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土壤微生物群落磷脂脂肪酸生物标记分析程序PLFAEco 总被引：5，自引：1，他引：4
磷脂脂肪酸(PLFAs)是一个良好的生物标记物,可应用于土壤微生物群落多样性的定性定量分析。为提高分析效率,在MIDI公司的Sherlock脂肪酸微生物鉴定系统的基础上编写了生物标记辅助分析程序PLFAEco,提供基于PLFAs的微生物群落分析功能,包括样品的Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)、McIntosh多样性指数(H3)、丰富度指数(S)、Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)计算,聚类分析,主成份分析,可分别以样品和PLFAs为对象。该软件可依用户设定以PLFAs组合代替单一PLFA为计算单元便于比较真菌、放线菌、细菌等微生物类群之间的关系;亦可根据样品重复、处理信息进行均值和标准差计算。计算结果以包含图表的网页形式显示,提供CSV格式的数据文件供其它软件使用。该软件扩展了Sherlock系统在微生物群落分析方面的功能,避免了手工利用该系统带来的磷脂脂肪酸数据提取、数据矩阵构建、统计计算等复杂而繁重的工作,具有操作方便、速度快的特点,能满足大多数情况下的需求,已在烟田土壤、发酵床养猪场垫料的微生物群落分析中得到了验证。本程序及手册、示例位于网站www.dagri.org。 相似文献
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马铃薯整薯蹲芽处理栽培抗灾高产傅秀荣焦桂芝肇东市昌五镇老农艺教师刘福海，经多年试验、探索出马铃薯整薯蹲芽处理栽培法，亩产量稳定在４０００公斤以上。为了总结和推广这项新技术，我们于１９９６、９７年连续两年和刘福海同志一起，进行生产试验示范。９６年在春旱... 相似文献
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[研究目的]磷脂脂肪酸(PLFAs)是一个良好的生物标记物,可应用于土壤微生物群落多样性的定性定量分析.为提高研究分析效率,编写了生物标记辅助分析程序PLFAEco,提供基于PLFAs的微生物群落分析功能.[方法]基于MIDI公司的Sherlock脂肪酸微生物鉴定系统,采用Perl为编程语言.[结果]程序PLFAEco可计算样品的微生物群落特性,包括Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)、McIntosh多样性指数(H3)、丰富度指数(S)、Pielou均匀度(J)、Simpson 势度指数(D)计算,执行聚类分析,主成份分析;计算对象可分别为样品或PLFAs;也可依用户设定以PLFAs组合代替单一PLFA为计算单元便于比较真菌、放线菌、细菌等微生物类群之间的关系;根据样品重复、处理信息进行均值和标准差计算;计算结果以包含图表的网页形式显示,提供CSV格式的数据文件供其它软件使用.[结论]程序PLFAEco扩展了Sherlock系统在微生物群落分析方面的功能,避免了手工利用该系统带来的磷脂脂肪酸数据提取、数据矩阵构建、统计计算等复杂而繁重的工作.具有操作方便、速度快的特点,能满足大多数情况下的需求,已在烟田土壤、发酵床养猪场垫料的微生物群落分析中得到了验证.程序及手册、示例位于网站www.dagri.org. 相似文献
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