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西瓜花叶病毒2号新疆昌吉分离物外壳蛋白基因核苷酸序列分析 总被引:6,自引:1,他引:5
利用RT-PCR从新疆昌吉地区表现花叶、疱斑、扭曲等症状的南瓜病株上检测到西瓜花叶病毒2号新疆昌吉分离物(简称WMV-2-XJ-CJ),并测定了该分离物外壳蛋白(CP)基因序列。序列分析表明,新疆昌吉分离物CP基因全长850个核苷酸,编码197个氨基酸。与国内外报道的12个WMV-2CP基因相比,其核苷酸序列同源性为92.6%~98.3%,由此推导的氨基酸序列同源性为94.7%~99.3%。新疆昌吉分离物在CP N'端可变区明显不同于国内外报道的核苷酸序列。WMV-2新疆昌吉分离物与日本和郑州分离物较其它国家和地区的分离物多出6个核苷酸,但其核苷酸及其推导的氨基酸序列差异较大。新疆昌吉分离物外壳蛋白有2个氨基酸残基明显不同于其它分离物,其中蚜传株系的特征结构域DAG突变为DAE。 相似文献
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新疆小西葫芦黄化花叶病毒的分子鉴定与序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
在新疆石河子地区采集具有黄化、花叶和疱斑等症状的多种葫芦科作物,分别提取总RNA,利用小西葫芦黄化花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)特异性引物进行RT-PCR扩增,其中来自黄瓜、甜瓜和丝瓜的模板RNA上可以得到1185bp片段。将扩增得到的片段克隆到pMD18-T上,序列分析结果表明:该片段含有1185个核苷酸,包含完整CP基因。与ZYMV Florida分离物、California、韩国KR-PA分离物、新加坡S及中国北京CH-BJ等GenBank报道的7个不同地域、不同种寄主植物上的分离物序列进行同源性分析的结果显示:ZYMV新疆分离物的CP基因核苷酸与其它11种ZYMV分离物的同源性高达99.42%,氨基酸序列同源性高达98.48%;新疆5个来源于不同寄主植物的ZYMV,不存在明显的遗传变异性,同源性高达97%,而与北京CH-BJ,Reunion和Singapore分离物相比存在较大差异,说明ZYMV地域的相关性要大于寄主上相关性。 相似文献
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对采自景宁畲族自治县的BL09、BL11、BL12三个野生灵芝菌株与当前景宁畲族自治县主栽品种韩芝进行子实体、生物学效率比较,结果表明,4个菌株在母种培养基上,BL09、BL11、BL12之间生长速度差异不显著,而韩芝生长较慢,并与其它菌株存在极显著的差异;BL09和BL11菌丝生长浓密洁白,气生菌丝量大,菌丝边缘整齐,BL12和韩芝则相对较差;4个菌株在原种培养基上的生长速度,BL09和BL11之间差异不显著,BL09、BL11与BL12、韩芝之间存在极显著差异,BL12和韩芝之间差异不显著;菌盖大小为BL09> BL11> BL 12>韩芝,产孢量大小为BL09> BL11>韩芝>BL12; BL09和BL11产量较高,它们与韩芝和BL12之间存在显著差异,BL12产量最低,评比结果表明,BL09无论在菌丝生长方面还是在子实体生长方面,均优于其它菌株,都表现出良好的长式,是较适宜于景宁生产推广的优良菌株. 相似文献