湘西黄牛LPL基因exon5的多态性与生长性状的相关性

脂蛋白脂酶(LPL)是机体脂质和脂蛋白代谢的关键酶,在脂质代谢、转运和能量代谢方面发挥着重要作用,影响着动物的生长发育。为探讨湘西黄牛LPL基因的分子遗传特征和寻找与生长性状相关的分子标记,采用PCR产物测序的方法检测了湘西黄牛LPL基因的SNP位点,并进行了LPL基因exon 5的g.365458G>A位点进行了群体遗传多态与生长性状的关联分析。SNP检测结果表明,LPL基因在Intron 4上新发现了3个SNP(g.365186A>C、g.365248C>T和g.365249C>T),在exon5的182 bp处检测到了1个SNP(g.365458G>A)。g.365458G>A位点的多态性检测结果表明,g.365458G>A位点存在AA、AG和GG 3种基因型,呈中度多态,且达到了Hardy-Weinberg平衡状态。多态性与生产性状的相关性分析结果表明,湘西黄牛AA基因型个体的体高和胸围显著大于GG基因型个体(P<0.05),AA基因型个体的体长和体重极显著大于GG基因型个体(P<0.01)。A等位基因对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重都为正效应,而G等位基因都为负效应。推测LPL基因exon5的g.365458G>A位点有可能作为湘西黄牛生长性状的分子遗传标记位点。     

地方本科院校《生物信息学》常用数据库和软件的合理化利用

《生物信息学》是一门实践性很强的课程,可为生物科学专业学生深入学习生物化学、分子生物学、遗传学等主干课程奠定基础。考虑到地方本科院校的实际,该文阐述了地方本科院校开设《生物信息学》的课程定位,介绍了适合地方本科院校《生物信息学》教学的常用数据库、软件和在线工具,并提出了合理化利用建议,供《生物信息学》课程教师参考。     

牛FoxO1基因启动子转录调控分析

为鉴定牛叉头框转录因子1(Forkhead box,FoxO1)的核心启动子区及其关键转录因子,利用PCR扩增牛FoxO1基因的启动子序列,同时设计7个逐段缺失片段引物扩增其启动子逐段缺失片段,进一步将其构建双荧光素酶报告载体并分别转染小鼠C2C12和3T3-L1细胞系,通过检测不同缺失片段荧光素酶报告载体的活性,以确定牛FoxO1启动子的核心区域;使用Genomatix和JASPAR在线软件预测牛FoxO1基因启动子核心区域的关键转录因子,采用定点突变试验在小鼠C2C12细胞系中初步鉴定预测的关键转录因子对FoxO1的转录调控作用。结果表明:1)成功扩增了牛FoxO1的启动子区1 920 bp序列,获得了FoxO1基因启动子序列的7个逐段缺失片段序列;2)经双荧光素酶报告试验进一步证实,牛FoxO1基因核心启动子位于-285/-27区域;3)预测并通过定点突变试验鉴定出MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5转录因子对FoxO1基因的转录活性具有关键调控作用。综上,本研究初步鉴定出牛FoxO1基因启动子核心区(-285/-27)内转录因子MEF2A、KLF4、HOXA5和KLF5对FoxO1基因有重要的转录调控作用,为FoxO1基因对牛肌肉脂肪发育过程中的转录调控机制奠定了一定理论基础。     

依普菌素搽背剂对牦牛寄生虫的驱除效果研究

为选择适应于高寒牧区放牧牦牛大群驱除体内外寄生虫的理想剂型,在青海玉树曲麻莱牦牛养殖户选取120头0.5、1.5岁牦牛随机分为3组,其中试验1组(50头)用依普菌素搽背剂按0.5mg/kg体重剂量经背部皮肤浇泼给药,试验2组(50头)用伊维菌素注射剂按0.2mg/kg体重剂量经皮下注射给药,试验3组为空白对照组。对三组各20头1.5岁牦牛给药前和给药后20d时消化道线虫虫卵进行粪检,同时对药物的安全性进行评价;翌年5月底对全部试验牛进行牛皮蝇蛆驱除效果检查。结果显示,试验1、2组消化道线虫虫卵转阴率分别为90%和85%;虫卵减少率分别为98.74%和98.77%;1、2组对牛颚虱杀虫率均达100%,对照组体内外寄生虫均无明显变化;两试验组牦牛皮蝇蛆病治愈率均为98%,而对照组的感染率为100%,平均感染强度为10.9(2~21)。依普菌素搽背剂对牦牛皮蝇幼虫的驱虫率达99.54%。结果表明,依普菌素搽背剂0.5mg/kg剂量安全,驱虫效果可信,可在高寒牧区牦牛体内外寄生虫驱虫工作中推广应用。     

