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101.
Chlorate resistance is one of the reliable characters in Indica/Japonica classification. To understand the genetic basis of chlorate resistance is very important for revealing the evolutionary mechanism of Indica/Japonica differentiation. In this study, a doubled haploid (DH) population derived from anther culture of ZYQ8/JX17, a typical Indica and Japonica hybrid, was used as the genetic material to investigate chlorate sensitivity of the parents and DH lines. The quantitative trait loci (QTLs) of chlorate resistance were analyzed based on the molecular linkage map of this population. Total of 3 QTLs (qCHR-2, qCHR-8 and qCHR-10) for chlorate resistance were detected on chromosomes 2, 8 and 10, respectively. A QTL × QTL epistatic interaction was detected between qCHR-2 and qCHR-10. Genes involved in nitrogen assimilation, such as nitrate reduction, molybdenum cofactor biosynthesis and nitrate transport were strong candidates of QTLs for chlorate resistance. A putative nitrate reductase gene (8611.t00011), and two putative nitrate reductase genes (9319.t00010 and 9319.t00012) were in the genomic region of qCHR-2, and qCHR-8, respectively, and a putative nitrate transporter gene (756.t00011) was in the region of qCHR-10. The expression of 8611.t00011, 9319.t00010 and 756.t00011 were confirmed by the corresponding cDNAs, and 2 in/del and 12 SNPs in the coding regions of these three genes were found between Indica (cv. 9311) and Japonica (cv. Nipponbare) in silico. These results indicated that these three genes were candidates of the chlorate resistance QTLs. An in/del in the coding region of 8611.t00011 was used to develop a new PCR marker. A polymorphism was detected between JX17/Nipponbare and ZYQ8/9311. This polymorphism corresponds to the chlorate sensitivity of Nipponbare and 9311. This marker was located between Y8007R and RM250 on chromosome 2 in the DH population, where qCHR-2 was also located.  相似文献   
102.
W. D. Bovill    W. Ma    K. Ritter    B. C. Y. Collard    M. Davis    G. B. Wildermuth    M. W. Sutherland 《Plant Breeding》2006,125(6):538-543
Crown rot (causal agent Fusarium pseudograminearum) is a fungal disease of major significance to wheat cultivation in Australia. A doubled haploid wheat population was produced from a cross between line ‘W21MMT70’, which displays partial seedling and adult plant (field) resistance to crown rot, and ‘Mendos’, which is moderately susceptible in seedling tests but partially resistant in field trials. Bulked segregant analysis (BSA) based on seedling trial data did not reveal markers for crown rot resistance. A framework map was produced consisting of 128 microsatellite markers, four phenotypic markers, and one sequence tagged site marker. To this map 331 previously screened AFLP markers were then added. Three quantitative trait loci (QTL) were identified with composite interval mapping across all of the three seedling trials conducted. These QTL are located on chromosomes 2B, 2D and 5D. The 2D and 5D QTL are inherited from the line ‘W21MMT70’, whereas the 2B QTL is inherited from ‘Mendos’. These loci are different from those associated with crown rot resistance in other wheat populations that have been examined, and may represent an opportunity for pyramiding QTL to provide more durable resistance to crown rot.  相似文献   
103.
Three double low (erucic acid and glucosinolates) self-incompatible lines and 22 varieties from different origins were selected to produce 66 hybrids according to a NC II mating design. Field experiments for identification of hybrid performance and heterosis were conducted in two successive rapeseed growing seasons in Wuhan, China. After heterosis identifications, SI-1300 and Eagle were chosen to construct an F2 segregating population. One hundred and eighty four F2:3 lines were planted at Wuhan and Jingmen to test yield traits. F2 plants and the 25 parents were analyzed using simultaneously AFLP (amplified fragment length polymorphism) and SSR (simple sequence repeat) markers. A total of 270 and 718 polymorphic loci were detected in the F2 population and among the 25 parental lines, respectively. Of the 718 polymorphic loci, 178 were significantly correlated to yield traits. With the use of one-way ANOVA, 84 common QTLs were detected for 12 traits at two trial locations. Although the genetic distances based on general/specific heterozygosities and single-locus QTLs showed significant correlations with hybrid performance and heterosis for some yield traits, the determination coefficients were low. The results suggested that neither heterozygosities nor QTLs for yield traits were suitable to predict hybrid performance and heterosis in Brassica napus.  相似文献   
104.
