山黧豆分子标记的开发及遗传多样性研究进展

山黧豆是一年生冷季豆类作物,因其抗旱、耐涝、耐贫瘠,具有极端气候条件下的生存能力,可作食品、牧草、绿肥等兼用,具有较高的经济价值。因山黧豆属作物普遍含有神经毒素β-ODAP,使其发展受阻;相比其他农作物,对山黧豆分子水平的研究甚少。笔者对山黧豆属种质资源研究及分子标记开发利用进行概述,为山黧豆资源挖掘和遗传改良提供依据。     

基于选择消除分析挖掘豌豆耐冻相关基因

近年来，冬季的低温对豌豆生产造成严重损失。本试验对16 份极端耐冻豌豆和14 份极端冷敏感豌豆的全基因组重测序数据与参考基因组进行比对获得SNP，再基于过滤后的SNP 数据对所有材料进行系统发育树构建、主成分分析、连锁不平衡分析以及选择消除分析等，并依据选择消除分析的群体多样性（θπ）、杂合率（Hp）和群体分化（Fst）三者交集的前5%候选区域，最终筛选获得34 个与豌豆耐冻相关的基因。研究结果为豌豆耐冻品种选育和“冬豆北移”栽培模式提供理论支撑。     

南京地区猪源沙门菌分离鉴定及耐药性检测

为检测南京地区猪源沙门菌的污染状况及耐药性,从南京地区随机采取样品96份,PCR法对猪肉中的沙门菌进行检测,纸片琼脂扩散(K-B)法对分离出的沙门菌分离株进行耐药性检测。结果表明:共检测出阳性菌株3份,阳性检测率为3.1%;所得3株阳性菌株均对头孢西丁、头孢曲松、阿米卡星、米诺环素、诺氟沙星5种药物敏感。     

枣庄地区豌豆根瘤菌遗传多样性分析

为揭示枣庄市山亭区豌豆种植基地的豌豆共生根瘤菌的遗传多样性,本研究采取了土壤样品采集、盆栽捕捉豌豆根瘤菌、分离、纯化等方法获得根瘤菌菌株,然后采用 IGS 基因的PCR-RFLP分析、16S rRNA 基因序列测定及系统发育分析、持家基因（atpD、recA、glnII）多位点序列分析,以及结瘤基因nodC系统发育分析等,对分离纯化得到的55株豌豆根瘤菌进行分类鉴定。结果表明,获得的根瘤菌共包含3种不同的IGS酶切类型,经过对代表菌株的16S rRNA 基因进行系统发育分析,分离获得的豌豆根瘤菌可以被鉴定属于根瘤菌属（Rhizobium）,进一步经持家基因多位点序列分析被鉴定为Rhizobium anhuiense和Rhizobium sophorae。该研究丰富了对该地区豌豆共生根瘤菌遗传多样性的认识。     

江苏部分地区猪源沙门菌的分离鉴定及耐药性分析

沙门菌是重要的食源性病原菌。为了解江苏地区猪源沙门菌的带菌情况,本研究对猪场采集的200份肛门拭子和屠宰场不同地点采集的186份样品进行了沙门菌的鉴别培养,共分离到91株沙门菌;血清凝集试验和PCR鉴定出19株鼠伤寒沙门菌。采用纸片琼脂扩散(K-B)法和耐药基因的PCR检测,对46株沙门菌分离株进行了耐药分析。药敏试验发现每株菌至少对一种抗生素耐药,其中对四环素耐药率最高,为82.6%,对氯霉素、氨苄西林和复方新诺明也有较高的耐药率,分别为78.26%、78.26%、69.56%;未有菌株对多黏菌素B和丁胺卡那耐药。同时,对β-内酰胺类、氨基糖苷类等几类抗生素耐药基因进行了扩增,46株菌至少有一种耐药基因,其中耐药基因par C(46/46)、sulⅡ(36/46)、tet A(32/46)、flo R(32/46)检出普遍,tet C、cat A1未检出,2株沙门菌检出黏菌素耐药基因mcr-1。研究结果为江苏地区沙门菌病的防控提供了依据。     

基于BSA-seq技术对豌豆花色基因的精细定位

BSA-seq技术在挖掘农艺性状相关的新基因中已被广泛应用,随着豌豆首个参考基因组问世,将BSA-seq技术结合豌豆基因组的基因定位策略势在必行。本研究利用紫花亲本G0004562、白花亲本G0002930以及F₂群体,通过BSA-seq技术对豌豆花色基因进行初步定位,获得31.42Mb定位区间,再通过设计InDel分子标记分析进一步缩小定位区间,最终将目标基因定位在包含19个基因的0.99 Mb区间内,通过基因注释信息推测出Psat6g060480.1为豌豆花色候选基因。本研究结果验证了BSA-seq技术快速高效定位豌豆花色基因的可行性,为利用该技术挖掘豌豆其他重要农艺性状相关基因奠定了基础。