猪耳组织DNA的快速提取

采用一步法提取的猪基因组DNA,可直接用于PCR扩增、单链构象多态性(SSCP)分析及测序。操作步骤为:采取新鲜猪耳组织2～10mg,蛋白酶K消化,55℃1h,滤纸过滤消化产物。取孔径为1.2mm的滤纸(含有足量的DNA)作为模板进行PCR扩增。结果表明,提取的基因组DNA质量较高,PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳和SSCP分析后可见清晰的条带,可进一步用于克隆测序。滤纸上的DNA干燥后可常温保存。该方法简单、快速,成本低,效率高,适用于大批量的基因分型,也可用于提取不同组织的基因组DNA。     

河北省大白猪繁殖性状基因组选择参考群体构建和应用

联合育种是我国生猪遗传改良计划的重要工作，联合育种能够扩大群体规模，增加群体内遗传变异，提高育种值估计的准确性，且相较于传统育种方法对低遗传力的繁殖性状有着更明显的效果。本研究收集了河北大好河山养殖有限公司、河北裕丰京安养殖有限公司、石家庄清凉山养殖有限公司（以下分别简称大好河山、京安和清凉山）3家育种场共6 790条大白猪的繁殖性状，构建了基因组选择合并参考群体，通过基因型填充将纽勤50K(Geneseek)芯片基因型填充到液相50K，采用一步法进行基因组联合遗传评估。结果表明：清凉山与裕丰京安两场遗传背景相近，大好河山场与其他两场存在较远的联系；基于系谱信息预测大好河山个体的总产仔数育种值准确性为0.170，基因组预测准确性则为0.324；通过联合基因组遗传评估，总产仔数基因组预测的准确性进一步提升至0.347，比基于单场系谱信息提高了104%。本研究表明通过基因型填充统一各场SNP芯片类型，构建河北省大白猪繁殖性状基因组选择参考群，从而进行联合基因组选择是可行的，尤其对提高常规育种进展缓慢的繁殖性状意义重大。     

家蚕大规模基因组重测序列入2009中国十大科技进展候选条目

中科院院士工作局、中国工程院学部工作局、科学时报社组织两院院士评选2009年中国十大科技进展新闻和世界十大科技进展新闻。西南大学与深圳华大合作完成的家蚕大规模基因组重测序研究列入候选条目，该成果发表在2009年《Science》上。     

我国科学家成功绘制出小麦D基因组草图

由中国农业科学院作物科学研究所与深圳华大基因研究院等单位合作,历经五年的努力,在国际上率先完成了小麦D基因组供体种——粗山羊草基因组草图的绘制,结束了小麦没有组装基因组序列的历史,标志着我国的小麦基因组研究跨入了世界先进行列。该项成果日前在线发表在《Nature》杂志上。     

一种用于桑RAD-Seq高通量测序的基因组DNA提取方法

[目的]筛选一种能够得到高质量桑树基因组DNA的方法。[方法]采用天根试剂盒法(Plant Genomic DNA Kit离心柱型),并稍加改进,从11个桑种的新鲜嫩叶中提取DNA。[结果]该方法简单快速,不需要复杂仪器,且能有效地除去桑叶中的多糖、多酚、蛋白质等杂质,得到的DNA能够满足RAD-Seq高通量的测序要求。[结论]建立了一种用于桑RAD-Seq高通量测序的基因组DNA提取方法。     

基于F基因的统一命名法减少NDV分型差异

新城疫病毒(NDV)或禽1型副黏病毒(APMV-1)包括了多个具有单链负股RNA基因组的病毒。长期以来,同时采用2个系统对NDV分离株进行谱系或基因型分类,导致命名混乱和基因群归类的差异。因此,     

鸡传染性支气管炎病毒SD060311株和GD080122(肾型)株的全基因组序列分析

通过对鸡传染性支气管炎病毒(IBV)分离株SD060311和GD080122(肾型)的基因组进行RT-PCR扩增和基因序列测定,结果表明其基因组大小分别为27 788 nt和27 407 nt,与已报道的IBV全基因组序列大小不完全一致,但基因组编码基因的顺序与已报道的IBV一致,均为5′cap-Replicase-S-3a-3b-3c-M-5a-5b-N-poly (A)3 ′.与已报道的IBV毒株和火鸡冠状病毒进行比较,绘制系统进化树,结果显示,SD060311和GD080122(肾型)分离株自成一支,与中国分离株BJ株和A2株的亲缘关系最近.本研究不仅丰富了冠状病毒的生物信息数据库,且为进一步研究IBV致病机理和变异机制等奠定了基础.     

牦牛基因组研究成果揭示高原适应的遗传学机制

由兰州大学主导、深圳华大基因研究院以及中科院昆明动物所等多家单位联合完成的牦牛基因组研究成果于7月1日在国际著名杂志《自然-遗传学》（NatureGenetics）上在线发表（http：Hwww．nature．com／ng／journal／vaop／ncurrent／full／ng．2343．html）。     

英绘制出青蒿基因组图谱

<正>英国研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们已经绘制出了青蒿的基因组图谱。青蒿中提取的青蒿素是重要的抗疟疾物质,因此将来通过基因改良有望大大提高青蒿素产量,生产更多抗疟药物。     

中国工程院院长周济院士一行考察家蚕基因组生物学国家重点实验室

2012年6月26日，中国工程院院长周济率旭日干院土、方智远院土、傅廷栋院士、罗锡文院士、吴孔明院士来到了西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室考察指导。周院长一行的到来，得到西南大学的高度重视，学校黄蓉生书记、张卫国校长、李明副校长、周常勇副校长等到现场陪同考察。向仲怀院士作为院士团成员随团活动，同时也作为实验室领导热情接待了院士团一行。