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油菜株高QTL定位、整合和候选基因鉴定 总被引:1,自引:1,他引:0
【目的】通过对油菜株高进行多环境QTL定位并与已报道的油菜株高QTL和植物株高基因分别进行整合和比对分析,揭示油菜株高的遗传结构和候选基因并为其分子改良提供依据。【方法】以油菜优良品种中双11(测序)和No.73290(重测序)衍生的含184个单株的Bna ZNF2群体为试验材料。首先,对Bna ZNF2群体进行基因型分析,利用Joinmap 4.0软件构建了一张含803个分子标记的高密度遗传图谱。其次,对F2:3和F2:4家系进行连续两年(2010—2011)两点(武汉和西宁)田间试验和表型鉴定。然后,利用Bna ZNF2群体的基因型数据和F2:3以及F2:4家系的株高表型数据,采用Win QTLCart 2.5软件的复合区间作图法进行QTL检测。最后,利用元分析的方法采用Bio Mercator软件对不同环境中检测到的株高QTL进行整合。【结果】对两年两点环境下分别检测到的株高QTL进行整合总共得到5个株高QTL的位点:q PH.A2-1、q PH.A2-2、q PH.C2-1、q PH.C3-1和q PH.C3-2,分布于A2、C2和C3染色体上,解释2.6%—55.6%的表型方差。其中,q PH.A2-1和q PH.A2-2只在武汉检测到,而q PH.C2-1、q PH.C3-1和q PH.C3-2只在西宁检测到。位于C2连锁群的主效QTL-q PH.C2-1只在西宁被重复检测到,而且LOD值、加性效应和贡献率(分别为23.4、-16.0和55.6%)均高于前人报道,是目前发现的效应最大的一个油菜株高QTL。基于油菜基因组物理图谱对本研究和已报道的油菜株高QTL和植物株高基因分别进行整合和比对分析,获得了一个由183个QTL和287个候选基因组成的相对完整的油菜株高遗传结构图。其中,有18个株高QTL簇能在不同研究中被共同检测到,分布在A1、A2、A3、A6、A7、A9、C6和C7染色体上。另外,本研究定位到的5个油菜株高QTL的物理位置和已报道的油菜株高QTL均不重叠,因而是新的株高QTL位点。其中,q PH.A2-2、q PH.C3-1和q PH.C3-2物理区间内总共找到了15个株高同源基因,而11个在2个亲本中存在序列变异,被选作候选基因进行进一步研究。【结论】QTL定位和整合获得5个油菜株高QTL,均为首次报道而且都只在武汉或西宁被检测到。其中位于C2连锁群的主效QTL效应值超过以往报道,表现出极强的QTL与环境的互作。通过与已报道的油菜株高QTL和植物株高基因分别进行整合和比对分析,较为全面地揭示了油菜株高的遗传结构和候选基因,生物信息学分析还鉴定到11个位于本研究定位到的3个株高QTL区间内的候选基因。 相似文献
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湖北省优质大豆发展现状与思考 总被引:1,自引:0,他引:1
正"十二五"期间,湖北省大豆年均种植面积不足150万亩,单产150 kg左右,总产22万t,人均占有量3.5 kg,需从外省调进或进口大豆及其制品约400万t。近两年,本省大豆种植面积有所回升,2017年全省大豆种植面积212.34万亩,较"十二五"平均面积增加41%,单产141.56 kg,总产30.06万t。在发展大豆生产的同时,加快了优质大豆的开发利用,高蛋白(蛋白质含量高于45%)大豆、双高(含油量大于20%,蛋白+脂肪含量大于63%)大豆、鲜食大豆迅猛发展。2017年,本省种植高蛋白大豆152万亩,双高大豆30万亩,鲜食大豆30万亩。本省大豆种植面积虽然不是很大,但产区相对集中。 相似文献
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气象灾害是影响我国农作物产量及农业可持续发展的重要因素,低温冻害导致油菜生长发育迟缓和大幅度减产。便捷、精准地识别和评估油菜冻害不仅为精准农田管理提供依据而且对培育抗冻品种有重要意义。本研究借助低空无人机遥感技术,用大疆精灵无人机Phantom 4 Pro V2.0,搭载2000万像素RGB相机,对生长88天正处于越冬期的2052份油菜育种材料进行航拍。将拍摄后的图片经拼接、剪裁、评价、扩展后按8:2划分为训练集和验证集。然后将训练集图片分批输入自主建立的深度学习网络模型中提取冻害特征并优化网络模型,优化完成后用验证集图片对识别结果进行验证。结果表明深度学习网络模型对油菜是否发生冻害的整体识别精度达98.13%,Micro F1为98.13%、Macro F1为98.11%,Kappa系数为0.96,说明深度学习网络模型整体性能较好。本试验使用较低的成本实现了大规模油菜材料冻害情况快速、高效、准确的评估,弥补了传统调查方法的缺陷。同时本研究建立的成套油菜冻害鉴定方法可为后续抗冻性状机理研究及品种选育提供重要支撑,也可为其它类似冻害的逆境鉴定方法开发提供借鉴和参考。 相似文献
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本文通过对《中国健康与营养》和《中国统计年鉴》提供的数据进行分析,进一步对我国茶叶的消费现状和茶叶消费行为等多种影响因素进行了深入研究。结果表明,消费者所处的地理位置、城乡居住环境、所受教育程度、收入状况、性别差异、年龄阶段等因素都对茶叶的消费有明显影响,并且笔者根据其影响因素分析中得到启示,以期为我国茶叶产业的未来发展及消费提出了相关建议。 相似文献
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为探究甘蓝型油菜硼氮交互作用的增产效应及其生理机制,通过水培试验和大田小区试验相结合的手段,分析了硼氮交互效应对油菜生长、氮素吸收利用、氮代谢酶活性以及籽粒产量的影响.结果表明:在苗期,硼缺乏显著抑制了不同氮供应水平下油菜根系生长发育;与低氮或低硼处理相比,硼氮平衡供给显著提高了氮素吸收及其相关基因的表达水平,改善了氮... 相似文献