杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析

利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5'端EST序列测序,共获得有效序列20 023条.序列经聚类分析和拼接后,共获得10 816个Unigene,其中包括3 734个Contig,7 082个独立的Singleton.被注释的8 853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分3个不同分类角度进行分类.在具有功能注释的8 853个Unigene中,选出330个与完成全基因组测序的毛果杨序列进行BLAST分析,结果发现有177个抗病相关候选基因出现在282个Unigene中,其中135个分布于杨树的18个不同连锁群上,其他42个基因位于还没定位的scaffolds上.所测定的这些EST序列为后期在基因组水平上研究杨树黑斑病的水平抗性遗传机制及进一步的相关基因发现奠定基础.

Abstract：

In an attempt to elucidate the molecular mechanism for resistance of black spot disease in poplar,gene expression profiles in leaves of Populus deltoides'Lus'(I-69/55)and P.euramericana'I-45/51',which were inoculated with the pathogen Marssonina brunnea f.sp.brunnea,were analyzed based on expressed sequence tags (ESTs).A total of 20 023 valid ESTs from the 5'terminal ends derived from corresponding cDNA libraries of the two poplar species were sequenced.Cluster analysis of the 20 023 sequences yielded 10 816 tentative unigenes,including 3 734 contigs and 7 082 singletons.All tentative unigenes were classified by Gene Ontology functional categories.To find resistance-associated candidate genes and locate them on poplar genome,330 unigenes was chosen from 8 853 annotated tentative unigenes,and their BLAST alignment was conducted with Populus trichocarpa assembly,1 77 related candidate resistant genes were found,and they presented in 282 unigenes.Among these genes,there were 1 35 genes located on 18 different linkage groups of poplar genome,and 42 genes located on the different scaffolds.This study supplied a resource of candidate genes for further exploring the genetic mechanism for the host horizontal resistance to the pathogen Marssonina brunnea at the whole genome range,and provided important information for further gene discovery.     

宜昌薄皮马尾松采种基地建设及主要经营技术的研究

宜昌薄皮马尾松 (PinusmassonianaLamb.var.yichangensisHuangetZhuang )是经中国林科院树木分类学家洪涛教授定名的 1个新变种 ,该变种具有树皮薄、生长快、干形好、材质优良、出材率高、林分生物量及光能利用率高、适应性广等特点。本文从宜昌薄皮马尾松分布区域及资源状况的确定、采种基地的工程建设程序、建设过程及成绩、基地建设的主要经营技术、采种基地建设成功的初步经验等方面进行了全面总结。为今后我省其他采种基地的建设提供了方法和技术     

恩施天然红椿种群结构及空间分布格局

红椿Toona ciliata是国家Ⅱ级重点保护野生植物,以红椿为优势种的天然种群十分少见。对湖北省恩施州4个不同红椿天然种群设立样方调查。编制了红椿特定时间生命表,绘制存活曲线,对种群龄级数量进行动态预测,并对空间分布格局进行分析,以研究不同种群空间结构和分布格局的成因。结果显示:4个种群的人为干扰强度:T4＞T1＞T2＞T3;4个种群结构动态指数Vpi分别为23.8%, 34.0%, 27.8%和 32.3%,均为增长型。由于不同外界干扰强度,不同种群死亡率（qx）出现在龄级上推迟的现象;最高进入x龄级个体的生命期望（ex）值T3＞T4＞T1＞T2。存活曲线不符合Deevey曲线,模拟符合三次函数曲线。25,50和100 m2取样面积上,方差／均值比率法的t检验、Morisita指数I参数的F检验、负二项参数K值均表明:T1和T4种群为聚集分布,T2和T3种群为泊松分布。聚集强度T4＞T1＞T2＞T3;拥挤程度:T1＞T4＞T3＞T2。研究表明:红椿种群在自然状态下处于增长状态,潜在干扰影响时,仍表现为稳定种群。红椿天然种群以泊松分布为特征,聚集分布主要来源于人为干扰。适当人为干扰,可以促进红椿种群更新、物种保护和生态效益最大化。图2表5参25     

基于EST序列的杨树候选SNPs标记分析

利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记.研究结果表明,在获得的94个碱基替代型候选SNPs中,A/G替换类型最多,占32.98%,C/T替换型占13.83%,其它碱基置换型SNPs占53.20%.同时,对其中20个候选SNPs位点的重新测序结果表明,有13个(占65%)候选sNPs位点得到证实,其中,11个位点为碱基替代型SNPs,另外2个为杂合型位点.     

