鸡性连锁矮小基因研究与应用

性连锁矮小基因(dw基因)在蛋鸡、肉种鸡生产中应用较为广泛。随着矮小基因分子诊断技术日益成熟以及矮小鸡生理特性研究广泛开展,矮小基因在地方鸡遗传改良中有着美好的应用前景。基因组结构对矮小基因的影响较大,但很少有以国内地方鸡品种为遗传背景研究矮小基因及矮小鸡的生理特性。本文综述了矮小鸡生理特性研究成果,总结讨论了矮小基因在养鸡生产中的应用。     

鸡脾脏重全基因组关联分析

【目的】利用全基因组关联分析（genome-wide association study, GWAS）技术解析产蛋后期母鸡脾脏重的分子机制和遗传特征,为改善产蛋后期母鸡的健康状况提供理论依据。【方法】利用东乡绿壳蛋鸡和白来航蛋鸡构建资源群体,以72周龄F2代501只母鸡脾脏重为研究材料。首先利用高密度600 K 基因芯片对试验群体基因组进行SNPs检测。其次利用APT软件进行质控、BEAGLE软件进行基因型填充、PLINK软件进行主成分分析,GEMMA软件进行全基因组关联分析,最终获得脾脏重的显著和潜在显著关联位点。然后利用GCTA软件计算基于SNP数据的脾脏重遗传力以及染色体遗传力,并利用Haploview软件对显著或潜在关联位点进行连锁不平衡分析。最后通过显著位点区域的相关基因功能注释来筛选影响母鸡产蛋后期脾脏重的候选基因。【结果】由72周龄母鸡脾脏重的表型数据可知,在蛋鸡产蛋后期存在较大的变异系数,脾脏重的遗传力为0.236。通过基因型分析得到43万个高质量的SNP进行进一步分析。群体结构分析发现基因膨胀系数为1.042,表明试验群体没有群体分层的现象,避免了关联分析中假阳性结果的出现。利用单变量混合线性模型分析共发现了412和281个SNPs位点与脾脏重显著和潜在显著关联,位于1、4、16、28号染色体上。显著性关联位点在1号染色体161-174 Mb区间和28号染色体0.47-1.27 Mb区间,潜在性显著位点在4号染色体76 Mb区间和16号染色体175kb区间。由于显著区域可能存在的连锁不平衡,对显著性位点进行了条件分析和连锁不平衡检验,以1号染色体位点rs314001986和28号染色体上位点rs312729296进行条件分析,经分析后原先显著关联的位点均不显著,即以rs314001986和rs312729296作为候选SNP进行基因注释分析。对4号染色体和16号染色体潜在显著位点进行连锁不平衡分析,结果显示潜在性显著位点间存在强的连锁不平衡,即以性状表型方差贡献率最大的SNP rs315270535和rs314065899为候选位点进行进一步分析。参考鸡的galgal4基因组,对各显著及潜在性显著位点及区间初步筛选到KCTD4、LDB2、HEP21和PCASP2候选基因,鉴定的候选基因可能参与了脾脏生长以及免疫应答等过程。此外,将显著位点的基因型与群体的表型数据进行关联分析,发现rs314001986和rs312729296在基因型为GG时对脾脏均有增重效应。此外,基于群体的基因型数据得到1号染色体解释的遗传力为9.25%,28号染色体为4.55%。【结论】初步揭示了母鸡产蛋后期脾脏重的遗传特征,脾脏重的遗传力和染色体遗传力为首次报道。生物信息学分析鉴定到影响脾脏重的区域为新的发现,并初步筛选出4个候选基因。     

鸡脂肪酸脱氢酶基因多态性及其与脂肪酸含量的关联分析

利用PCR-SSCP技术检测安卡鸡、文昌鸡和如皋鸡△9-脂肪酸脱氢酶基因的单核苷酸多态性(SNP),并对不同基因型与胸肌脂肪酸含量进行关联分析.结果表明:在外显子6没有检测到SNP突变,在外显子2检测到T101C和C197T 2+SNP突变,共3种基因型,其中A为优势等位基因,其频率在3个鸡种中均大于0.81,该位点在各品种中均处于Haray-Weinberg平衡(P>0.05).脂肪酸含量的最小二乘检验表明,AB基因型个体的多不饱和脂肪酸(PUFA)和必需脂肪酸(EFA)含量显著高于AA和BB基因型个体(P<0.05),提示AB型可能对脂肪酸含量有重要的影响.     

