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[目的]构建猪基因表达调控数据库(GereDB),为从基因水平解释猪的生长发育规律、遗传育种和疾病防控等提供科学依据.[方法]从NCBI下载小鼠和猪的RNA序列原始数据进行序列比对,根据序列同源性将小鼠的基因表达调控信息转移给猪,并建立猪基因表达调控信息网络,整理加工后根据区域结构,以Linux为操作系统、Apache为Web服务器、MySQL为数据库、Python为服务器端脚本解释器构建猪GereDB数据库.[结果]从NCBI下载的Fast数据共包含291182条猪核苷酸序列,通过序列比对和手工整理,注释筛选出67000多条猪核苷酸序列;将小鼠的基因表达调控信息转移给猪,获得的猪基因表达调控关系链接有67027条,构建了猪GereDB数据库(http://www.thua45.cn/ge-redb-wp/),并开发GEREA生物信息学分析工具以发现猪基因表达调控因子.在猪GereDB数据库中有116个调控因子可调控100多个基因,说明其在猪转录组调控中发挥重要作用.GEREA生物信息学分析工具在已发表的猪乳腺组织数据集上进行测试,结果显示,与母猪分娩前14 d相比,分娩后1 d母猪乳腺中26个调控因子的靶基因显著差异表达(FDR<0.05),其中FGF2调控因子在母猪泌乳方面发挥重要作用.[结论]猪GereDB数据库能提供猪基因表达和调控间关系的信息,且能使用GEREA生物信息学分析工具发掘猪基因表达调控数据,有助于揭示调控因子对高通量测序差异表达基因的调控机制,为从基因水平探究猪的生长发育及疾病防控提供数据信息. 相似文献
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与《猪业科学》结缘已经多年,从其中,我们可以看出强大的编辑和策划团队聚焦于猪业,"传播猪业文化、报道猪业动态、推进猪业发展"的决心;这一华丽转身,新生的《猪业科学》成为了我们天兆猪业及众多合作伙伴最受欢迎的专业杂志。概而论之,她是系统而全面的和我们一起"憧憬未来、走近标杆、提供方案、解决问题"的最可信赖的顾问和亲密伙伴。本期的"营养与饲料"、"猪群保健"、"遗传改良"、"环境与设施"针对养猪业这一大系统中的专业版块,把握了学术研究的前瞻性,立意深远而又不乏现实指导意义, 相似文献
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春兰根状茎的增殖与分化条件优化 总被引:3,自引:0,他引:3
以春兰种子无菌萌发的根状茎为材料,采用正交设计方法,研究了春兰根状茎增殖与分化的适宜条件.结果表明,根状茎增殖适宜的培养基为1/2MS+3 mg·L-1BA+蔗糖3%+香蕉5%+琼脂0.8%,根状茎分化适宜的培养基为1/2MS+3.0mg·L-1BA+1.0mg·L-1NAA+0.8mg·L-1IBA+蔗糖3%+琼脂0.8%.使用100 g.L-1香蕉作为附加物,春兰根状茎在培养30d后重量可达初重的2.1倍.根状茎在固体培养过程中不发生褐变现象,添加活性炭能促使根状茎产生根毛类似物. 相似文献
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荞麦的营养特性及开发利用途径 总被引:2,自引:0,他引:2
荞麦中所含营养物质高于其它谷类粮食,同时具有营养和保健双重功效,发挥荞麦资源优势,利用现代化加工工艺和先进的检测方法,开发系列荞麦营养方便食品来改善人们的食物结构具有非常重大的意义。 相似文献
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茶马古道是世界上路况最为复杂、地势最高的交通驿道,这条道路不仅承载着我国古代辉煌的商贸发展史,而且也承载着许多优秀的传统文化精神。本文在对茶马古道的内涵、发展做出论述的基础上,研究探讨了茶马古道人文交流对大学生思想道德的影响。 相似文献