩增丁香疫霉出现884 bp的18S rRNA条带和683 bp的HSP90基因特异条带,扩增栗黑水疫霉出现884 bp的18S rRNA条带和314 bp的Ypt1基因特异条带,对照菌只出现18S rRNA条带;三重PCR反应体系检测灵敏度低于单重PCR;模拟带菌试验可同时扩增出3个片段。表明该三重PCR检测方法能实现丁香疫霉和栗黑水疫霉的同步特异性检测,可有效改进李属类水果及其种苗上检疫性疫霉的快速检测。     

播期和施氮量对陕农优206机插秧苗素质的影响初探

近年来水稻机械化育插秧在陕南地区推广面积逐年扩大,试验通过不同播期和施氮量,对机插稻陕农优206育秧期秧苗素质及其生理指标的变化进行研究,结果表明:陕农优206适宜4月20日左右播种,每盘氮肥用量10~12.25 g左右为宜。     

分子标记辅助选择在陕恢206选育中的应用

水稻稻瘟病是汉中地区水稻的主要病害之一,选育抗病品种是防治稻瘟病最经济有效的方法。该研究以同时含有稻瘟病抗性基因Pi-ta和Pi-km的蜀恢527,含有稻瘟病抗性基因Pi-b的R150为基因供体配置杂交组合,利用Pi-ta、Pi-km和Pi-b的基因标记对分离世代进行基因位点检测,结合田间多代选育、抗性筛选将3个基因转育到同一品种,通过分子标记与田间多代性状筛选,选育出抗病、高产、优质水稻新品种"陕恢206"。研究表明,利用分子标记辅助选择,为选育多抗水稻品种提供了简单、便捷的选育方法,同时也为水稻抗病育种提供了新的遗传资源。     

基于GBS技术的籼稻种质资源SNPs和Haplotype分析

利用GBS技术(NlaⅢ和MseⅠ分别酶切)对198份(112份恢复系,49份保持系和37份不明恢保关系材料)陕西省主要籼稻种质资源进行测序,MAF 0.05过滤,获得91 421 SNPs,构建6 981个Haplotype。采用MEGA5、PLINKv 1.07、TASSEL 5.0等生物学主流软件和R语言,进行籼稻群体的SNPs和Haplotype在全基因组的分布特点、群体遗传结构及全基因组KEGG分析。分布在籼稻12个连锁群上的SNPs和Haplotype的多态性及密度都不同。主成分、UPGMA及K聚类都表明198个籼稻的遗传基础较单一,样本间的遗传距离为0.01～0.60,平均遗传距离为0.28。籼稻全基因组注释基因主要参与核糖体、植物激素信号转导和内质网蛋白质加工信号通路。平均每4 374 bp有1个SNP。198个籼稻组成的自然群体分层不明显,可以作为后续QTLs的定位群体。不同连锁群上编码的基因行使的主要生物学功能差异明显。     

秦巴山地玉米种质资源的SSR标记遗传多样性分析

为了明确秦巴山地玉米自交系的亲缘关系,采用SSR分子标记方法对26份玉米自交系进行了遗传多样性分析,以遗传相似系数0.624 5为标准,将自交系分为5个类群,初步确定其遗传关系。结果表明:在供试材料中共检测到212个等位基因变异,平均每对引物检测到的等位基因变异为8.83个,变异为4～11个,平均多态性信息量PIC值为0.75,变化范围为0.31～0.93;自交系HSZ-3R被划分到第Ⅲ类群里,与其他25份材料的遗传相似系数范围在0.407 9～0.671 1之间,HSZ-3R与其他4个类群的玉米自交系配置组合具有一定的杂种优势;自交系HB41065被划分到第Ⅴ类群,与其余25份参试自交系材料的遗传相似系数为0.402 5～0.600 0,遗传距离较远,杂种优势较强,在秦巴玉米组合选配中可作为重点材料加以利用。     

基于SNP和表型性状的籼稻种质资源遗传多样性研究

为探究籼稻表型性状遗传多样性信息，以198份籼稻种质资源为试材，进行SNP分子标记和表型性状分析，结果表明:通过2种简化基因组测序技术从198份样本中共识别91 421个SNPs，杂合位点占5.85%。基于Nei’s的遗传距离在0.014~0.596，平均遗传距离为0.284。Bayes算法把198个样本聚为3个亚类。91 421个SNPs构成的总变异中，前3个主成分可分别解释群体变异的10.98%、10.47%、4.81%。15个表型性状的平均变异系数和平均多样性指数分别为30.33%和1.95。15个表型之间的相关性系数在-0.55~0.92。15个表型性状的前3个主成分可分别解释群体变异的29.44%、16.63%、10.59%，对第一主成分贡献大的性状包括穗长、株高、穗总粒数、播始历期、穗实粒数、叶长、垩白粒率和垩白度，8个性状对第一主成分的贡献值绝对值都在0.6以上，是籼稻表型性状变异的主要因素。基于表型的前5个主成分反映总信息量的73.003%，前2个主成分将198份资源分为2个亚组。Mantel检验表明，SNPs和表型性状的遗传距离矩阵之间的r为0.041。综上，SNPs和15个表型性状的多样性分析之间相关性很低，SNPs聚类比表型性状聚类更接近系谱分析。秦巴地区198份籼稻种质资源SNPs构成的群体遗传结构相对简单。表型性状变异较丰富，多样性程度高，群体间性状差异显著。综上，穗长、株高、穗总粒数、播始历期、穗实粒数、叶长、垩白粒率和垩白度这8个性状可作为秦巴地区籼稻种质资源表型性状的综合评定指标。