猪MX1基因第8内含子多态性及与生产性状的关联分析

对猪MX1基因第8内含子进行了克隆、测序,结果发现在167 bp处发现1个G/A突变,引起HpaⅡ酶切多态。利用PCR-RFLP方法对国内外6个猪种MX1基因第8内含子的多态性进行分析,发现在大白、长白、通城、清平、鄂西黑猪、大梅F2代等6个品种中等位基因B的基因频率分别为0.83、0.89、0.94、0.87、0.89和0.55;在180头大梅F2代资源家系中进行性状关联分析发现MX1基因第8内含子的多态性与屠宰率、瘦肉率、眼肌高显著关联,屠宰率、眼肌高加性效应显著;眼肌高、瘦肉率显性效应显著。     

大白猪繁殖性状全基因组关联分析

本研究利用全基因组关联分析（GWAS）挖掘与大白猪总产仔数（TNB）、产活仔数（NBA）和健仔数（NHP）相关的候选基因。选择1 100头大白猪为实验材料，通过提取耳尾组织样DNA并利用“中芯一号”芯片进行基因型分型，采用PLINK v1.9对获得的基因型数据进行质控后用于GWAS研究。rMVP软件对每个SNP与性状做关联分析，确定出显著位点。结果表明：对于TNB性状共有3个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著；NBA性状共有4个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著；NHP分析得到18个SNPs呈基因组水平或染色体水平显著。在上述显著SNPs附近共有23个候选基因，根据基因功能注释推测ESR1、ZP3、YWHAG、HSPB1、MDH2、PCCB是能够影响繁殖性状的重要候选基因。     

猪EEPD1基因变异筛选鉴定及其对猪肌内脂肪含量性状的影响

随着社会经济发展与人民生活水平的不断提升，猪肉品质越来越受消费者重视。肌内脂肪（IMF）含量性状是影响猪肉品质的一个关键性指标。本研究发现猪EEPD1基因在肌内脂肪高低组硒都黑猪个体背最长肌组织中差异表达，并进一步利用混合DNA样本池PCR测序法在硒都黑猪群体中筛选鉴定出猪EEPD1基因g.123857C>G、g.123907 A>G、g.124024 A>G、g.124050G>A、g.124222 A>G等5个SNP变异位点。经关联分析后发现这5个SNP位点均显著影响IMF性状。其中g.123907 A>G、g.124024 A>G和g.124050 G>A3个位点紧密连锁，所组成的单倍型也与IMF性状显著相关。生物信息学分析还发现，这5个SNP位点虽然不显著影响EEPD1蛋白结构，但是会导致其mRNA二级结构及稳定性发生变化，推测它们主要通过影响EEPD1蛋白翻译效率进而影响IMF性状。综上，本研究新发现了5个猪肉质性状的分子育种标记，为实现猪肉质性状的快速改良充实基础。     

硒都黑猪新品种选育进展报告

为更好地保护和开发利用湖北省优良地方猪种，满足优质种猪需求及多元化优质猪肉消费市场需求，本研究以地方品种恩施黑猪为基础，引入梅山猪和培育品种湖北白猪血缘，开展了硒都黑猪新品种培育。通过杂交亲本选择、杂交育种、基础群组建及6个世代的持续选育，新品种初产母猪总产仔数11.29±2.16头/窝、产活仔数10.74±2.06头/窝，经产母猪总产仔数12.67±2.43头/窝、产活仔数11.71±2.27头/窝；达90 kg体重日龄178.3±14.16 d，育肥期日增重646.77±47.16 g、饲料转化率2.84±0.22；体重达100 kg左右时屠宰，屠宰率70.63±2.14%，瘦肉率52.96±2.45%，肌内脂肪含量3.42±0.34%。硒都黑猪新品种的培育完全利用国内自有资源，充分发挥了亲本优势，繁殖性能好、生长速度适中、肉质优良，且耐粗饲、适应性良好，其育成将给我国地方猪的开发与利用、发展优质猪生产提供新的思路。     

硒都黑猪屠宰和体尺性状的主成分分析和聚类分析

为探究硒都黑猪屠宰性状和体尺性状之间的相关性，准确高效地选择优良种猪，本研究采用主成分分析和聚类分析对硒都黑猪的20项指标进行分析并归类。结果表明，屠宰性状和体尺性状之间存在不同程度相关性。由主成分分析可知，硒都黑猪屠宰性状和体尺性状可以综合成7个主成分，累计贡献率为80.18%，并构建综合评分方程：Y=0.14X₁+0.16X₂+0.08X₃+0.06X₄+0.14X₅+0.06X₆+0.06X₇+0.03X₈–0.05X₉–0.09X₁₀+0.08X₁₁–0.02X₁₂–0.07X₁₃+0.04X₁₄+0.10X₁₅+0.04X₁₆+0.14X₁₇+0.13X₁₈+0.10X₁₉