兰科ABI3基因的密码子偏性分析

密码子偏性是影响外源基因表达的重要因素，也是反映基因家族进化的关键线索之一。兰科植物是植物保护中的“旗舰”类群，且多数物种具有药用和观赏价值，但种子不易萌发，而ABI3(abscisicacidinsensitive3)基因是ABA信号转导的中心调控因子，是调控植物种子萌发的关键因子。因此，深入研究兰科ABI3基因密码子偏性，可为解析该基因功能、优化密码子组成奠定基础。本研究以拟南芥ABI3基因为探针，从公共数据库(NCBI)筛选出45条兰科植物ABI3基因，通过CodonW、SPSS、MEGA等生物信息学程序对其进行密码子使用模式和偏好性分析。相关参数分析结果表明，该基因的ENC(effective number of codon)值范围分布为40.84～58.46，其中大于52的占82.2%,CAI(codon adaptation index)平均值为0.203，远小于1，表明ABI3基因的密码子偏性相对较弱；中性绘图分析显示，GC12与GC3的回归曲线的斜率为0.6103,R²=0.7928,P<0.05，有极高的相关性，这暗示着碱基组成对密码子偏性...