基于SSR与AFLP指纹的4个鸡品种及其杂交后代的遗传特征分析

利用20对微卫星引物和6种AFLP引物组合对狄高黄鸡(T1、T2)、安卡红鸡(A)、石岐杂鸡(S)、隐性白羽鸡(D1、D2)4个鸡品种及其F1代、F2代计9个群体进行遗传特征分析,研究4个鸡种亲本间及其与F1代、F2代不同群体间的遗传关系.结果显示20个微卫星座位在9个鸡群体中共检测到126个等位基因,等位基因数最多达9个,最少为4个,获得的平均等位基因数为6.3个.9个群体平均杂合度在0.281～0.695之间,多态信息含量在0.245～0.664之间;亲本4个品种6个群体平均杂合度在0.281～0.391之间,多态信息含量在0.245～0.367之间;F1代与F2代的平均杂合度在0.601～0.695之间,多态信息含量在0.553～0.664之间;4个亲本之间的遗传距离为0.4882～0.6230,亲本与F1代的遗传距离在0.1238～0.1714,亲本与F2代的遗传距离在0.2631～0.3104, F1与F2的遗传距离为0.1322和0.1442;6种AFLP引物组合在9个鸡群体中检测到了数量不等的特异性条带,其中F2最多,为5条,亲本隐性白羽鸡最少,为1条.表明分子遗传检测结果与鸡品种(群体)的选育状况基本一致,为预测品种(系)之间的杂种优势,配套系的培育提供了科学依据,同时为从分子水平鉴定鸡品种奠定了研究基础.     

鸡蛋壳壳膜及表面角质层去除方法的优化与比较

本文拟对EDTA法、蛋白酶K法和NaOH法去除鸡蛋壳壳膜及表面角质层的条件进行优化并比较,以期获得分离蛋壳有机层和矿化晶体层的有效方法。通过SS-550扫描式电子显微镜观察发现,EDTA法中以5%EDTA处理鸡蛋壳30min的效果相对较好,能去除蛋壳内膜及尽可能多的外膜,但是表面角质层的去除效果较弱;蛋白酶K法中以50μg/mL蛋白酶K孵育鸡蛋壳48h的效果相对较好,能完全去除表面角质层和蛋壳内膜,但蛋壳外膜尚不能彻底去除干净;而NaOH法中则以2%NaOH于99℃中煮鸡蛋壳17min的效果最理想,既能彻底去除壳膜又能完全去除表面角质层。3种方法相比,去除鸡蛋壳壳膜及角质层的理想方法是于99℃的2%NaOH中煮17min。     

如皋鸡血浆酶活力研究

试验测定如皋鸡2、4、6、8、10及12周龄血浆LDH、HBDH、MAO、MDH、CK、5'-NT、ALT、ALP、ICDH、ADA等酶活力.结果表明:2～12周龄,LDH、HBDH、CK、5'-NT和ALP活力总体上呈快速下降趋势,MAO和MDH呈平稳下降趋势,ALT呈斜"Z"型,ICDH和ADA变化规律不明显.     

蛋鸡在快速黄鸡配套中的应用研究

本文介绍了快速黄鸡配套中应用蛋鸡品系的试验情况。研究结果表明，蛋鸭品系或品系组合在快速黄鸡三系配套中作为第一父本使用，在现阶段是完全可行的。     

蛋鸡在快速黄鸡配套中的应用研究（续）

2 商品肉鸡观察试验 2.1 试验材料与方法 2.1.1 素材来源 TR—83商品代种蛋为我所一室提供,红宝商品代及红宝AB种蛋引自江苏农垦第一种鸡场,B系为我所利用TR—83祖代B系漏检公鸡扩繁育成,HD、YD是本研究的父母代母本组合。     

OPAY02型标记与萧山鸡及其杂种早期生产性能相关性的研究

以萧山鸡、SR92A系鸡及其杂交后代为研究对象,以OPAY02为随机引物,将探测到的1660.8与2326.0bp的2条多态性条带分为4种遗传型,2条带同时出现的个体定为A型,1660.8bp带单独出现的个体为B型,2326.0bp带单独出现的个体为C型,2条带均不出现的个体为D型,研究OPAY02型标记与鸡早期生产性能的关系。结果表明:B型标记首次在萧山鸡、SR92A系及其杂交后代检出,其频率为9.30%;在萧山鸡群中,不同带型49日龄体重间效应显著,49、75日龄体重由高到低依次为A>C>B,而在SR92A系和SR92A×萧山的杂交后代中差异不显著,说明不同遗传群体的4种遗传型效应不同。     

隐性白羽鸡的早期发育规律研究

测定隐性白羽鸡0～12周龄体重、体尺发育规律,结果显示:①公、母鸡间体重、体尺差别明显,尤其在生长高峰以后;②体重的遗传力较高(0.36～0.57),且在生长高峰前逐渐升高、生长高峰后逐渐降低;③除个别周龄外,体尺性状的遗传力以中等为主;④12周龄性别间胫色差异不显著;⑤龙骨长、公鸡胫长在8周龄前几乎是直线生长,胸宽、母鸡胫长在6周龄前直线生长,胫围、胸角度在4周龄前生长较快,此后生长发育趋缓。