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达摩麝凤蝶是一种亟待保护的珍惜濒危物种,然而目前我们对其自然资源的分布状况了解十分匮乏,只有零星的野外数据,这对于达摩麝凤蝶的保护工作十分不利。因此,通过物种分布模型来预测其潜在适生区是掌握其自然资源分布的有效手段。同时,达摩麝凤蝶与贯叶马兜铃(濒危物种)之间存在特异性寄生的关系。这种强种间相互作用在以往的物种分布模型研究中往往被忽视,但近来一些研究表明,种间关系在对有强烈相互作用的物种进行分布预测时可能是非常重要的影响因子。因此种间关系在达摩麝凤蝶的适生区预测中可能是不可忽略的因子。本文使用最大熵模型(MaxEnt),设置了Ma(仅考虑非生物因子)、Mb(仅考虑种间关系)、Mc(寄主植物的潜在分布)和Md(同时考虑非生物因子和种间关系)4个模型对达摩麝凤蝶的适生区进行了预测,并对Md模型使用通径分析量化非生物因子和种间关系因子对达摩麝凤蝶潜在适生区的影响。结果显示,各模型的预测精度都较高(AUC>0.9),考虑了种间关系的2个模型拟合结果表现较好(AIC:Ma>Mc>Md>Mb)。加入种间关系后得到的分布区面积明显缩小(高适宜区面积:Ma>Mc>Mb>Md)。刀切法结果表明,种间关系在预测中的贡献率最高。通径分析结果表明Mc模型(即种间关系)对Md模型预测的直接通径系数(0.578)和决策系数(R 2=0.546)均为最高。综上所述,种间关系是达摩麝凤蝶潜在分布最主要的影响因子,其在达摩麝凤蝶的适生区预测中有不可忽视的影响。 相似文献
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该文论述了生物多样性的含义,分析了衡水市生物多样性总体现状,提出了生物多样性保护与建设的原则,生物多样性保护与建设的基本思路。针对衡水市生物多样性保护与建设规划,生物多样性保护行动措施及生物多样性管理对策进行了深入探讨研究,提出了具体实施措施。 相似文献
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玉米穗粒腐病差异表达基因的生物信息学分析 总被引:2,自引:0,他引:2
结合基因功能分类体系(Gene Ontology,GO)对筛选得到的玉米穗粒腐病差异表达基因片段进行全面生物学功能注释。以抗玉米穗粒腐病的自交系Bt-1为材料,接种串珠镰刀菌(Fusarium moniliforme),对接菌后96 h的玉米苞叶样品以玉米全基因组基因芯片进行大规模筛选,利用分子注释系统(Molecular Annotation System,MAS)对筛选得到的基因片段进行GO分子功能注释,分析特征基因的功能。结果表明,利用基因芯片从抗性材料Bt-1中获得的482条差异代表序列,GO注释获得大量重要信息,对应的基因注释包括分子功能、生物过程和细胞组分3个层次。GO能够准确预测与玉米穗粒腐病相关抗病基因的功能,对于了解表达基因之间的相互关系和深入挖掘、理解高通量数据等方面的具有重大帮助,是研究抗病基因不可或缺的生物学信息手段。 相似文献
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试验旨在探究鼠灰色(agouti signaling protein,ASIP)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)形成的单倍型及皮肤组织差异表达mRNA对水貂被毛色素沉积的影响。通过PCR扩增、Sanger测序技术对金州黑水貂、红眼白水貂和名威银蓝水貂ASIP基因进行SNPs单倍型检测分析,利用实时荧光定量PCR技术检测3种毛色皮肤组织ASIP基因的表达量,分析单倍型及mRNA差异表达与毛色表型的相关性。结果表明,301个样本中共检测到10个SNPs,内含子2中4个SNPs(G18A、A159G、G235T、C1189T)共形成10种单倍型(Hap1~Hap10),其中Hap1(GAGC)和Hap2(GAGT)是3种不同毛色水貂群体的共享单倍型;部分内含子3中6个SNPs(C252T、A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)形成4种单倍型(Hap1~Hap4),且Hap2(CCCGCC)是名威银蓝水貂群体的主体单倍型。5个位点(A290C、G298C、A340G、T343C、T379C)均处于完全连锁不平衡状态。实时荧光定量PCR检测显示,金州黑水貂和名威银蓝水貂ASIP基因mRNA表达量分别是红眼白水貂的1.25和0.95倍,三者间差异不显著(P0.05)。研究结果初步提示,ASIP基因调控水貂不同毛色表型形成的分子机制可能存在差异。 相似文献
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用生物信息学挖掘玉米中的microRNAs及其靶基因 总被引:3,自引:1,他引:2
microRNA (miRNA)是一类内源性的、19~24碱基长度的小分子非编码RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达,在多细胞生物的基因表达调控过程中扮演着十分重要的角色。植物中的miRNAs具有高度的保守性,这为通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路和途径。本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的miRNAs与玉米EST和GSS数据库的比对,并设置一系列严格的筛选标准,共筛选到23条新的玉米miRNAs;利用WMD 3在线植物miRNAs靶基因预测软件,对新发现的玉米miRNAs进行靶基因预测,总共预测到89个靶基因,进一步功能分析发现这些靶基因参与玉米的生长发育、信号转导、转录调节、新陈代谢及逆境胁迫响应等调控过程。 相似文献
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[目的]构建河南华溪蟹(Sinopotamon henanense)金属硫蛋白(MT)的原核表达载体。[方法]以大肠杆菌DH-5α中的pGEM-MT质粒为模板,PCR扩增目的片段并连接至pGEM-T载体。然后,亚克隆至pQE31表达载体,转化大肠杆菌DH-5α感受态细胞。[结果]PCR扩增目的片段产物大小约为220 bp,与预期大小一致。重组质粒pQE31-MT双酶切鉴定结果也与预期相符。[结论]成功构建了MT原核表达载体,为今后表达并纯化MT提供了材料。 相似文献