长顺绿壳蛋鸡SFRP5基因外显子1的SNPs鉴定及其与常规肌肉品质的关联性分析

分泌型卷曲相关蛋白-5(SFRP5)对畜禽脂质代谢起着至关重要的调控作用。为了探讨鸡SFRP5基因SNPs与肌肉品质的相关性,采用PCR产物直接测序法检测SFRP5基因外显子1的SNPs位点,分析其对长顺绿壳蛋鸡胸肌肌肉品质的影响。结果显示:在SFRP5基因外显子1的CDS区中发现3个SNP沉默突变位点:g.23251706 C>T为低度多态位点,g.23251882 C>T和g.23252056 C>T为中度多态位点;3个位点的等位基因C和基因型CC均处于优势地位,且基因型分布均未偏离Hardy-Weinberg平衡状态。连锁不平衡分析表明:3个SNP位点之间不存在强连锁不平衡,发现4种单倍型和10种双倍型,单倍型H1和双倍型H1H1频率最高。关联性分析结果表明:g.23251706C>T位点对胸肌蒸煮损失的影响达到显著水平(P<0.05),TT基因型有利于降低蒸煮损失;g.23252056C>T位点则对失水率的影响达到显著水平(P<0.05),TT基因型有利于提高肌肉保水力;3个SNP位点联合组成的双倍型对胸肌的5个常规肉品质指标均有不同程度的影响。综合所有指标在双倍型之间的差异,双倍型H2H2是改善长顺绿壳蛋鸡肌肉品质最有利的双倍型,揭示在SFRP5基因外显子1中发现的3个SNP位点相互联合能显著影响肉质,可作为鸡肌肉品质选择的遗传标记。     

三穗鸭SLC4A9基因表达量及其多态性对蛋壳品质的遗传效应分析

为探究溶质载体家族4成员9（solute carrier family 4 member 9,SLC4A9）基因的表达量及其多态性对鸭蛋壳品质的遗传效应,试验采用实时荧光定量PCR法检测SLC4A9基因在三穗鸭不同组织中的表达水平,采用PCR产物直接测序法筛查三穗鸭SLC4A9基因的SNP位点,并分析SNP位点对三穗鸭蛋壳品质的遗传效应。结果显示,SLC4A9基因mRNA在三穗鸭10个组织中均有不同程度表达,其中在心脏和胰腺中为高度特异性表达,肾脏中为中度表达,其他为低度表达。试验共检测到10个SNPs位点,其中3个位于外显子上（g.6803 C>T、g.7065 C>T和g.7089 C>G）,且均为错义突变,7个位于内含子上（g.7162 C>G、g.11044 G>A、g.11090 T>C、g.11234 C>T、g.11261 C>T、g.11349 C>T和g.11403 G>A）,其中g.6803 C>T位点突变导致丙氨酸（GCG）变为缬氨酸（GTG）;g.7065 C>T位点突变导致丙氨酸（GCC）变为缬氨酸（GTC）;g.7089 C>G位点突变导致丙氨酸（GCA）变为甘氨酸（GGA）。χ²检验结果显示,g.6803 C>T、g.11090 T>C和g.11349 C>T突变位点的基因型分布均偏离了Hardy-Weinberg平衡状态（P<0.05）,其余位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。关联分析结果表明,g.11349 C>T位点的CC和CT基因型蛋壳强度显著高于TT基因型（P<0.05）。综上,SLC4A9基因的10个SNPs位点均对三穗鸭的蛋壳品质产生影响,其中g.11349 C>T位点达到了显著水平,可为蛋鸭蛋壳品质的改善及遗传标记提供参考依据。     

长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR 结构域的多态性对蛋壳品质的影响

为了探究贵州特产长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域的多态性对蛋壳品质的影响,采用在线引物设计软件Primer Premier 3.0设计1对引物,扩增ITPR1基因RYDR-ITPR结构域,利用双向直接测序和序列比对法挖掘单核苷酸多态性(SNP)位点,应用SPSS 18.0软件分析SNP位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响。结果显示,在ITPR1基因第17～19内含子区共发现3个SNP位点,分别为位于18内含子上的g.18853584 GT、g.18853600 AG突变位点和19外显子上的g.18853848 CT突变位点;3个SNP位点均为中度多态,均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P0.05),共检测到4种单倍型和7种双倍型。关联分析结果显示,位于19外显子上的g.18853848 CT突变对蛋壳厚度有显著影响,TT、CC基因型显著高于TC基因型(P0.05);双倍型H3H3的蛋壳厚度和蛋壳强度测定值最高。综上,长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域中g.18853848 CT突变可能是影响蛋壳厚度的标记位点,双倍型H3H3可能是蛋壳厚度和蛋壳强度的有利双倍型。     

