黄瓜白粉病抗性基因定位及候选基因分析

【目的】通过对黄瓜白粉病抗性基因的精细定位,明确抗性基因的候选区段,为进一步克隆基因及解析基因功能奠定基础。【方法】本研究选用高抗白粉病资源(自交系‘74’)和感白粉病资源(自交系‘80’)配制杂交组合,构建F_1、F_2群体,利用单囊壳白粉菌鉴定亲本及群体白粉病抗性并进行遗传分析;采用BSA-seq的方法对黄瓜白粉病抗性基因进行初步定位,在此基础上在候选区段开发分子标记,进一步精细定位白粉病抗性基因。【结果】分离群体单株表型鉴定结果表明,自交系74的抗性是由不完全隐性基因控制的。BSA-seq技术初步将抗性基因定位于5号染色体15—25 Mb位置,命名为PM 74。最终,利用分子标记将抗性基因定位于SSR15321和SSR07531之间,遗传距离为3.06 c M,物理距离为238 444 bp,可解释41.95%的表型变异。生物信息学分析表明在候选区段内包含有17个候选基因,其中Cucsa.275630为TIR-NBS-LRR类基因。【结论】本研究将黄瓜白粉病抗性基因精细定位到约238 kb的候选区段内,区段内包含有一个TIR-NBS-LRR基因,该基因将是今后研究的重点候选基因。     

甜橙WRKY转录因子序列的生物信息学分析

以拟南芥信息资源网站(TAIR)上公布的拟南芥(Arabidopsis)WRKY蛋白超家族序列为基础,利用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)在甜橙(Citrus sinensis)序列中寻找WRKY蛋白基因。结果表明:共找到53个WRKY蛋白超家族的基因,根据甜橙WRKY蛋白超家族的基因序列特征将其分为3个亚家族:Group I、Group II和Group III,并对有关基因的功能进行了预测,为甜橙WRKY蛋白超家族的基因对外界胁迫以及抗病性机能的研究提供理论依据。