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为探讨荷斯坦牛DRA基因的多态性及序列特征,本研究采用基因组DNA混合池扩增并直接测序的方法对荷斯坦牛DRA基因编码区进行多态性分析,同时利用生物信息学方法预测DRA基因的理化特性及其编码蛋白的高级结构。结果表明,荷斯坦牛DRA基因编码区上有4个碱基突变,包含1个错义突变和3个同义突变。DRA基因共编码253个氨基酸,编码产物是一种稳定的不可溶蛋白,具有15个潜在的磷酸化位点,二级结构为混合型,三级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成。本研究结果为荷斯坦牛的疾病相关基因筛选和抗病分子育种提供了一定的理论依据。 相似文献
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本研究通过DNA混合池扩增测序方法对荷斯坦牛BoLA-DRA基因外显子1突变位点进行分析,并对其结构功能进行生物信息学预测。结果发现在荷斯坦牛BoLA-DRA基因外显子1在第1位和第2位之间有碱基T的插入,生物信息学预测结果表明DRA外显子1的mRNA二级结构突变前后自由能没有发生变化,蛋白质二级结构中β-折叠占比例最高,蛋白质功能预测结果显示该基因荷尔蒙和免疫应答的几率较高,表明DRA外显子1在荷斯坦牛性激素和免疫应答过程可能发挥重要作用,本研究结果为进一步研究BoLA-DRA基因抗病选育提供理论基础。 相似文献
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