7种负蝗酯酶同工酶的比较

采用聚丙烯酰胺垂直板凝胶电泳（PAGE）的分析方法研究了短额负蝗Atractomorpha sinensis、柳枝负蝗A．psittacina、令箭负蝗A．sagittaris、长额负蝗A．1ata、奇异负蝗A．peregrina、云南负蝗A．yunnanensis和纺梭负蝗A．burri的酯酶（EST）同工酶。结果表明，7种负蝗共显出24条酶带，依各酶带迁移距离的不同，可以将其分为6个泳动区。7种负蝗各有其酶谱特征，种间的酶谱差异明显，彼此易于区分。同时，7种负蝗都同时在ESTV和ESTVI区各自出现了1条活性很强的酶带，推测可能是负蝗属的特征带。聚类结果显示，云南负蝗与纺梭负蝗的亲缘关系最近，与令箭负蝗的关系最远。     

利用GenBank中大量葡萄EST序列分离有效基因的电子表达分析平台

 【目的】充分利用GenBank上的大量葡萄EST序列,建立本地化基因电子表达分析平台,实现基因表达模式的大规模快速分析。【方法】利用生物信息学方法对GenBank上的362 193条葡萄EST序列进行本地化及后续处理,建立电子分析平台,并通过RT-PCR技术对其电子分析准确性进行验证。【结果】建立了包含叶、花等11个组织类别和GA3等5个胁迫类型的基因电子表达分析平台。通过VvAG、VvCHS、VvF3H、VvLDOX等4个葡萄基因的RT-PCR和电子表达分析结果比较发现,平台预测效率较高,在预测EST来源数较多的果实、花序、花组织的表达效果较好,而对叶等EST来源较少的组织的预测效果需结合试验判断。随着dbEST库中源于葡萄各组织EST序列数量的大量增加,平台的预测效果将更加符合基因表达的实际情况。【结论】葡萄基因电子表达分析平台预测效率较高,为葡萄基因大规模快速表达分析以及重要相关信息的挖掘提供了很好的分析工具。     

蜜蜂(Apis mellifera)腺苷酸转移载体基因cDNA的电子克隆

 以果蝇腺苷酸转移载体基因cDNA序列为信息探针,对蜜蜂EST数据库进行同源检索筛选,克隆了蜜蜂腺苷酸转移载体基因(Am　ant)的cDNA序列(GenBank登记号为AY332626),该基因全长1 251bp。经RT-PCR克隆、序列分析验证,结果表明与电子克隆序列完全一致;该基因具有完整的开放阅读框架(ORF),编码蛋白为300个氨基酸,通过对人、果蝇、家蚕及烟草天蛾的腺苷酸转移载体蛋白序列比较,发现该基因具有高度的保守性;说明根据物种间同源基因序列,进行跨物种EST数据库的同源检索筛选、拼接,是基因克     

纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析

 为分析柑橘果实贮藏过程中枯水相关特异基因的表达情况,以纽荷尔脐橙（Citrus Sinensis Osbeck）采摘后贮藏至略见枯水果实的果肉为测验方（Tester）,以刚采摘果实的果肉为驱动方（Driver）,采用抑制性差减杂交（Suppression Subtractive Hybridization,SSH）技术成功构建了贮藏果实差减cDNA文库,共获得656个阳性克隆。随机挑取克隆进行菌液PCR分析,插入片段长度主要集中在100 ~ 1 000 bp。成功对213个克隆进行测序,获得有效序列143条,经序列分析,共得到53条uniESTs序列。在NCBI基因库中对这53个uniESTs进行BLAST分析,比对结果参照MIPS的分类标准,按功能分为14类,其中参与代谢、能量及蛋白合成的ESTs最多,分别占到了全部ESTs的17%、11%和13%。     

Effect of hot air,UV-C,white light and modified atmosphere treatments on expression of chlorophyll degrading genes in postharvest broccoli (Brassica oleracea L.) florets