利用相同来源F2:3和BC2S1群体定位玉米生育期QTL   总被引:1,自引:0,他引:1  
以普通玉米自交系丹232和爆裂玉米自交系N04为亲本构建259个F2:3和220个BC2S1家系群体,利用SSR标记构建分子标记遗传图谱,利用复合区间作图方法对4个生育期性状进行QTL定位和效应分析。利用F2:3群体共检测到4个抽雄期QTL、6个吐丝期QTL和3个散粉期QTL。单个QTL可解释的表型变异为6.7%~18.4%,可解释的表型总变异为28.9%~50.3%,11个QTL的增效基因来自生育期较长的亲本丹232,其余2个QTL的增效基因来自生育期较短的亲本N04;BC2S1群体检测到8个与4个生育期性状相关的QTL,单个QTL可解释的表型变异为4.5%~11.6%,可解释的表型总变异为13.2%~18.5%,增效基因来自两个亲本的QTL为3个和5个。两类群体检测出QTL的数目、位置、效应和贡献率均存在较大差异,主要原因在于BC2S1群体抽样选择所引起的群体结构差异,F2:3群体显示出较高的QTL检测能力,但回交育种过程中应慎重依据F2:3群体QTL定位结果进行标记辅助选择(MAS)。  相似文献   
105.
株高是典型的数量性状,易受遗传背景和环境等因素的影响。单片段代换系和双片段聚合系减少了个体间遗传背景的干扰,是鉴定QTL和研究QTL上位性的新型遗传材料。本研究采用随机区组试验设计方法以初级单片段代换系间杂交衍生的16个次级单片段代换系和15个双片段聚合系分析了株高及其构成因素QTL的加性效应及加性×加性上位性效应。共鉴定出11个QTL,其中3个株高QTL,1个倒1节间长QTL,2个倒2节间长QTL,2个倒3节间长QTL和3个倒4节间长QTL,分布于第4、6和10染色体上。鉴定出23对双基因互作,其中7对为没有显著效应的座位间互作,16对为有显著效应的QTL与没有显著效应的座位间互作。结果表明,QTL加性效应和QTL间的上位性效应都是株高及构成因素的重要遗传组成。通过单片段代换系杂交衍生的次级单片段代换系和双片段聚合系可提高QTL鉴定和上位性分析的灵敏度。  相似文献   
106.
小麦籽粒产量及穗部相关性状的QTL定位   总被引:5,自引:7,他引:5  
由小麦品种花培3号和豫麦57杂交获得DH群体168个株系,种植于3个环境中,利用305个SSR标记对籽粒产量和穗部相关性状(穗长、穗粒数、总小穗数、可育小穗数、小穗着生密度、千粒重和粒径)进行了QTL定位。利用基于混合线性模型的QTLNetwork 2.0软件,共检测到27个加性效应和13对上位效应位点,其中 8个加性效应位点具有环境互作效应。相关性高的性状间有一些共同的QTL位点,表现出一因多效或紧密连锁效应。5D染色体区段Xwmc215–Xgdm63,检测到控制籽粒产量、穗粒数、总小穗数、可育小穗数和小穗着生密度5个性状的QTL位点,各位点的遗传贡献率较大且遗传效应方向相同,增效等位基因均来源于豫麦57,适用于分子标记辅助育种和聚合育种。控制千粒重与穗粒数的QTL位于染色体不同区段,有利于实现穗粒数与粒重的遗传重组。  相似文献   
107.
