用RT-qPCR方法评价4个不同猪品种骨骼肌候选内参基因

【目的】寻找合适的规范化策略研究猪骨骼肌相关基因。【方法】筛选TATA结合蛋白（TBP）、次黄嘌呤磷酸核糖基转移酶（HPRT）、核糖体蛋白L4(RPL4)、肽基脯氨酸异构酶A (PPIA)、β-2微球蛋白（B2M）、酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶活化蛋白（YWHAZ）、β-肌动蛋白（ACTB）和甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH） 8个候选内参基因，选取国外引进的长白、约克与杜洛克公猪，进行三元杂交生产的商品猪（DLY），长白、约克猪进行二元杂交的商品猪（LY），成华猪和藏猪共4个品种进行基因表达正常化评价。采用geNorm、NormFinder和BestKeeper3种常用算法评估候选内参基因的稳定性。将3种常用算法的结果进行综合排名。【结果】8个候选内参基因在不同猪种中表现出较高的表达稳定性，但表达循环阈值不同。【结论】运用3种不同的评估算法可以筛选出相似的候选内参基因，该结果可为猪骨骼肌基因表达RT-qPCR分析内参基因的选择提供参考。     

基于SNP芯片挖掘伍隍猪新遗传材料

为进一步了解伍隍猪与内江猪在群体结构、基因组信息、遗传进化上的差异，本研究主要利用50K SNP基因芯片，分别对131头伍隍猪个体和156头内江猪个体进行基因分型。结果表明：2个品种群体间的亲缘关系相对较远但存在一定的遗传联系。伍隍猪保种群的多态性标记比例（0.641 9）大于内江猪保种群（0.506 0）；且伍隍猪的LD衰减速度大于内江猪；群体有效含量分析表明2个品种在219世代内相对缩减了96.68%；进化树显示出伍隍猪、内江猪与四川其他猪种分离，但在2个群体内部有明显区分；ROH鉴定与选择信号分析发现伍隍猪在繁殖性能与耐受性等方面受到了正向选择。该结论为伍隍猪种质资源开发、利用提供了重要理论依据。     

伍隍猪和内江猪拷贝数变异差异与嘴型全基因组关联分析

【目的】探究伍隍猪与内江猪群体之间全基因组拷贝数变异（CNV）差异，并寻找影响伍隍猪嘴型性状的候选基因。【方法】基于50K SNP芯片数据，使用PennCNV和R-Gada检测131头伍隍猪与156头内江猪全基因组拷贝数变异差异，并通过全基因组关联分析（GWAS）筛选伍隍猪嘴型性状候选基因。【结果】伍隍猪的平均嘴长[（11.12±2.78） cm]显著长于内江猪[（5.04±1.26） cm, P<0.05]。伍隍猪相较于内江猪缺失型CNV增加；获得型CNV减少。拷贝数变异区域注释后的差异基因主要富集在破骨细胞分化、能量代谢、神经退行性病变等通路。GWAS分析共得到11个基因与嘴型相关。【结论】通过检测伍隍猪与内江猪群体间拷贝数变异差异，鉴定到GORASP2、CWC22、TMEM64为嘴长表型的候选基因，为后续伍隍猪遗传资源的鉴定提供新证据。     

lncRNA参与农业动物产仔数调控的研究进展

长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNAs)是一类长度大于200 nt，不具备编码蛋白能力的RNA，但可以通过结合核酸及蛋白质等在动物体内行使作用。农业动物产仔数作为一类重要的繁殖性状，直接影响养殖经济效益。随着对lncRNA的不断深入研究，发现越来越多的lncRNA在表观遗传、转录和转录后等多个层面调控基因表达，在卵细胞的形成、妊娠的建立以及早期胚胎的发育等影响产仔数的关键步骤中扮演着重要角色。本文就当前lncRNA作用机制进行简单概述，并在此基础上结合近年来lncRNA在农业动物产仔数方面的研究进展进行综述，为研究lncRNA参与动物繁殖系统发育和产仔数性状调控等方面提供参考。     

品种和季节效应对公猪精液品质的影响

随着我国生猪养殖的规模化程度不断加深,对于养猪科技的要求也越来越高,人工授精技术和精液保存技术是规模化养殖过程必不可少的技术。品质优良的精液对于生猪生产意义重大,对于猪的遗传改良具有决定性作用,并且鲜精的精液品质直接影响冻精质量和产量。鲜精精液品质是衡量种公猪种用价值的一项重要指标,种公猪精液品质的评价指标主要有采精量、精子活力、精子密度及总精子数等,精液品质属于中等遗传力性状,受到遗传因素和非遗传因素共同影响。