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61.
B. Wang C. L. Brubaker W. Tate M. J. Woods B. A. Matheson J. J. Burdon 《Plant pathology》2006,55(6):746-755
Genetic variation among 348 isolates of Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum (Fov) collected from diseased cotton plants in 31 fields in six cotton-growing regions in New South Wales and Queensland in 2002 and 2004 was analysed using amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). Twenty-eight haplotypes were identified based on 146 polymorphic bands generated with four Eco RI and Mse I and four Hind III and Mse I primer combinations. The haplotypes separated into two distinct groups (37% similarity), with 21 in group I and seven in group II. The two unique vegetative compatibility groups of Fov known to occur in Australia (VCG 01111 and VCG 01112) were correlated to the two AFLP groups, with both VCG 01111 reference isolates being included in group I and both VCG 01112 reference isolates in group II. Group I was widespread, occurring in all regions sampled and all but one of the fields, while group II was limited to three fields in the Boggabilla region. Group I was further divided into two subgroups. The two haplotypes in subgroup I-B (I-20 and I-21) may represent the emergence of a new form of Fov based on their marked genetic discrimination from the subgroup I-A haplotypes. No spatial population differentiation was discernible at the national level, as only 3·9% of total genetic variation was attributed to differences among regions ( P = 0·4868). When each region was analysed separately, clear differentiation was found in the Boggabilla region, with 86·3% of total genetic variation resulting from differences among fields ( P < 0·0001). 相似文献
62.
半番鸭羽色性状AFLP标记初步研究 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究初步利用AFLP标记对半番鸭及其母本-北京鸭进行检测。结果显示,AFLP标记扩增带丰富,10对引物组合共检测到2046条扩增带,平均每对引物组合/每个池DNA可产生60.15条。半番鸭白羽性状特有的扩增带共有15条,分布在E AAC/M CTA、E AAC/M CTT、E AAG/M CAG、E ACA/M CTC、E ACT/M CTA和E ACT/M CTC等6对引物组合上,为半番鸭个体羽色与AFLP标记相关分析和验证提供了素材。 相似文献
63.
潍坊萝卜中芜菁花叶病毒分离物的分子特性及CP基因的表达 总被引:1,自引:0,他引:1
从表现红心病的潍坊萝卜块根上得到一芜菁花叶病毒( Turnip m osaic virus, TuMV) 分离物(TuMV-Ra) , 通过RT-PCR获得了该分离物的外壳蛋白(CP) 基因, 对其进行了序列测定, 并将其核苷酸序列及推导出的氨基酸序列与GenBank中登录的其它20个TuMV萝卜分离物的相应序列进行比较和分析。结果表明, TuMV-Ra与这20个分离物CP基因核苷酸序列的同源性为89.9% ~99.0% , CP氨基酸序列同源性为94.8%~99.7%; 其中与中国浙江杭州萝卜的两个分离物HZLB1、HZLB2同源性最高, 核苷酸序列的同源性为98.7%和99.0% , 氨基酸序列同源性为99.0%和99.7%。TuMV-Ra与1999年从表现相同症状的潍坊萝卜得到的分离物CHINA-WF CP基因核苷酸同源性为93.66% , 氨基酸同源性为96.53% , 说明病毒发生了比较大的变异, 而且变异的位点主要在CP的N末端。将TuMV-Ra CP基因克隆到原核表达载体pET-22b ( + ) , 在大肠杆菌BL21 (DE3) 中表达出分子量为38 kD的融合蛋白。Western blotting分析证明TuMV-Ra CP在大肠杆菌中得到了正确表达。 相似文献
64.
65.
变叶海棠遗传多样性的AFLP分析 总被引:6,自引:2,他引:6
用8对引物对变叶海棠30个不同的变异类型进行了AFLP分析, 共扩增出656条带, 其中多态性带为568条, 平均每对引物扩增出71条多态性带, 多态性带百分率为86.59% , 各变异类型多态性比例介于0.3582~0.6296之间; 依据简单匹配系数对AFLP扩增结果进行UPGMA聚类, 30个变异类型在0.68水平上分为12个类群; 该试验从DNA水平上探明了变叶海棠的遗传多样性是变叶海棠与陇东海棠和花叶海棠产生渗入杂交形成的。 相似文献
66.
桃果肉颜色、果皮茸毛和花粉育性性状的分子标记 总被引:18,自引:2,他引:18
以91-42-51 ×瑞光2号的杂交后代共48个单株为试材, 采用集群分离分析法(BSA) , 对桃果实的有毛/无毛、白肉/黄肉以及无花粉/有花粉3 个性状进行了分子标记研究。研究获得SSR 标记UDP96-018 (300 bp) 与有毛性状连锁, 遗传距离4.5 cM, SSR标记UDP98-407 (680 bp) 与白肉性状连锁, 遗传距离为2.2 cM; 根据拟南芥雄性不育序列标记设计的引物扩增出的两个片段NNJ-I (600 bp ) 和NNJ-I (900 bp) 与桃无花粉性状之间的遗传距离为0 cM。这些标记的获得为桃分子标记辅助育种提供了有效的筛选手段。 相似文献
67.
采用AFLP技术分析稻曲病菌的遗传多样性Ⅰ:同一块稻田中稻曲病菌的遗传结构 总被引:7,自引:1,他引:7
采用AFLP (Amplified fragment length polymorphism)技术分析了来自北京昌平同一块稻田中不同水稻品种和育种中间材料上稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性。从256对EcoRⅠ和MseⅠ引物中选择30对扩增40个菌株。结果表明,同一块稻田中稻曲病菌菌株间的相似性系数达0.72以上,来自同一小区的多数菌株能聚成亚类;发现从同一水稻品种分离的菌株没有特异性的AFLP谱带。初步推断稻曲病菌与水稻品种不存在明显的专化性互作。 相似文献
68.
菠萝DNA的提取及AFLP反应体系的建立 总被引:12,自引:2,他引:12
为了应用AFLP分子标记对菠萝种资源进行种质鉴定、分类及亲缘关系等方面的研究,最重要的是要获得高质量的DNA,菠萝叶片革质化程度较高,且纤维、多糖、多酚等次生代谢物质含量较多,严重干扰DNA的抽提或影响其后的AFLP双酶切及其扩增反应,本研究以菠萝叶片为材料,利用改良CTAB法得到了39个高质量的菠萝分类群的DNA基因组,并进行了AFLP分析,得到了条带清晰、多态性好的菠萝品种指纹图谱,这为菠萝基因库的建立、优良品种选育以及亲缘关系的系列研究提供理论依据。 相似文献
69.
70.