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[目的]论证线粒体Cyt b和12S rRNA基因不同进化速率影响构建的系统树拓扑结构。[方法]从GenBank下载了蛇亚目12科15种蛇线粒体全序列,提取Cyt b和12S rRNA基因序列,选用GTR+I+G核苷酸替代模型,基于最大似然法,用PAUP4.0软件分别构建2个基因的系统关系树。[结果]在选用相同的软件、建树方法和研究物种的情况下,构建的系统树拓扑结构差异主要是因为线粒体Cyt b和12S rRNA基因进化速率不同产生的。[结论]在分子系统进化研究中,要针对不同的研究物种和研究目的,选择合适的基因构建系统进化树。 相似文献
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利用高通量测序的方法,从熊本牡蛎基因组中开发了20对具有多态性的微卫星标记,通过微卫星标记位点比较了野生群体和养殖群体的遗传多样性。野生群体中,所有位点共扩增出330个等位基因,等位基因数(N_a)范围为6~39,平均等位基因数为16.500 0;有效等位基因数(N_e)范围为1.352 9~33.361 7,平均值9.517 2;观测杂合度(H_o)范围为0.200 0~1.000 0,平均值0.671 5;期望杂合度(H_e)范围为0.265 6~0.987 7,平均值0.832 1;ShannonWeiner指数(Ⅰ)范围为0.648 3~3.585 8,平均值2.276 9;多态信息含量(PIC)范围为0.254 5~0.969 2,平均值0.803 5,共有16个位点符合Hardy-Weinberg平衡。养殖群体中,N_a平均值为10.250 0,N_e平均值为5.843 4,H_o平均值为0.639 1,H_e平均值为0.763 6,I平均值为1.791 4,PIC平均值为0.720 7。结果显示,熊本牡蛎养殖群体的遗传多样性低于野生群体,但仍然维持在高度多态水平。研究表明,在熊本牡蛎人工繁育过程中,使用大数量的亲本进行繁育,可有效防止选育群体的遗传多样性降低,但人工选育对选育群体的遗传多样性也产生了一定的影响。另外,分析了这些引物在近缘种葡萄牙牡蛎、长牡蛎、香港牡蛎、有明牡蛎、僧帽牡蛎、咬齿牡蛎以及舌骨牡蛎中的通用性情况,发现XB1-6、XB1-39和XB1-45 3个位点在8个物种中均能扩增出目的条带,XB1-41仅能在熊本牡蛎中扩增出目的条带。 相似文献
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对中国西北地区的野生穿山甲(Mains)的种群资源现状、分布及药材贸易市场进行了调查,穿山甲的药材在市场上的流通主要以甲片为主。另外,对野外种群资源现状、分布进行了调查,西北地区没有穿山甲的分布,但仍然存在穿山甲的非法贸易。为了更好的保护穿山甲资源,可以强化对非法捕猎、非法销售、非法购买等违法行为的打击,加强对中药材市场的监管,加大对穿山甲保护的宣传,发展人工养殖等。 相似文献
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中国野生动物资源丰富,然而野生动物的保护目前仍较多使用一些宏观保护策略和描述性研究手段,对其保护和评价的分子研究却相对落后。分子标记作为第四代遗传标记,自建立以来,以其多方面的优势在野生动物保护研究领域得到了越来越广泛的应用。本文介绍了限制性片段长度多态性、随机扩增多态性、扩增片段长度多态性和微卫星等分子标记的基本原理及其优缺点,综述了分子标记技术在野生动物种群遗传结构、亲缘关系和系统分类、遗传图谱构建和基因定位、物种鉴定和个体识别等方面的应用和研究概况,同时对应用前景进行了展望:分子标记技术在今后的野生动物保护研究中发挥的作用将会更加明显。 相似文献