中国荷斯坦牛MBL-C蛋白生物信息学分析

为深入了解牛MBL-C蛋白的结构功能特点、作用机制及其结构基础，以中国荷斯坦牛的MBL-C蛋白序列为研究对象，使用多种软件工具对其进行生物信息学分析。结果表明，中国荷斯坦牛MBL-C蛋白由249aa构成，不稳定指数29.71，脂肪系数68.19，亲水性氨基酸占68.46%，疏水性氨基酸占31.54%，总平均亲水性-0.403，为亲水性稳定蛋白。含Sec/SPⅠ常规信号肽，无跨膜结构域，主要定位于胞外，为经典分泌蛋白。预测到23个磷酸化位点及其对应激酶，未预测到N-糖基化位点和O-糖基化位点。分别有27.71%、4.82%、51.41%、16.06%的氨基酸参与形成α-螺旋、β-转角、无规则卷曲、延伸链，获得了可信度和质量较高的三聚体三维立体结构模型。本研究可为牛MBL-C蛋白结构与功能、作用机制阐释乃至牛抗性遗传、分子育种等深入研究提供参考。     

利用酵母双杂交技术筛选和鉴定非洲猪瘟病毒E120R蛋白的互作宿主蛋白

【目的】 探讨非洲猪瘟病毒（African swine fever virus，ASFV）衣壳蛋白E120R在病毒感染中的作用，确定与E120R蛋白互作的宿主蛋白。【方法】 将ASFV分离株CADC_HN09株E120R基因合成并克隆于pGBKT7表达载体，获得pGBKT7-E120R诱饵质粒，同时构建E120R基因截短表达质粒pGBKT7-E120R-1（1－61位氨基酸）和pGBKT7-E120R-2（62－122位氨基酸）。经毒性和自激活性检测后，通过酵母双杂交技术对骨髓巨噬细胞（BMDMs） cDNA均一化酵母文库进行初步筛选，以获得与ASFV E120R蛋白互作的蛋白。通过NCBI数据库进行序列比对并经免疫共沉淀试验验证，确定互作的宿主蛋白。筛选的宿主蛋白经webgenstal在线分析网站初步进行GO功能和KEGG通路富集分析，以确定所筛选的宿主蛋白参与的生物过程与信号通路。【结果】 诱饵质粒pGBKT7-E120R-2无毒性和自激活性，可用于文库筛选。通过酵母双杂交系统从BMDMs cDNA均一化酵母文库中初步筛选到46个阳性克隆并进行回转验证，经NCBI数据库序列比对分析共获得29个宿主蛋白。免疫共沉淀试验结果显示，多聚胞嘧啶结合蛋白2（PCBP2）和干扰素刺激基因15（ISG15）均与E120R蛋白存在互作。GO功能富集分析表明，所筛选的宿主蛋白可参与代谢过程、生物调节、应激反应等生物过程；KEGG通路富集分析表明，这些宿主蛋白可参与抗原呈递、铁死亡和坏死性凋亡等多条信号通路。【结论】 ASFV E120R蛋白可与宿主免疫应答、细胞死亡等信号通路相关的多种宿主蛋白互作，为进一步研究ASFV E120R蛋白在病毒感染过程中的作用提供了重要理论依据。     

复合益生菌对大肠杆菌的抑菌性能及在断奶仔猪上的应用研究

试验旨在研究复合益生菌抑菌效果以及对断奶仔猪生长性能、胃肠道pH和肠道菌群的影响。采用打孔法证实复合益生菌对被试5株大肠杆菌均具有抑菌效果，共培养法证实复合益生菌能够显著抑制大肠杆菌BLCC8-0102(O78)增殖；选择48头体重相近的断奶仔猪随机分成2组，对照组饲喂基础饲粮，试验组在基础饲粮中添加2.0‰复合益生菌，每组4个重复，每个重复6头。预试期3 d，正试期28 d。结果表明：与对照组相比，试验组仔猪平均日增重显著提高，耗料增重比、腹泻率显著降低，胃、十二指肠、空肠内容物pH显著降低，粪便中大肠杆菌数量显著降低，乳酸菌活菌数显著升高。综上，复合益生菌能够显著抑制大肠杆菌生长，显著提高断奶仔猪生长性能，改善肠道菌群平衡，降低肠道pH。     

基于组合熵权RSR法的董志塬沟谷发育评价

黄土沟谷的发育演化进程研究对于发掘沟谷形成与土壤侵蚀的内在机理，指导黄土地区生态修复有深刻的指导意义。基于沟谷水平空间、气候、沟谷点线面特征选取10个沟谷发育程度量化指标，利用组合熵权RSR法优异的多因子综合性分档评价能力建立董志塬沟谷发育阶段分级评价模型，探究黄土沟谷的发育演化及分布规律。研究发现：(1)基于熵权法计算归一化植被指数(NDVI)所占权重最高为16.08%，其次为沟谷密度(15.621%)，两者是判断沟谷发育程度的重要指标。(2)基于组合熵权RSR法将董志塬82条沟谷发育程度分为幼年期、青年期、壮年期和老年期，壮年期和老年期沟谷面积占比为88.48%，董志塬东部及北部发育程度较高，对于塬面侵蚀强烈。(3)沟谷发育程度与其下伏古地貌、构造地质和黄土厚度有着高度相关性。(4)模型方差一致性检验显著性水平P<0.001，线性回归拟合优度R²为0.986，评价模型表现良好。