Several treatments were applied in order to delay postharvest degreening in broccoli florets and investigate their effects on genes associated with chlorophyll catabolism. Degradation of chlorophylls is the most evident visual manifestation of broccoli postharvest deterioration, occurring rapidly due to the immature stage in which the material is harvested. Treatments such as storage in modified atmosphere, exposure to hot air, UV-C and white lamps were employed in the current work to induce a delay in degreening and chlorophyll degradation. Expression of genes possibly related to chlorophyll catabolism was analyzed in these samples and discussed. Chlorophyllases, the enzymes traditionally believed to remove the phytol side chain from chlorophyll appear to have a gene expression that was not regulated by postharvest treatments. Pheophytinase, a recently discovered new enzyme in this metabolic pathway, correlated chlorophyll loss accurately in heat, UV-C and white-light treatments, but not in modified atmospheres. Results presented in this work indicate that postharvest treatments that delay chlorophyll degradation have a higher effect on the expression of pheophytinase rather than on chlorophyllase genes.     

马蔺不同生长阶段嫩叶POD和EST同工酶分析

利用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,检测了11份不同居群马蔺种质材料叶片过氧化物酶（POD）、酯酶（EST）同工酶的2个酶系统22个同工酶位点,分析马蔺营养生长和生殖生长阶段的同工酶变化。结果表明,11份马蔺种质叶片共有13种POD酶带,9种EST酶带,其中,基本谱带8条,特征谱带4条;与生殖生长阶段相比较,马蔺营养生长阶段E...     

茶树EST-SSRs信息分析

从NCBI公共数据库中公布的茶树表达序列标签中获得12378条茶树EST,通过CAP3软件进行拼接去冗余后再用Bathprimer3 vl.0(http://wheat.pw.usda.gov/demos/BatchPrimer3/)在线软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列。结果表明:通过前处理得到全长为2 307.014kb的无冗余EST4779条,从中检索出27种重复基元类型共207个SSR,分布于156条EST中,出现频率是3.26%。其中包括二核苷酸重复72个(34.78%),三核苷酸重复88个(42.51%),四核苷酸重复31个(14.98%),五核苷酸重复16个(7.73%)。AG/CT和ACC/GGT分别是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复的86.11%和25.00%。     

梅山猪、大白猪和梅大杂交猪背最长肌中差异表达的14个表达序列标签的分离、鉴定及组织表达分析

为了揭示猪杂种优势的分子机理,利用mRNA差异显示技术研究梅山猪,大白猪和梅大杂交猪背最长肌中基因表达的差异,分离14条在杂种与纯种背最长肌中差异表达的表达序列标签(EST),并用半定量RT-PCR鉴定.核苷酸序列分析表明,这14个EST与已知的基因或表达序列标签没有明显的同源性,随后这14条EST被提交到GenBank数据库.组织表达谱分析揭示了这些EST在心、脾、肝、肾、小肠、卵巢、肺等绝大多数组织中表达,说明这些基因对生命过程很重要.这些研究结果表明梅山×大白杂交组合的杂种与纯种之间的不同基因差异表达的方向存在巨大差异,猪杂种优势可能是在一定阶段有诸多不同的必不可少的基因向各种方向差异表达共同作用的结果.     

内蒙古2种菜蝽酯酶同工酶比较研究

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对内蒙古新疆菜蝽（Eurydema maracandicum Oshanin）、巴楚菜蝽（Eurydema wilkinsi Distant）2个种以及同种内不同种群、不同性别、个体间EST同工酶进行比较研究。结果表明，2种菜蝽的EST同工酶谱中均有各自的特征酶带。聚类图显示，2种菜蝽同种内不同种群、不同个体、性别间存在差异，且性别差异大于个体差异，但小于种间差异。     

木本植物中EST—SSR的通用性及其多态性研究

基于表达序列标签（EST）的SSR标记因开发简便、快捷等特点,已在植物研究中得到广泛应用。简要列举木本植物中EST—SSR的可利用性和通用性,重点综述EST—SSR的多态性及其在木本植物遗传多样性评价方面的应用,期望为今后的相关研究提供参考。