湘西黄牛IGF–IR基因的群体遗传多态性及其 与生长性状的关联分析

为探讨湘西黄牛的分子遗传特征,寻找与湘西黄牛生长性状相关的分子标记,用PCR和基因测序技术检测了湘西黄牛IGF–IR基因部分序列的碱基突变,并采用PCR–RFLP方法进行了群体遗传多态性分析。结果表明:PCR扩增序列为616 bp,与预期结果相符,测序的序列中存在34个单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中1个SNP已有报道(g.551GT),33个SNPs为首次发现;g.551GT位点在湘西黄牛群体中存在A和B 2个等位基因,A为优势等位基因,检测到AA、AB和BB 3种基因型;该位点在湘西黄牛群体中呈中度多态,达到了Hardy–Weinberg平衡状态(P0.05);将湘西黄牛IGF–IR基因的多态性与其生长性状进行关联分析,结果表明,g.551GT位点对湘西黄牛的体高、体长、胸围和体重无显著影响(P0.05)。     

地方本科高校生物信息学课程教学改革与实践

在前期调研的基础上,综合多年教学经验,总结了生物信息学课程教学在地方本科高校中存在的主要问题,提出了地方本科高校生物信息学课程教学定位,并对课程内容、教学方法、考核方法进行了改革,有效提高了教学效果。     

奶牛PSME3基因CDS区克隆、表达及生物信息学分析

旨在探讨蛋白酶体激活亚基3(proteasome activator subunit 3,PSME3)基因的序列特征,及其在奶牛乳腺组织中的表达和功能。采用qPCR法检测PSME3基因在健康奶牛和大肠杆菌(Escherichia coli)诱导的乳腺炎奶牛的乳腺组织中的表达量;通过基因克隆与测序方法获得奶牛PSME3基因的编码区(CDS)全长序列,并利用生物信息学方法分析PSME3基因及其编码的蛋白质的结构与功能。结果表明,与健康奶牛相比,PSME3基因在E.coli诱导的乳腺炎奶牛乳腺组织中的表达显著上调;PSME3基因的CDS区全长为765 bp,编码1条由254个氨基酸组成的较稳定且无跨膜结构域的非分泌型蛋白质,含有PA28α和PA28β结构域,主要在细胞核中发挥作用。PSME3可通过核转位因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路参与调节乳腺细胞的质膜合成、细胞周期、增殖凋亡以及奶牛乳腺组织的免疫反应等多种生物学过程。     

波杂山羊金黄色葡萄球菌与巴氏杆菌的分离鉴定及疾病诊治

某山羊养殖场自繁自养的波杂山羊出现疫情,从临床病例的颈部水肿液、关节水肿液、心包积液、腹腔液、胸腔液中分离到9株细菌,经细菌形态学观察、鉴别培养、鉴定,共分离到细菌9株,其中金黄色葡萄球菌(Staphylococ-cus aureus)5株(55.5％)、巴氏杆菌(Pasteurella)4株(44.5％).分别对所有分离菌株进行18种药物的敏感性试验,结果表明:抗菌药头孢哌酮、卡那霉素、丁胺卡那霉素、氟哌酸对2种分离菌株均表现为高度敏感,敏感率高达100％;抗菌药头孢盂多、头孢噻吩、头孢氨苄、先锋霉素V、头孢拉定、青霉素G、氨苄青霉素、链霉素、庆大霉素、红霉素、四环素、环丙沙星、林可霉素、复方新诺明对分离菌株产生较高的耐药性.     

依靠职工办企业 再造一个新敦林

依靠职工办企业再造一个新敦林文／么长路赵乃民图／陈强坚持全心全意依靠职工办企业，充分调动职工的积极性，使企业发生了一年一变样，三年翻一番的深刻变化。１９９６年，完成工业总产值３．１８亿元，利税３５００万元，职工人均工资５２００元，实现了１９９３年底提...     

对采矿塌陷区进行生态修复的认识

<正>中国是世界第一产煤大国,煤炭在源源不断被开采,拉动地方经济增长的同时,也相应地带来许多环境灾难和社会问题,引发社会矛盾,直接影响区域经济的可持续发展。特别是占矿山总数59.6%的乡镇集体矿山,生态修复