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为了解大蒜GST基因及其编码的蛋白质的结构特征,分析GST基因在不同组织及盐胁迫条件下的表达特性,采用RT-PCR方法克隆得到大蒜苍山四六瓣GST基因,采用BLAST、DNAMAN、ProtParam、MEGA5、Swiss-Model等生物信息工具分析其序列特征,利用实时荧光定量PCR方法,分析AsGST基因在大蒜根、鳞茎和叶片中的表达差异及其对盐胁迫的响应情况。结果表明,大蒜AsGST基因全长663 bp,编码220个氨基酸,推测蛋白质分子质量为25.58 kDa,理论等电点为6.55,属于tau类GST家族。植物GST的序列相似性较低,但在结构上相对保守。在蛋白的N端含有谷胱甘肽特异结合位点(G位点),C端含有可变性较大的疏水底物结合位点(H位点),在进化关系上AsGST与茄科作物较近。空间结构分析表明,大蒜GST的三级结构由3个β-折叠和11个α-螺旋构成。实时荧光定量PCR显示,苍山四六瓣中GST基因在根中的表达量最高,其次是叶,在鳞茎中的表达量较低,具有明显的组织特异性。盐胁迫处理4 h后,各组织内AsGST基因的表达量均升至最高,说明该基因可响应盐胁迫逆境信号。本研究结果为进一步研究大蒜GST基因的功能奠定了一定的理论基础。 相似文献
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研究表明miR-17-92簇在诸多生命进程中发挥着重要作用。本研究目的是分析感染日本血吸虫小鼠肝脏不同时期miR-17-92簇的表达水平及其靶基因蛋白水平的表达变化,为进一步研究肝脏病理损害的分子机理奠定基础。q RT-PCR分析表明miR-17-92簇在感染日本血吸虫小鼠肝脏的不同感染时期呈现差异变化,随着时间延长呈现升高趋势;q RT-PCR和免疫印迹分析表明miR-17-92簇靶基因在感染日本血吸虫小鼠的肝脏呈现差异变化,进一步研究表明感染日本血吸虫小鼠血浆中miR-17-92簇的丰度也呈现差异变化。研究提示miR-17-92簇在血吸虫感染的终末宿主的肝脏病理损害中可能发挥重要的调控作用,也有可能成为血吸虫病引起宿主肝脏病变损伤诊断的新型标识分子。 相似文献
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基于面向对象的坑塘遥感监测与动态分析 总被引:1,自引:0,他引:1
以江汉平原的洪湖市为研究区,利用1990—2009年间的3期Landsat卫星TM遥感数据,基于面向对象的分类方法进行多尺度分割,利用光谱、空间、纹理等特征,并结合专家知识进行坑塘信息提取,对洪湖市坑塘变化状况进行遥感监测和时空演变分析。结果显示:利用面向对象的自动分类方法可以有效提取坑塘信息。洪湖市坑塘面积在1990—2009年间呈现增加趋势,其中1990—2000年与2000—2009年间坑塘面积分别增加了306.53 km2和379.69 km2。坑塘增加面积随着与湖泊空间距离的增加而减少,坑塘的增加主要由耕地、湖泊和河流转化而来。利用面向对象的坑塘信息自动提取可以为区域资源环境调查监测提供参考。 相似文献
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