三穗鸭PRKCB基因内含子14的变异对蛋壳品质的影响

为探究PRKCB基因对三穗鸭蛋壳品质的遗传效应,采用PCR产物直接测序法、DNAStar软件MegaAlign程序结合Chromas软件对120只三穗鸭(Anas platyrhyncha domestica)PRKCB基因的遗传位点变异进行筛查鉴定,用SPSS 18.0软件分析SNP位点与蛋壳品质的相关性。结果显示:在三穗鸭PRKCB基因第14内含子检测到g.1158465 C>T、g.1158519 G>A和g.1158524 G>A这3个SNPs突变位点,每个突变位点均产生3种基因型,且均为中度多态位点。g.1158519 G>A和g.1158524 G>A突变位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,g.1158465 C>T位点的基因型分布则显著(P<0.05)偏离Hardy-Weinberg平衡;g.1158519 G>A和g.1158465 C>T位点之间存在强连锁不平衡。3个SNPs共组成5种单倍型和8种双倍型,优势单倍型H5(TGG)的频率为0.492,优势双倍型H2H5频率为0.200。关联分析显示,g.1158519 G>A位点的AG基因型个体蛋壳厚度显著(P<0.05)高于GG基因型个体,双倍型H1H3个体的蛋壳厚度显著(P<0.05)高于H3H5个体的蛋壳厚度。研究结果提示,PRKCB基因的遗传变异可以影响蛋壳品质,其中g.1158519 G>A位点可作为改善三穗鸭蛋壳品质选择的遗传标记。     

OCX-32基因表达载体构建及其对鸡子宫上皮细胞Ca2+浓度和脂质指标的影响

为探究卵黄蛋白原-32（ovocalyxin-32,OCX-32）基因过表达与鸡子宫上皮细胞Ca²⁺含量和脂质指标之间的关联性,本研究采用Ⅳ型胶原酶法分离培养长顺绿壳蛋鸡子宫上皮细胞,构建pcDNA3.1（+）+OCX-32+Flag表达载体并转染子宫上皮细胞,测定OCX-32基因过表达量、Ca²⁺浓度和脂质指标并进行相关性分析。结果显示,试验组的总胆固醇（TCHO）浓度显著高于对照组（P<0.05）,对照组的Ca²⁺浓度显著高于试验组（P<0.05）。OCX-32基因过表达量与Ca²⁺浓度呈显著负相关关系（P<0.05）,与甘油三酯（TG）浓度呈显著正相关关系（P<0.05）,与TCHO浓度呈极显著负相关关系（P<0.01）,TCHO浓度与TG浓度呈极显著负相关关系（P<0.01）,研究结果揭示了OCX-32基因过表达能够调控鸡子宫上皮细胞的Ca²⁺含量和脂质的合成转运,为深入阐释鸡子宫上皮细胞中脂质和钙分泌的调控机制提供试验基础和数据支持。     

贵州白山羊PRDM16基因变异及生物信息学分析

为探究贵州白山羊PRDM16基因的分子特征及编码蛋白的结构特征。本研究以贵州不同类群贵州白山羊为研究对象,采集128份血液并提取DNA。根据NCBI中GengBank的山羊PRDM16基因序列(登录号：NC＿030823),应用Premier 5.0软件设计特异性引物,用PCR技术进行混合测序检测基因多态性,利用相关生物信息学分析软件预测分析PRDM16基因的理化性质、疏水性、跨膜结构、亚细胞定位、信号肽、结构域、磷酸化位点、编码蛋白的二级和三级结构、系统进化树构建及蛋白互作信息。结果表明,PRDM16基因序列中存在g.342 G/A突变,生物信息学分析发现PRDM16基因CDS区全长3814bp,共编码1271个氨基酸,分子式为C₆₁₃₃H₉₅₄₅N₁₇₁₇O₁₉₀₄S₅₇,原子总数为19356个,相对分子质量为139624.04kU,带负电荷的残基总数为172个,带正电荷的残基总数为143个,不稳定指数为58.72,理论等电点(PI)为5.93,为酸性不稳定蛋白,亲水性平均...     

黔东南苗族侗族自治州林下蛋鸡养殖发展思路

黔东南苗族侗族自治州的林下蛋鸡产业在乡村振兴发展中具有重要作用，但目前产业发展中还存在一些问题。分析了黔东南州林下蛋鸡产业短板，并从管理与市场等方面提出相关建议，为林下蛋鸡产业更好地助力乡村振兴发展提供借鉴和参考。