不同类型猪小肠组织差异EST的鉴定及其SNPs分析

采用DDRT-PCR技术,对中国地方猪种和杜长大(大白×长白×杜洛克)猪的小肠组织进行差异EST分析。试验提取了地方猪和杜长大猪小肠组织的总mRNA,反转录成cDNA,利用3条锚定引物和6条随机引物组成18个引物对其进行PCR扩增,对特异性差异条带进行测序分析和鉴定其EST;针对EST序列特征,在不同产脂能力猪种中开展SNPs分析。结果表明,18个引物对共得到180多条EST序列,其中地方猪种个体间差异EST为6条,杜长大猪个体间差异EST为12条,地方猪与杜长大猪间差异EST为8条。选取具有代表性的3条种群间差异EST进行序列研究,结果显示,G24-300在种群之间的表达量存在明显的差异,是在杜长大猪群中高表达的EST;G01-360具有丰富的SNPs,并且其基因频率分布在不同类型猪群中存在明显的差异。     

山羊THRSP基因5'调控区与外显子Ⅰ多态性研究

以7个中国地方山羊品种和2个引入山羊品种为研究对象,采用PCR-RFLP方法检测山羊THRSP基因5’调控区和外显子1的多态性。结果表明,在THRSP基因的5’调控区发现C-233T多态位点,该位点是NF-KB转录因子的结合位点;在外显子1发现G113A和A138G位点,G113A能引起蛋白质发生Arg38Gln突变。在9个山羊品种中共检测到9种基因型,其中TCAAGG、TTGAAG和TTAAGG型的基因型频率均低于0.05;113G和138A在9个山羊品种中是优势基因,而223C和223T在不同品种中的分布体现出特异性,湘东黑山羊(0.715 5)、圭山山羊(0.649 0)和云岭山羊(0.613 6)携带233C的频率均在0.6以上。湘东黑山羊分别与其他山羊品种的遗传距离较大,而圭山山羊、云岭山羊和马头山羊之间的遗传距离则较近。     

5个山羊品种PRKAG3基因5’调控区和外显子13杂合度分析

以3个中国地方山羊品种和2个引入山羊品种为研究对象,采用PCR-RFLP方法检测山羊PRKAG3基因5’调控区和外显子13的多态性。结果在5个山羊品种PRKAG3基因的5’调控区发现C-525A和C-225T多态位点,在外显子13发现T90C和C102T多态位点,分别存在一对等位基因。5个山羊品种在C-525A、C-225T和C102T位点均为低度多态,但在T90C位点存在中度多态(0.25相似文献   

不同类型猪小肠组织差异EST的鉴定及其SNPs分析

采用DDRT-PCR技术,对中国地方猪种和杜长大（大白×长白×杜洛克）猪的小肠组织进行差异EST分析。试验提取了地方猪和杜长大猪小肠组织的总mRNA,反转录成cDNA,利用3条锚定引物和6条随机引物组成18个引物对其进行PCR扩增,对特异性差异条带进行测序分析和鉴定其EST;针对EST序列特征,在不同产脂能力猪种中开展SNPs分析。结果表明,18个引物对共得到180多条EST序列,其中地方猪种个体间差异EST为6条,杜长大猪个体间差异EST为12条,地方猪与杜长大猪间差异EST为8条。选取具有代表性的3条种群间差异EST进行序列研究,结果显示,G24-300在种群之间的表达量存在明显的差异,是在杜长大猪群中高表达的EST;G01-360具有丰富的SNPs,并且其基因频率分布在不同类型猪群中存在明显的差异。