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为了更好地明确褐环乳牛肝菌分泌蛋白的功能,基于前期所获得327个分泌蛋白序列,对其理化性质进行分析。结果表明,69.72%的分泌蛋白理论等电点小于6.0,属于酸性蛋白,同时,利用随机数生成软件对上述不同理论等电点类别的分泌蛋白进行10%抽样分析,明确33个不同理论等电点类别的分泌蛋白(包括23个酸性蛋白、4个中性蛋白、6个碱性蛋白)的分子质量、分子式、原子数量、半衰期、不稳定性系数、脂肪族氨基酸指数、总平均亲水性等理化性质,其中14个分泌蛋白为稳定性蛋白,14个分泌蛋白为亲水性蛋白。 相似文献
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[目的]脂蛋白几乎存在于所有细菌中,其通过N端脂质结构锚定在膜中,并参与细胞膜结构构建、维护细胞膜的稳定性、信号转导和转运等过程,同时在维持其生理功能、致病性和耐药性等方面发挥着重要作用.核桃细菌性黑斑病严重危害着我国核桃产业的健康发展,然而,尚未见其脂蛋白信号肽相关研究报道.[方法]本研究基于11个核桃细菌性黑斑病菌的全基因组序列,通过LipoP v1.0在线分析程序预测,从而实现对上述细菌中脂蛋白的预测.[结果]上述细菌中总共有1718个脂蛋白,所含脂蛋白范围为148~164个,所占比例为3.62%~4.02%,脂蛋白长度集中在150~450 aa,其中长度在100~200 aa的脂蛋白数量最多,氨基酸组成以丙氨酸所占比例最高,平均为14.4%~14.8%,而天冬氨酸、组氨酸、甲硫氨酸、色氨酸的含量最低.上述菌株所含脂蛋白氨基酸长度较小,推测与脂蛋白较为灵活地实现其行使功能有关;同时,对上述蛋白特性进一步开展了研究,明确脂蛋白具有1次以上跨膜结构域不多,多数脂蛋白定位在线粒体核胞外,并且在理论等电点、不稳定系数以及总平均亲水性等方面存在着一定的差异,但是总体而言上述菌株中的脂蛋白在理化性质方面具有趋同的特性,此外,少数蛋白不具有信号肽序列,不属于典型分泌蛋白,具有转运肽的脂蛋白数量较少,且预测可靠性不高.进一步对信号肽切割位点特征进行分析,发现在上述1718个脂蛋白中,A(丙氨酸)所占比例最高,在信号肽切割位点-3、-2、-1、1、2处,A(丙氨酸)、A(丙氨酸)、C(天冬氨酸)、A(丙氨酸)、P(脯氨酸)的含量最高,且氨基酸的组成在-3和-1割位点上相对比较保守,属于A-X-C类型,即丙氨酸-任意氨基酸-天冬氨酸.最后,通过遗传关系分析发现细菌性黑斑病菌中脂蛋白序列之间在具有较高同源性以及较近亲缘关系.[结论]核桃细菌性黑斑病菌中脂蛋白在理化性质、亚细胞定位以及转运肽等方面具有趋同性特征,为进一步深入开展核桃细菌性黑斑病菌中脂蛋白的研究提供了重要的理论指导,此外,通过遗传关系分析进一步明确了与细菌性黑斑病菌中脂蛋白之间的关系,为深入探索脂蛋白在细菌性黑斑病菌中的作用奠定了坚实的理论基础.同时,核桃细菌性黑斑病菌分泌系统中SPaseI和SPaseII等不同信号肽类型的外泌蛋白在同源关系上、功能类别上是否保守,是否都具有上述研究结果的(种内、种间的)独特生物学功能还有待进一步深入研究. 相似文献
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核桃炭疽病生防菌yb33的鉴定及其次生代谢物特性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
为了较好地利用生防菌防治核桃炭疽病,采用土壤稀释平板法和对峙培养法,从核桃根际土壤中分离筛选获得了yb23、yb31、yb33、yb34菌株(其对核桃炭疽病菌的抑菌活性均在60%以上),然后对其中生防效果较好的菌株yb33进行了形态学与分子生物学鉴定,并对该菌次生代谢产物的性质进行了分析。鉴定结果表明:菌株yb33为芽孢杆菌属细菌,其与Bacillus axarquiensis的亲缘关系最近。分析结果表明:不同浓度yb33无菌滤液的抑菌效果间具有明显的差别,其在65℃及其以下温度条件下的热稳定性较好。 相似文献
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植物病原菌与其寄主相互作用过程中,关于病原菌操控植物和植物又反抗病原菌侵染的作用机制,学术界存在多种模型和假说,从最早的Flor"基因对基因"假说到警戒假说,再从警戒假说到"诱饵"假说,再到目前学术界较为认同的Zigzag理论。对这些植物与病原菌互作理论进行了总结,着重介绍了"诱饵"假说和Zigzag理论。 相似文献
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云南省三台乡核桃产业发展现状及对策分析 总被引:1,自引:0,他引:1
近年来,云南省各地积极发展核桃产业,极大地促进了当地经济的发展.大姚县三台乡作为重要的核桃生产之乡,其产业发展对于其它地区的发展具有重要的示范作用.现以云南省大姚县三台乡核桃产业的发展现状为切入点,深刻剖析其在发展过程中存在的问题,结合统计年鉴、网络资源以及调研访谈等数据,明确核桃产业发展中存在的诸如生产过程缺乏技术管理、销售渠道不通畅、深加工企业规模小等问题,并从政府、品牌、科技等方面提出了核桃产业发展对策,以期为进一步提升云南省核桃产业发展竞争力提供理论支持. 相似文献
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番茄百利品种灰叶斑病发生初报 总被引:1,自引:0,他引:1
采用病害分级调查的方法对番茄百利品种上灰叶斑病的发生情况进行田间调查,并对病情指数、发病率与气象因子之间的关系进行分析.结果表明,在我国中部种植的春播百利番茄地区,番茄灰叶斑病的发病初期为4月上旬,此时旬平均温度为12.6℃,平均相对湿度为59.20%,这段时期是控制番茄灰叶斑病的关键时期;该病扩展速度很快,在5月中旬发病达到高峰,此时旬平均温度为18.67℃,平均相对湿度为71.00%.当3月中下旬温度超过10℃相对湿度在50%以上时,应对此病进行及时预防. 相似文献
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云南省油茶产业发展现状及对策研究 总被引:2,自引:0,他引:2
油茶产业作为云南省近年积极发展的产业,其在全国油茶生产中尚处于劣势位置,如何更好地破解油茶产业发展过程中的问题,更好地促进经济发展是摆在当前较为重要的问题之一。该研究基于《2009~2020年全国油茶产业发展规划》和云南省油茶产业发展历史数据,从云南省油茶产业的分布区域、产量情况对其发展现状进行评述,同时,通过比较其他省份油茶产业的发展情况,总结云南省油茶产业发展中亟需解决的问题,为实现云南省油茶产业快速、健康、有序发展提供对策建议。 相似文献
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为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris pv.raphani 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。 相似文献