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【目的】 筛选不同温度下烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)侵染后枯斑三生烟(Nicotiana tabacum var. Samsun NN)差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),研究lncRNA在枯斑三生烟抗性反应中的作用。【方法】 N基因的温度敏感性使枯斑三生烟在25℃时具备对TMV的抗性、在31℃抗性丧失,在这两个温度条件下对枯斑三生烟接种TMV和磷酸盐缓冲盐水(phosphate buffered saline,PBS),48 h后提取系统叶总RNA,构建链特异性文库后进行深度测序。对测序结果进行过滤后利用HTSeq将有效数据与近缘品种TN90(N. tabacum var. TN90)基因组比对,筛选得到lncRNA后利用FPKM法估计lncRNA的表达水平。通过edgeR筛选差异表达lncRNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA),并利用qRT-PCR技术对这一结果进行验证。通过共定位及共表达分析预测DElncRNA的靶基因,通过参考基因组注释、GO和KEGG富集分析研究靶基因的功能。【结果】 4个处理共12个样本经lncRNA-seq各测得约8 000万条clean reads,共获得4 737条已知lncRNA、40 169条新lncRNA。其中64个lncRNA在不同温度条件下TMV侵染后存在差异表达,qRT-PCR测定结果显示这些lncRNA的测序正确率在80%左右,表明本研究所得测序数据具备较高的可信度。对DElncRNA进行靶基因预测,发现一些基因同时被25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶向。靶基因注释功能丰富,主要参与植物抗病、激素和代谢等生理过程。部分可能与激素通路相关的lncRNA,在25℃下TMV侵染时呈现下调趋势,而在31℃下TMV侵染则呈现上调趋势。GO富集分析显示靶基因主要参与构成膜、囊泡等组分,具备钙、钾离子通道抑制剂活性等分子功能,使相应离子得以转运引发随后的反应,同时也参与发病、抗原加工和呈现、细胞分裂素代谢等生理过程。KEGG分析发现靶基因显著富集在植物激素信号转导通路,25℃下调和31℃上调的DElncRNA靶基因同时富集在激素信号传导、ABC运输蛋白、苯丙烷类生物合成等通路。【结论】 不同温度(25℃和31℃)条件下TMV侵染枯斑三生烟后,长链非编码RNA差异表达,DElncRNA通过作用于激素信号传导、物质转运等过程参与寄主系统获得性抗性反应。研究结果可为揭示植物系统获得性抗性中lncRNA的调控功能以及新型抗病毒技术开发提供依据。 相似文献
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作物冻害是指气温降至冰点以下,作物因细胞间隙结冰引起的伤害。属于非侵染性病害,它是由于气候因素引起的生理性病害。1冻害发生原因当温度过低时,植物细胞内的原生质就会结冰,冰晶会刺穿细胞膜造成细胞被破坏,融化后植物细胞内的原生质流出,细胞失去活性,再加上冬季冰的升华和液态水的蒸发,最后导致植物细胞脱水。 相似文献
35.
《福建林学院学报》2019,(2)
引入地理权重回归模型进行福州市土地利用与地表温度的空间关系模拟,从格网尺度上探讨城市土地利用对地表温度影响的空间非平稳性。结果表明:建设用地、林草地和水体是影响研究区地表温度的主要土地利用类型,该3种地类对地表温度的影响存在显著的空间非平稳性:建设用地的增温作用以北部林区最强,中部建成区及耕地分布集中区域最弱;林草地和水体的降温作用均以建成区中心最强,向外逐渐减弱,在水域增加林草地或在林区增加水体则会使地表温度升高。由于地理权重回归模型是对土地利用与地表温度空间关系的局部拟合,可以体现不同土地利用对地表温度影响的空间非平稳性,可为区域土地利用与地表温度空间关系研究提供新思路。 相似文献
36.
《干旱区资源与环境》2019,(6):198-202
开展景区非使用价值动态评估是协调景区保护与开发、促进文旅融合的重要途径。基于条件价值法(CVM),依据调查问卷,借助SPSS21.0软件,以塔尔寺景区为案例地开展非使用价值动态变化及其影响因素分析。结果表明:(1)塔尔寺景区非使用价值由2014年的6.18×10~7元增长为2017年的14.44×10~7元。其中,存在价值>遗产价值>选择价值,表明人们对资源环境的保护不仅考虑了代内的持续利用,更加注重代际之间公平、有效的分配,对文化遗产的保护与传承意识具有长远性、非功利性特征。(2)游客支付意愿均受性别、收入、受教育程度和游客对景区了解程度影响。其中,男性支付意愿高于女性,但女性支付意愿增长率高于男性;游客对景区产生的情感依恋和精神认同得到不断增强,由最初的"政府有责"演变为"人人有责"。 相似文献
37.
沙型盐碱地水产养殖生态修复效果评价 总被引:2,自引:1,他引:1
为修复西北地区沙型盐碱地的土壤环境,提升盐碱土地的利用效率,以景泰县盐碱地区为试验区域,创新采用水产养殖生态修复技术,并综合评价了该技术的修复效果。结果表明:采用水产养殖生态修复技术后盐碱地区的盐度,氯化物和硫酸盐等指标呈现逐渐下降趋势,改善了当地的土壤环境,提升了盐碱土地的利用效率。发展水产养殖业也给养殖户带来了一定的经济收益,提升了养殖户发展水产养殖业的积极性,起到了良性发展的效果。本文为盐碱土地的修复治理提供一种高效生态的修复方法,并为全国盐碱地的改良提供一定的技术参考。 相似文献
38.
非洲猪瘟暴发一年多来,国内生猪产能损失过半,猪价高涨。养猪的高利润驱使一些清场的猪场投入复产,但鲜有成功案例。依据避免疫情再次暴发和持续生产的标准,猪场复产成功的关键在于净化猪场病毒、提高猪群感染阈值和恢复产能。中药具有促生长、增强繁殖能力、调理免疫能力、抗菌、抗应激和调理代谢等功能,在增强猪群非特异性免疫、提高感染阈值、减少母猪繁殖障碍和提升母猪繁殖性能等方面具有巨大的应用价值。 相似文献
39.
40.
为实现树状灌溉管网低能耗、投资节约以及灌水均匀度高等目的,构建了树状灌溉管网非线性数学模型,设定压力、管径、流速为约束条件,设计了模拟退火与布谷鸟(SACS)混合算法,结合文献[14]资料数据分别采用遗传(GA)算法、模拟退火遗传(SAGA)混合算法、布谷鸟搜索(CS)算法、SACS混合算法4种优化算法对模型进行了求解.优化结果表明,采用SACS混合算法比GA算法灌溉管长减少了16.27%、投资节约了2.13%,比SAGA混合算法、CS算法,虽灌溉管长相等,但管径得到较大的优化,投资分别节约了3.76%、17.28%,验证了SACS混合算法的有效性.最后,以贵州省石阡县龙塘大屯茶叶园区216 hm2现代水利试点区喷灌工程为例,采用SACS混合算法对喷灌工程管网进行了优化,比传统设计方法灌溉管长减少了12.08 m,投资节约了17.93%,优化效果明显,为树状灌溉工程管网优化设计提供了新的思路. 相似文献