对蚕学专业引入基因组与生物信息学课程的思考

目前,基因组与生物信息学已成为生命科学研究过程中必不可少的工具。然而,大多数国内高校的基因组与生物信息学教育却由于多种原因,发展迟滞,仅限于研究生阶段。西南大学蚕学专业不但拥有完整的家蚕基因组数据,且其基因组与生物信息学的教学和科研力量都很强,具有在本科课程中引入该门课程的显著优势。因此,本文拟通过描述两种切实可行的操...     

球孢白僵菌基因组密码子使用模式及其影响因素分析

球孢白僵菌Beauveria bassiana是一类成功用于全球生物防治的重要病原真菌,这是由于其宿主范围广及毒力多样化特性决定的.利用球孢白僵菌已公布全基因组数据,开展密码子使用偏好分析,以理解其基因组特征和宿主适应性.尽管通过密码子指数CAI,CBI,ENc的计算,认为球孢白僵菌密码子使用偏性较弱.但根据RSCU值鉴定最优密码子,发现球孢白僵菌基因组强烈偏好使用第三位碱基G/C的密码子,尤其是C结尾的密码子.对密码子第三位碱基进行PR2分析,发现球孢白僵菌密码子偏好性还表现在倾向于使用嘧啶结尾密码子,即U使用频率高于A,C使用频率高于G.该偏好模式通过相关性分析,认为核苷酸组成是影响球孢白僵菌密码子偏好性的一个重要因素.而ENc图和对应分析则表明除核苷酸组成外,球孢白僵菌密码子使用偏好还受到基因功能及其他多种因素的影响.中性绘图分析认为,球孢白僵菌密码子使用偏好受到外界选择下的定向突变压力作用,并推测该选择来自于其宿主.而该定向突变压力也是加快球孢白僵菌自身基因组进化和毒力多样化的一种动力,使其能适应在700多种昆虫宿主中寄生.     

生物专业英语新教学模式探索

本文分析了当前生物专业英语课程教学过程中存在的一些问题,并提出了一种新的教学模式,采用师生互动方法,利用多媒体手段,充分调动学生学习本门课程的积极性,旨在培养学生独立学习乃至实际运用生物专业英语的能力。     

兽医产科学实验教学改革探索

兽医产科学是研究动物产科生理、产科技术和产科疾病的发生、发展、诊断和预防的学科。实验教学是高等院校理论教学的强化手段和必要的补充,传统的实验教学一直是处于一种被动接受的学习模式,强调以单纯验证理论为指导思想,不注重综合能力的提高。因此,如何培养顺应社会发展需求的厚基础、宽口径、高素质和强能力的综合型兽医人才,已经成为兽医教育工作的中心任务。     

浅谈生物化学实验教学改革

生物化学实验是生命科学的一门重要的基础实验课程。通过该课程,学生能验证生化理论课中学到的理论知识,掌握到基本的生化实验技术,增强独立操作实验的能力,从而为今后的生命科学专业课程的学习,甚至未来可能从事的科研工作打下坚实的基础。但在传统的教学模式中,生物化学实验依附于理论教学,其目的仅是为了加深学生对生化理论知识的理解。从培养创新人才、提高教学质量、提高学生实践能力、满足社会对高素质人才的需求出发,生化实验教学的改革势在必行。     

两种微孢子虫全基因组中密码子偏好性比较

微孢子虫(Microsporidia)是一类细胞内营专性寄生的单细胞真核生物.基于其已测得的两个典型种的基因组数据,比较了家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)与兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)之间全基因组的密码子偏好性异同.结果表明两基因组的密码子偏好性都较弱,基因表达程度都...     

猕猴桃蒂腐病发生与防治

正猕猴桃蒂腐病2004年在陕西城固产区首次发现,此后几年接连发生,且有逐年扩大之势,对生产管理和储藏造成不小困扰。当地多湿的气候特点,使蒂腐病菌在猕猴桃植株,特别是在红阳猕猴桃上更容易发生。现将猕猴桃蒂腐病的发生与综合防治方法总结如下。1症状表现受害果起初在果蒂处出现明显的水浸状,以后病斑均匀向下扩展,果肉由果蒂处向下腐烂,蔓延全果,略有透明感,有酒味。发病初期,在果实外部看不到或只有少量病原物,但经过     

竖直细圆管中超临界CO_2对流换热实验研究

本文对超临界二氧化碳在竖直细圆管中的对流换热进行了实验研究,研究了入口温度、流体流量、热流密度及浮升力等对换热的影响。结果表明,超临界压力条件下流体的进口温度、流量和热流密度对对流换热有很大的影响。当流量比较大而热流密度比较低时,物性的变化相对较弱,计算结果与实验数据基本吻合;而当流量比较小而热流密度比较高时,物性的变化相当剧烈,计算结果与实验数据有很大差异。     

家蚕微孢子虫全基因组分析支持微孢子虫与真菌的亲缘关系

微孢子虫(microsporidia)是一类细胞内专性寄生的单细胞真核生物,虽然分子生物学的研究证据表明其与真菌(fun-gi)存在亲缘关系,但这些证据均是基于单个或少数几个基因构建系统进化树而得出的。利用家蚕微孢子虫全基因组数据,采用基于基因同源性的Darkhorse基因组统计方法,鉴定家蚕微孢子虫基因组中每个基因的来源谱系,并通过全基因组谱系可能性指数(lineage probability index,LPI)分析微孢子虫与其他物种的亲缘关系。结果表明家蚕微孢子虫与其他微孢子虫的LPI加权平均值为0.93,具有最近的亲缘关系,与真菌界的LPI加权平均值为0.65,与原生生物界的LPI加权平均值为0.38。由此证明微孢子虫与真菌存在着更近的亲缘关系,微孢子虫门属于真菌界而非原生生物界。