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两个藏猪类群微卫星DNA遗传多样性的研究 总被引:8,自引:0,他引:8
采用5个微卫星引物对2个藏猪类群(合作猪和迪庆猪)及参照群体成华猪的遗传多样性进行了研究。结果表明,所选的5个微卫星引物均具有多态性,3个猪种在5个位点的等位基因数为4~8个;合作猪、迪庆猪和成华猪在5个位点的平均有效等位基因数分别为4.5104,3.0696和3.1250,位点平均杂合度分别为0.7713,0.6405和0.5197,平均多态信息含量分别为0.7402,0.5656和0.5798;遗传分化系数表明,2个藏猪类群间亲缘关系较近(GST=22.07%),二者与成华猪的关系较远(GST=22.46%,GST=31.11%)。 相似文献
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Genetic diversity was investigated for forty populations of ten Elymus species from the Tibetan and Inner Mongolian plateaus of China using allozyme and micro‐satellite markers. The two assays differed in the amount of polymorphism detected. Micro‐satellites detected the higher amounts of polymorphism. For allozymes and micro‐satellite markers, between populations of each species, the proportion of polymorphic loci, heterozygosity and Shannon's Information index ranged from 0·1667 to 0·833, and 0·455 to 1·00, respectively, 0·0800 to 0·2528 and 0·1622 to 0·3619, respectively, and 0·1173 to 0·3769 and 0·2248 to 0·5318 respectively. As for gene flow at the species and population levels, limited gene flow was found between populations within species and between species. From a geographical standpoint, samples from different regions showed a range of values. Populations from the Tibetan Plateau of China had higher genetic variation than from the Inner Mongolian plateau both using allozyme and micro‐satellite markers. 相似文献
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用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系 总被引:1,自引:0,他引:1
利用20个微卫星座位对贵州12个地方鸡种和隐性白洛克进行遗传分析,得到各品种的等位基因频率、平均杂合度、多态信息含量及品种间的Nei氏标准遗传距离,并进行了聚类分析。结果表明:13个鸡种在各微卫星座位上的遗传杂合度均有差异,平均遗传杂合度为0.6885(贵州地方鸡种为0.6915);平均多态信息含量为0.6297(贵州地方鸡种为0.6326),说明贵州地方鸡种遗传多样性较隐性白洛克丰富。UPGMA聚类分析结果显示,13个鸡种分为2大类群,隐性白洛克独自构成一个类群,12个贵州地方鸡种为另一个类群,12个贵州地方鸡种进一步可分为4个小类群。研究结果对贵州地方鸡种资源的评估、保存和利用具有一定的指导意义。 相似文献
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微卫星DNA在濒危动物保护中的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
为了保护珍稀濒危动物,迫切需要了解它的遗传结构和遗传多样性的现状.而微卫星DNA具有多态性信息丰富、共显性遗传、易于检测等特点,作为一种优良的遗传标记在濒危动物研究中得到了广泛的应用.综述了其在濒危动物种群遗传结构分析、基因流程度、种群进化史、物种的判定和种群数量调查、亲缘关系等中的应用情况. 相似文献
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DNA分子标记技术在酿酒酵母菌株遗传多样性分析中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
本文介绍了RAPD、mtDNA-RFLP、微卫星DNA(microsatellite)、Interdelta指纹图谱以及线粒体DNA COX1基因指纹图谱等5种DNA分子标记技术的方法和原理及其优缺点,同时探讨了DNA分子标记技术在国内外酿酒酵母菌株区分中的应用状况与前景。 相似文献
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独龙鸡微卫星标记遗传多样性的比较 总被引:1,自引:0,他引:1
为了从分子水平上揭示独龙鸡群体遗传结构,利用鸡基因组中25个微卫星标记,检测了独龙鸡群体的遗传多样性,同时探讨了独龙鸡在国内几个地方鸡种中的系统地位.结果表明:25个微卫星位点共检测到90个等位基因,其中ADL0166位点的等位基因数最多,为8个,而ADL0112、LEI0166、MCW0067、ADL0268、MCW0294、MCW0078和MCW0183这7个位点的等位基因数最少,为2个;聚类分析结果显示,独龙鸡与我国华南、西南地区鸡种之间有比较密切的亲缘关系,而与我国华北和东北地区鸡种亲缘关系均较远.总体而言,该系统聚类结果与13个鸡种的地理分布是一致的,并且认为独龙鸡是由红原鸡进化而来的家鸡品种. 相似文献
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针对目前多倍体植物的微卫星数据等位基因拷贝数据处理困难、数据格式转换等问题,利用R语言下Polysat软件包,以巴山木竹13个种群260份样本的微卫星数据为例,进行微卫星数据的导入、输出和基因分析,如微卫星等位基因信息统计SSR数据的基因型判断及无性系克隆的划分,种群间的PCA分析,种群间的Fst值分析等。认为与其它多倍体数据处理软件相比,该软件R编程环境具备的多功能性和数据输入、输出方法简单等特性,为相关研究人员提供了方便。 相似文献