抗水稻纹枯病qSB-9^Tq基因效应及作用方式分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
水稻第9染色体上存在1个抗纹枯病QTL,被命名为qSB-9,水稻品种特青在该QTL上携带抗性等位基因qSB-9Tq,而Lemont携带相对感病等位基因qSB-9Le.为精确地评价qSB-9Tq的抗病效应,分析其作用方式,利用分子标记进行前景选择和背景选择,从轮回亲本Lemont与特青回交后代群体中筛选到1个目标单株.连续3年对该单株的扩繁后代(BC6F2)及随后获得的近等基因系采用嵌入法进行接种鉴定试验.田间试验采取2种不同的设计.第一种是完全随机试验,即从BC6F2分离群体中筛选出目标区间为qSB-9TqTq纯合型、qSB-9LeLe纯合型和qSB-9TqLe杂合型个体,并对3种基因型个体间的病级平均数差异进行统计分析.第二种设计为随机区组设计,即在BC6F3和BC6F4代,分别对上述3种基因型的近等基因系群体,按3次重复的随机区组设计进行移栽和接种鉴定试验.结果表明,3年的试验结果表现出一致的趋势,即qSB-9Tq存在于分子标记RM242~Y92.5之间,可减轻病级1.0级(O~9级病情分级系统)左右,且其抗性表现为几乎完全的显性特征.本研究的结果为qSB-9Tq的精细定位和育种利用奠定了基础.  相似文献   
108.
利用Mudgo/武育粳3号F2群体分析水稻抗灰飞虱QTL   总被引:1,自引:0,他引:1  
灰飞虱是我国水稻生产上的重要害虫。Mudgo是一个高抗灰飞虱的籼稻品种,对灰飞虱具有强的排驱性和抗生性抗性。利用Mudgo/武育粳3号F2群体,构建了含有177个单株的F2群体的遗传连锁图谱。该连锁图包含104个SSR标记和3个Indel标记,覆盖整个水稻基因组1 409.9 cM,每两个标记之间的平均距离为13.2 cM。采用改进的苗期集团筛选法对177个F2:3家系进行了抗性鉴定,通过Windows QTL Cartographer 2.5进行复合区间作图分析,在第2、3、12染色体上分别检测到抗灰飞虱QTL Qsbph2b、Qsbph3d和Qsbph12a,分别位于标记RM5791~RM29、RM3199~RM5442和I12-17~RM333 1之间,单个LOD值分别为3.25、3.11和6.82,贡献率分别为17.3%、15.6%和35.8%,各QTL增强抗性等位基因效应均来自Mudgo。其中Qsbph12a与标记RM3331和I12-17紧密连锁。结合表型鉴定的结果,Qsbph12a应为抗灰飞虱主效QTL,与该位点紧密连锁的标记可用于抗灰飞虱快速选择辅助育种。  相似文献   
109.
水稻染色体片段代换系对氮、磷胁迫反应差异及其QTL分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
利用来源于9311(籼稻)与日本晴(粳稻)杂交后代衍生的遗传背景为9311的染色体片段代换系群体,分析其在大田正常、低氮和低磷条件下的单株有效穗和单株产量的差异。结果表明,低磷、低氮胁迫对单株有效穗和单株产量影响较大。代换系对低磷和低氮的反应存在明显差异。在低氮(磷)水平下共检测到26个单株有效穗和单株产量片段或QTL,以及12个相对单株有效穗和相对单株产量QTL。源于日本晴的等位基因均呈减效作用。低磷和低氮下共同检测到5个导入片段影响单株有效穗或单株产量。而大部分(约81%)QTL只在单胁迫处理下被检测到。表明水稻对磷胁迫和氮胁迫的反应既存在不同的遗传基础,也存在共同的遗传机制。  相似文献   
110.
水稻千粒重和垩白粒率的QTL及其互作分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
产量因子千粒重和稻米品质指标垩白粒率密切相关。本研究以越光/Kasalath//越光BIL群体为材料,分析千粒重和垩白粒率的相关性、QTL、上位性互作及其环境的互作效应。相关分析表明,群体千粒重和垩白粒率在2005年和2006年均呈极显著正相关,相关系数分别为0.42和0.35 (P<0.001)。2年共检测到千粒重QTL 11个,其中5个在2年重复检测到,5个具有环境互作效应;千粒重上位性互作8对,7对与环境存在互作。垩白粒率QTL 6个,3个具有环境互作效应;上位性互作9对,其中4对具有上位性环境互作效应。比较分析发现3个主效QTL同时控制千粒重和垩白粒率的表现,千粒重和垩白粒率的增效等位基因来自同一亲本;1对上位性互作同时对千粒重和垩白粒率有相同的影响。一些与垩白粒率不相关的千粒重主效QTL,如qTGW-3c、qTGW-4a和qTGW-6b,可为育种所利用。对利用QTL定位结果进行千粒重和垩白粒率分子辅助选择育种进行了探讨。  相似文献   
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