引种日本落叶松原生种源及优树半同胞家系苗期试验初报

引种日本落叶松原生种源及优树半同胞家系苗期试验研究结果表明：原生种源问高生长具有明显差异,确定松本、伊那、日光为优良种源;家系间的高生长也具有明显差异,确定县诹访１号等２０个家系为优良家系;原生种源的遗传变异幅度极大,具有相当的遗传改良潜力和遗传资源保存价值。     

南方型黑杨品系短周期纤维材定向培育研究初报

本文以我省生产中的10个杨树品系为研究对象,以1a生苗木的生长量和杆重量以及纤维形态测定为指标,以1a轮伐期纤维材培育为目标,比较分析了不同品种之间的差异,并对其进行了多指标的综合评定。分析结果表明:1a生杨树苗木的各项性能指标均符合造纸原料要求。综合而言,中嘉2号、中潜2号和天寅杨更适于作为短周期纤维材进行定向培育,且应采取2a根1a杆的经营模式。     

孝昌马尾松天然林同工酶遗传构造的分析研究

通过对湖北省孝昌县小悟乡的马尾松（Ｐｈｕｓ ｍａｓｓｏｎｉａｎａ）天然林的针叶进行的同工 酶实验,６种酶系统的１１个基因位点得到了确认。以各基因位点上的等位基因的频率为基础, 对该林分内部的遗传变异进行了研究,结果表明,该林分具有较高的遗传变异性,其多态位点 百分率（ＰＩ）为９０．９％、等位基因平均数（Ｎａ）为３．１８、有效等位基因（Ｎｅ）为１．９１、平均期待杂 合率（Ｈｅ）为０．４２、近交系数（Ｆｉｓ）为０．３３,且存在不同基因位点间高频率的连锁不平衡。同时 将马尾松个体间的距离分成不同的等级,考察各等位基因频率的变化情况（Ｍｏｒａｎ’ｓＩ和ＳＮＤ 曲线的变化规律）,进一步对该林分内的遗传构造和林分的成立过程进行了研究和探讨,发现 其邻域的大小为１０～１２ｍ。在此基础上提出了对该类的天然林的遗传资源保存的对策。     

湖北省马尾松低产林成因与改造对策

据统计,我省马尾松林面积和蓄积分别占全省的37.8%、40.6%,均居全省之首。然而不容忽视的是,我省马尾松林普遍存在着林种结构单一、生长速度缓慢、生态防护功能低下、经济效益差等突出问题。大量低产、低效马尾松林的存在极大地浪费了我省有限的林地资源,严重阻碍了我省建设林业资源大省和产业强省的目标实现。为此,笔者就我省马尾松低产林形成原因及其改良措施谈几点看法,仅供参考。     

马尾松天然林遗传资源保存对策的研究

对湖北省孝昌县小悟乡的马尾松(Pinus massoniana)天然林的针叶作了6种同工酶系统的分析,确认了11个基因位点。同时将马尾松个体间的距离分成不同的等级,考察各等位基因频率的变化情况,进一步对该林分内的遗传构造和林分的成立过程进行了研究和探讨,在此基础上提出了对该类天然林遗传资源的保存对策。     

垂枝杉种质资源的RAPD鉴定及遗传多样性研究

利用RAPD标记对垂枝杉种质资源进行了遗传多样性分析，并与杉木其它类型作对照，对其进行鉴定。结果表明：垂枝杉群体具有较高的遗传多样性，群体间变异占总变异的15．6％；3个垂枝杉群体遗传相似度高，与其它杉木类型的遗传相似度低；垂枝杉具有稳定的遗传性和一致的表现型。从分析结果可以得出垂枝杉是杉木的一个自然变异类型。