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为了开发火焰兰(Renanthera coccinea)的SSR引物,进而开展海南岛火焰兰的种质鉴定、遗传多样性和群体结构分析。本研究采用三代测序技术首先获得火焰兰参考转录组,然后开发了火焰兰的SSR引物,最后基于SSR引物利用分子变异分析(AMOVA)、非加权组平均法(UPGMA)聚类、主坐标(PCoA)与群体结构分析等方法对来自海南岛不同地理分布的396份火焰兰资源进行研究。结果表明,所开发的17对三核苷酸多态性SSR引物能够有效地鉴别所收集的396份火焰兰种质。AMOVA分析显示,火焰兰群体间呈现极高程度的遗传分化,并且群体内的遗传变异高于群体间的遗传变异。群体结构分析显示,来自不同地理分布的海南岛火焰兰存在3个不同的基因库,而且绝大多数群体是独立进化的,只有少数群体存在遗传混合,这一结果与UPGMA和PCoA分析的结果基本一致。综上可知,本研究新开发的17对SSR引物有效鉴定了396份海南岛火焰兰种质,揭示了其遗传多样性和群体遗传结构,对火焰兰的种质资源保护和育种计划具有非常重要的参考价值。 相似文献
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[目的]开展海南梧桐种子萌发及插条扦插繁殖试验,为海南梧桐繁殖体系构建及其开发利用提供参考依据.[方法]采用完全随机试验设计,以物理破损(去除种皮1/5和划破种皮)和化学激素(NAA、GA3溶液)浸泡处理海南梧桐种子,分析其种子萌发效果;并通过扦插试验,研究扦插基质(砂、砂+椰糠、园土)、生根粉(ABT:0、1000.00、1500.00 mg/L)及捅条穗龄(当年生、1~2年生、3~4年生)对海南梧桐枝条扦插成活率的影响.[结果]物理破损及化学激素浸泡法处理均可提高海南梧桐种子发芽率,其中物理破损处理的海南梧桐种子发芽率达90.60%~91.70%,显著高于其他处理(P<0.05,下同).扦插试验结果表明,影响海南梧桐扦捅成活率的3个因素(扦插基质、ABT质量浓度、插条穗龄),其主效应极显著(P<0.01);在二维互作中,基质×ABT互作效应显著,基质×插条穗龄、ABT×捅条穗龄互作效应不显著(P>0.05,下同);在三维互作基质×ABT×捕条穗龄中,交互效应不显著.各因素对海南梧桐扦插成活率影响的排序为插条穗龄(F=21.85)>ABT质量浓度(F=11.05)>基质种类(F=9.45)>基质×ABT(F=2.85).最适扦插组合为:砂+ABT(1500.00 mg/L)+1~2年生插条,扦插成活率达20.00%.[结论]对海南梧桐种子进行物理破损或激素浸泡软化处理均可促进其萌发;1~2年生枝条经1500.00 mg/L ABT浸泡12h扦插于砂基质中最有利于其生根成活. 相似文献
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槟榔基因组DNA提取及ISSR反应体系的优化 总被引:1,自引:0,他引:1
以槟榔为试验材料,用改良的CTAB法提取基因组DNA,并设置不同梯度分别对每个PCR反应因子做了相应的试验.结果表明:改良的CTAB法提取的槟榔基因组纯度高、质量好;同时,建立了适合槟榔ISSR-PCR反应体系,即20μL PCR反应体积中,模板DNA浓度为30 ng/μL,浓度为2.5 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,dNTPs浓度为0.4 mmol/L,引物为浓度为0.8μmol/L. 相似文献