咪唑并嘧啶类杀菌剂对大肠杆菌抑菌活性的QSAR研究

在B3LYP/6-311++(d,p)水平上对26个咪唑并嘧啶类抗菌剂进行全优化和振动分析计算,得到各分子的量子参数、拓扑指数和热力学参数。应用遗传算法(GA)-主成分分析法(PCA)-神经网络(PNN)筛选出与抗菌活性密切相关的6个参数作为分子描述符;采用主成分神经网络方法建立了咪唑类抗菌剂与大肠杆菌抑制活性的定量结构—活性关系(QSAR)模型,同时采用内外部双重验证的方法检验模型的稳定性。模型的统计学参量如下:相关系数的平方(R~2)、留一法(LOO)交互验证相关系数(Q_(LOO)~2)、外部样本验证相关系数(Q_(F1)~2)、均方根误差(RMSE)分别为0.9991、0.9989、0.9996和0.155。结果表明:最低空轨道能(E_(lumo))和正辛醇/水分配系数(logP)是影响咪唑并嘧啶类杀菌剂的抗菌活性的主要因素,模拟外部验证和交叉验证表明模型具有良好的稳健性和预测能力,可用于同系列化合物抗菌活性的预测。     

应用拓扑指数研究氯代苯酚化合物结构与活(毒)性的相关性

根据分子中原子的结构特征和键的连接性,提出了新的结构信息指数和取代基染色指数计算方法,并利用所计算的指数,运用逐步回归分析方法和最佳变量子集算法对变量进行压缩,进行了20个氯代苯酚与水生动物发光菌毒性相关性分析;分析表明,氯代苯酚化合物对水生动物发光菌的毒性作用与其分子的体积、取代基的位置和多少有关,苯环上的氯原子越多对水生动物发光菌的毒性也就越大;新方法计算结果与前人其他方法计算结果和实验数据相比,偏差非常小,说明新方法计算结果可靠.     

PM3原子电荷与氯代苯的理化生物活(毒)性的相关性研究

采用Chem3D8.0软件内置的MOPAC8.0模块中的PM3方法对12个氯代苯分子和苯进行了优化计算,原子电荷的计算采用程序默认的Mulliken算法,将计算所得的环上碳原子电荷作为氯代苯分子结构描述符,运用逐步回归技术建立了氯代苯的5种理化生物活(毒)性与原子电荷的多元回归方程,相关系数均大于0.95,经显著检验,证明该模型的稳健性好,其计算值与试验值符合较好;同时对部分无试验数据的氯代苯进行预测。     

新的分子价连接性指数及其应用

提出了一个计算原子特征值δiS的新方法,并由δiS构建了各种分子价连接性指数mSA(A=Y,X),研究了新的分子价连接性指数与碱金属卤化物、卤化硅物理化学性质的相关性.研究表明,碱金属卤化物、卤化硅各种物理化学性质的计算值与实验值之间能很好地符合,更具有广泛性.     

PM3原子电荷与氯代苯的理化生物活(毒)性的相关性研究

采用 Chem3D8.0软件内置的 MOPAC8.0 模块中的 PM3方法对12个氯代苯分子和苯进行了优化计算,原子电荷的计算采用程序默认的 Mulliken 算法,将计算所得的环上碳原子电荷作为氯代苯分子结构描述符,运用逐步回归技术建立了氯代苯的5种理化生物活(毒)性与原子电荷的多元回归方程,相关系数均大干0.95,经显著检验,证明该模型的稳健性好,其计算值与试验值符合较好;同时对部分无试验数据的氯代苯进行预测。