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基于转录组信息的黑果枸杞MYB转录因子家族分析 总被引:4,自引:2,他引:2
【目的】MYB基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。目前仍没有针对枸杞等木本作物MYB转录因子家族的系统分析。基于转录组数据鉴定分析黑果枸杞MYB基因家族,可为该类基因生物学功能和代谢调控机制的研究提供参考。【方法】基于黑果枸杞转录组测序(RNA-Seq)数据,利用NR、NT、Swiss-Prot和PFAM 4个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞MYB基因进行筛选注释;利用Web Logo3、Prot Comp 9.0、MEGA5.0软件进行保守结构域、亚细胞定位和系统进化等生物信息学分析。基于转录组数据分析MYB基因在黑果枸杞果实不同发育期的差异表达模式,并采用荧光定量PCR方法进行验证。【结果】基于转录组测序数据,注释得到83个黑果枸杞MYB类转录因子基因,根据结构特性将其分为4大类:R2R3-MYB、1R-MYB、3R-MYB和4R-MYB。结构域分析表明:R2R3-MYB类转录因子的R2 MYB基序中包含3个极度保守的色氨酸残基,R3 MYB基序中的第一个色氨酸残基被疏水氨基酸替代。比较分析黑果枸杞MYB家族和拟南芥MYB家族共同构建的进化树发现,黑果枸杞的MYB家族在进化上包括3个大类,6个亚类。亚细胞定位预测结果显示,44个MYB转录因子定位于细胞质中,37个定位于细胞核中。基于转录组数据的MYB差异表达模式分析表明,黑果枸杞MYB基因可能参与了果实不同发育时期花青素变化的调控;基于荧光定量PCR的差异表达数据进一步验证了部分MYB转录因子在果实不同发育时期的花青素合成中可能起到调控作用。【结论】黑果枸杞MYB基因家族注释得到83个黑果枸杞MYB类转录因子基因,为进一步研究MYB家族的基因结构和生物学功能奠定了基础。 相似文献
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正伊犁河谷玉米的种植面积较大,2017年河谷面积面积达到250万亩以上,玉米也是当地重要的农作物之一。影响玉米实际生长情况的因素有很多,尤其玉米对生长环境有较高要求,要实现玉米高产,需要对玉米生长的相关因素进行全面分析。玉米产量高低和种植密度与施肥水平存在直接影响,本文通过试验的方式,设计不同种植密度和不同施肥水平,对不同试验区的玉米产量进行科学分析,确定出获得最大玉米产量的最合适种植密度和施肥水平。 相似文献
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测定早造种植收获的42个恢复系和7个不同蒸煮及食味对照稻米淀粉RVA谱特征值,对其进行了相关分析和系统聚类分析.研究杂交籼稻恢复系稻米淀粉RVA谱特征值表现及类型,为恢复系及其杂交稻组合蒸煮及食味品质改良提供依据.结果表明如下:(1)恢复系RVA谱特征值变异系数最大是消减值.依次是崩解值、回复值、冷胶粘度、热浆粘度,最小是峰值粘度.(2)各RVA谱特征值表现较好相关性.RVA谱特征值3个基本粘度间,热浆粘度与冷胶粘度表现极显著正相关.峰值粘度与崩解值呈极显著正相关,与消减值和回复值均分别呈极显著负相关;热浆粘度、冷胶粘度与崩解值分别呈显著、极显著负相关,热浆粘度、冷胶粘度分别与消减值和回复值均呈极显著正相关.崩解值与消减值和回复值均分别呈极显著负相关,而消减值和回复值呈极显著正相关.(3)RVA谱特征值可分为3大类型,区分主要依据消减值,I类型消减值最高(37.4RVU~156.8RVU),Ⅱ类型消减值最低(-141.2RVU~-86.0RVU),而Ⅲ类型消减值介于两者之间(-83.6RRVU~23.7RVU;在两极端类型I类型和II类型之间区分还可依据崩解值和回复值指标.I类型亚类间区分主要依据峰值粘度和冷胶粘度,II类型亚类区分依据峰值粘度,Ⅲ类型亚类区分则比较复杂,依据峰值粘度、热浆粘度、崩解值、消减值和回复值指标组合.因此利用RVA谱特征值间接评价稻米蒸煮及食味品质时消减值作为第一和主要鉴定指标. 相似文献
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浊点萃取-高效液相色谱法测定虾肉中孔雀石绿和结晶紫残留的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
利用浊点萃取方法富集孔雀石绿和结晶紫,建立了用高效液相色谱(二极管阵列检测器)同时测定虾肉中孔雀石绿和结晶紫残留的方法,并研究了表面活性剂、盐、平衡时间及平衡温度对浊点萃取效率的影响。该分析方法应用于虾中两种物质的残留分析,结果表明:在虾肉中分别添加3个不同浓度的孔雀石绿和结晶紫,添加回收率范围分别为75.5%~80.2%(孔雀石绿)和81.4%~89.6%(结晶紫),相对标准偏差(RSD)分别为2.3%~3.1%(孔雀石绿)和1.5%~3.3%(结晶紫)。该方法的检测限分别为孔雀石绿2.0μg·kg~(-1)、结晶紫1.0μg·kg~(-1),可满足我国和欧盟对虾中孔雀石绿和结晶紫的检测要求。 相似文献
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白石砬子自然保护区主要森林类型土壤水源涵养功能研究 总被引:1,自引:1,他引:0
森林土壤作为森林生态水文功能最重要的作用层,其涵养水源的能力对调节洪水和干旱、减弱并防止土壤侵蚀具有重要作用。从白石砬子自然保护区土壤类型与植物带相一致的垂直分布规律出发,对区内主要森林植被类型下的土壤水源涵养功能进行了研究。结果表明,不同林型土壤容重大小顺序为人工红松林>鱼鳞云杉臭冷杉林>红松阔叶混交林>杂木林>蒙古栎林,且上层土壤容重均小于下层;不同林型土壤的毛管孔隙度、非毛管孔隙度、总孔隙度、含水量、毛管最大持水量、渗透速度的大小均表现为蒙古栎林>杂木林>红松阔叶混交林>鱼鳞云杉臭冷杉林>人工红松林,且每种林型的上层值均大于下层;不同林型土壤的蓄水量位于729.5~1227.8t/hm2;蒙古栎林下土壤具有最好的水源涵养功能,其次为杂木林、红松阔叶混交林、鱼鳞云杉臭冷杉林、人工红松林。 相似文献
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<正>河北承德坝上地区的塞罕坝国家森林公园总面积140万亩,是中国最大的人工林森林公园。地处坝上高原,长期为清代皇家猎苑,成就了这里独特的自然与人文景观——浩瀚的林海、广袤的草原、清澈的高原湖泊和众多清代历史遗迹。这里夏季气候凉爽,空气清新,最高气温一般不超过2 5℃;秋季层林尽染,满山遍野的枫叶,流金溢丹;冬季白雪皑皑,玉树冰花,一派北国风光。这 相似文献